Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G207633.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6Z0
Pfam -
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g08900.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G186200 patatin, putative, expressed -
2 Sobic.010G223800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G056300 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed -
4 Sobic.009G048201 - K09287: RAV-like factor
5 Sobic.010G246300 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.003G414900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G183700 transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G228250 - -
9 Sobic.003G299100 expressed protein -
10 Sobic.005G207300 OsSCP29 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09645: vitellogenic carboxypeptidase-like protein
11 Sobic.002G012400 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G007100 expressed protein -
13 Sobic.002G154900 cytochrome P450, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
14 Sobic.002G266700 - -
15 Sobic.002G191450 - -
16 Sobic.008G102466 - -
17 Sobic.002G124832 - -
18 Sobic.001G064400 expressed protein -
19 Sobic.002G114200 GAGA-binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G089500 seven in absentia protein family protein, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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