Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G414900.1
Synonym Sb03g044890
Functional annotation DUF567 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XH26
Pfam PF04525
Panther DB PTHR31087 PTHR31087:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14260 : Protein of unknown function (DUF567)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g70590.1 : DUF567 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026164 , Zm00025a039206
Brachypodium KQK11369
Barley HORVU3Hr1G097470.1 , HORVU3Hr1G097400.7 , HORVU3Hr1G097400.6 , HORVU3Hr1G097390.1 , HORVU3Hr1G097510.1 , HORVU3Hr1G097460.1 , HORVU3Hr1G097270.1 , HORVU3Hr1G097400.1 , HORVU3Hr1G097400.3 , HORVU3Hr1G097400.2 , HORVU3Hr1G097400.5 , HORVU3Hr1G097400.4 , HORVU3Hr1G097260.1
Wheat TraesCS3B02G487100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G265150 - -
2 Sobic.002G012400 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G266400 - -
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8 Sobic.005G002700 sorgoleone-producing in root hair(PubmedID : 15361534)@fatty acid desaturase, putative, expressed K10257: FAD3, FAD7, FAD8, acyl-lipid omega-3 desaturase
9 Sobic.008G158600 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.002G012300 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
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19 Sobic.004G349237 - -
20 Sobic.001G162233 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G414900 Sobic003G414900 Sobic003G265150 Sobic003G265150 Sobic003G414900--Sobic003G265150 Sobic002G012400 Sobic002G012400 Sobic003G414900--Sobic002G012400 Sobic002G266400 Sobic002G266400 Sobic003G414900--Sobic002G266400 Sobic003G414800 Sobic003G414800 Sobic003G414900--Sobic003G414800 Sobic006G062433 Sobic006G062433 Sobic003G414900--Sobic006G062433 Sobic010G229500 Sobic010G229500 Sobic003G414900--Sobic010G229500 Sobic002G361600 Sobic002G361600 Sobic003G414900--Sobic002G361600 Sobic005G002700 Sobic005G002700 Sobic003G414900--Sobic005G002700 Sobic008G158600 Sobic008G158600 Sobic003G414900--Sobic008G158600 Sobic004G349237 Sobic004G349237 Sobic003G265150--Sobic004G349237 Sobic003G265150--Sobic002G361600 Sobic003G265150--Sobic003G414900 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic003G265150--Sobic006G138966 Sobic002G421501 Sobic002G421501 Sobic003G265150--Sobic002G421501 Sobic001G512633 Sobic001G512633 Sobic003G265150--Sobic001G512633 Sobic002G372900 Sobic002G372900 Sobic003G265150--Sobic002G372900 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic003G265150--Sobic002G185400 Sobic004G034100 Sobic004G034100 Sobic003G265150--Sobic004G034100 Sobic005G086600 Sobic005G086600 Sobic002G012400--Sobic005G086600 Sobic006G008000 Sobic006G008000 Sobic002G012400--Sobic006G008000 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic002G012400--Sobic002G012300 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic002G012400--Sobic002G012500 Sobic008G066200 Sobic008G066200 Sobic002G012400--Sobic008G066200 Sobic003G079200 Sobic003G079200 Sobic002G012400--Sobic003G079200 Sobic002G012400--Sobic003G414800 Sobic001G259400 Sobic001G259400 Sobic002G012400--Sobic001G259400 Sobic001G188800 Sobic001G188800 Sobic002G012400--Sobic001G188800 Sobic002G266400--Sobic002G012400 Sobic002G348500 Sobic002G348500 Sobic002G266400--Sobic002G348500 Sobic005G186200 Sobic005G186200 Sobic002G266400--Sobic005G186200 Sobic004G332500 Sobic004G332500 Sobic002G266400--Sobic004G332500 Sobic002G266400--Sobic003G414800 Sobic002G266400--Sobic003G414900 Sobic006G097000 Sobic006G097000 Sobic002G266400--Sobic006G097000 Sobic003G364500 Sobic003G364500 Sobic002G266400--Sobic003G364500 Sobic001G100600 Sobic001G100600 Sobic002G266400--Sobic001G100600 Sobic002G351300 Sobic002G351300 Sobic003G414800--Sobic002G351300 Sobic001G330300 Sobic001G330300 Sobic003G414800--Sobic001G330300 Sobic004G141100 Sobic004G141100 Sobic003G414800--Sobic004G141100 Sobic007G058400 Sobic007G058400 Sobic003G414800--Sobic007G058400 Sobic009G188000 Sobic009G188000 Sobic003G414800--Sobic009G188000 Sobic004G216300 Sobic004G216300 Sobic003G414800--Sobic004G216300 Sobic003G414800--Sobic005G086600 Sobic007G017500 Sobic007G017500 Sobic003G414800--Sobic007G017500 Sobic006G217100 Sobic006G217100 Sobic003G414800--Sobic006G217100 Sobic002G383050 Sobic002G383050 Sobic006G062433--Sobic002G383050 Sobic006G062433--Sobic010G229500 Sobic006G062433--Sobic002G012400 Sobic006G062433--Sobic003G414900 Sobic006G062433--Sobic003G265150 Sobic008G158732 Sobic008G158732 Sobic006G062433--Sobic008G158732 Sobic001G052500 Sobic001G052500 Sobic006G062433--Sobic001G052500 Sobic006G062433--Sobic002G348500 Sobic006G062433--Sobic005G002700 Sobic007G122800 Sobic007G122800 Sobic010G229500--Sobic007G122800 Sobic006G007900 Sobic006G007900 Sobic010G229500--Sobic006G007900 Sobic004G064500 Sobic004G064500 Sobic010G229500--Sobic004G064500 Sobic010G229500--Sobic001G259400 Sobic002G358300 Sobic002G358300 Sobic010G229500--Sobic002G358300 Sobic010G229500--Sobic008G158732 Sobic003G268600 Sobic003G268600 Sobic010G229500--Sobic003G268600 Sobic010G229500--Sobic005G086600 Sobic009G032000 Sobic009G032000 Sobic010G229500--Sobic009G032000 Sobic002G361600--Sobic004G349237 Sobic002G361600--Sobic003G265150 Sobic002G361600--Sobic002G421501 Sobic002G361600--Sobic003G414900 Sobic001G097800 Sobic001G097800 Sobic002G361600--Sobic001G097800 Sobic002G361600--Sobic004G034100 Sobic002G311300 Sobic002G311300 Sobic002G361600--Sobic002G311300 Sobic002G242100 Sobic002G242100 Sobic002G361600--Sobic002G242100 Sobic006G130700 Sobic006G130700 Sobic002G361600--Sobic006G130700 Sobic005G002700--Sobic002G012500 Sobic001G487600 Sobic001G487600 Sobic005G002700--Sobic001G487600 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic005G002700--Sobic008G022000 Sobic005G002700--Sobic002G012400 Sobic009G171500 Sobic009G171500 Sobic005G002700--Sobic009G171500 Sobic006G096000 Sobic006G096000 Sobic005G002700--Sobic006G096000 Sobic003G426600 Sobic003G426600 Sobic005G002700--Sobic003G426600 Sobic008G036800 Sobic008G036800 Sobic005G002700--Sobic008G036800 Sobic001G280800 Sobic001G280800 Sobic005G002700--Sobic001G280800 Sobic008G158600--Sobic002G012300 Sobic008G158600--Sobic003G079200 Sobic008G158501 Sobic008G158501 Sobic008G158600--Sobic008G158501 Sobic008G158600--Sobic002G012500 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic008G158600--Sobic002G063800 Sobic008G158600--Sobic008G022000 Sobic008G158600--Sobic008G036800 Sobic008G158600--Sobic006G008000 Sobic008G158600--Sobic001G259400
Octagon: transcription factors


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