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Transcriptome id Sobic.001G227850.1
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Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6W8
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G191400 expressed protein -
2 Sobic.003G319400 receptor protein kinase, putative, expressed -
3 Sobic.001G299100 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
4 Sobic.010G031700 thaumatin, putative, expressed -
5 Sobic.005G202300 integral membrane protein TIGR01569 containing protein, expressed -
6 Sobic.006G003100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G135300 expressed protein -
8 Sobic.010G152400 glycosyltransferase, putative, expressed -
9 Sobic.010G097200 expressed protein -
10 Sobic.004G029400 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
11 Sobic.003G322100 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
12 Sobic.003G000100 STIGL1 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, expressed -
13 Sobic.003G053200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
14 Sobic.004G306900 amino acid transporter, putative, expressed -
15 Sobic.009G181600 indole-3-acetate beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
16 Sobic.006G092700 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
17 Sobic.010G082000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
18 Sobic.009G199001 - -
19 Sobic.004G121800 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.004G121600 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G227850 Sobic001G227850 Sobic008G191400 Sobic008G191400 Sobic001G227850--Sobic008G191400 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic001G227850--Sobic003G319400 Sobic001G299100 Sobic001G299100 Sobic001G227850--Sobic001G299100 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic001G227850--Sobic010G031700 Sobic005G202300 Sobic005G202300 Sobic001G227850--Sobic005G202300 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic001G227850--Sobic006G003100 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic001G227850--Sobic006G135300 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic001G227850--Sobic010G152400 Sobic010G097200 Sobic010G097200 Sobic001G227850--Sobic010G097200 Sobic008G191400--Sobic001G299100 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic008G191400--Sobic006G092700 Sobic008G191400--Sobic003G319400 Sobic008G191400--Sobic006G135300 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic008G191400--Sobic007G100700 Sobic003G426500 Sobic003G426500 Sobic008G191400--Sobic003G426500 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic008G191400--Sobic004G306900 Sobic009G181600 Sobic009G181600 Sobic008G191400--Sobic009G181600 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G191400--Sobic010G082000 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic003G319400--Sobic006G106900 Sobic003G319400--Sobic005G202300 Sobic003G319400--Sobic004G306900 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic003G319400--Sobic001G438200 Sobic003G319400--Sobic009G181600 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic003G319400--Sobic007G086300 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic003G319400--Sobic003G282200 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic003G319400--Sobic003G064800 Sobic003G280000 Sobic003G280000 Sobic003G319400--Sobic003G280000 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic001G299100--Sobic004G106100 Sobic001G299100--Sobic006G092700 Sobic001G299100--Sobic003G319400 Sobic001G299100--Sobic010G152400 Sobic001G299100--Sobic010G082000 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic001G299100--Sobic003G000100 Sobic001G299100--Sobic008G191400 Sobic001G299100--Sobic004G306900 Sobic001G299100--Sobic007G086300 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic010G031700--Sobic003G053200 Sobic007G037600 Sobic007G037600 Sobic010G031700--Sobic007G037600 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic010G031700--Sobic003G441800 Sobic010G031700--Sobic004G106100 Sobic004G029400 Sobic004G029400 Sobic010G031700--Sobic004G029400 Sobic010G031700--Sobic006G003100 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic010G031700--Sobic006G205700 Sobic002G233200 Sobic002G233200 Sobic010G031700--Sobic002G233200 Sobic003G353200 Sobic003G353200 Sobic010G031700--Sobic003G353200 Sobic005G202300--Sobic006G106900 Sobic005G202300--Sobic003G319400 Sobic005G202300--Sobic003G280000 Sobic005G202300--Sobic009G181600 Sobic005G202300--Sobic003G053200 Sobic005G202300--Sobic010G031700 Sobic005G202300--Sobic003G353200 Sobic005G202300--Sobic004G029400 Sobic001G058300 Sobic001G058300 Sobic005G202300--Sobic001G058300 Sobic006G003100--Sobic003G000100 Sobic006G003100--Sobic010G152400 Sobic006G003100--Sobic010G031700 Sobic006G003100--Sobic004G106100 Sobic006G003100--Sobic007G086300 Sobic006G003100--Sobic002G233200 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic006G003100--Sobic004G322100 Sobic006G003100--Sobic004G306900 Sobic007G158800 Sobic007G158800 Sobic006G003100--Sobic007G158800 Sobic006G135300--Sobic006G092700 Sobic006G135300--Sobic010G082000 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic006G135300--Sobic007G073000 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic006G135300--Sobic010G028100 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic006G135300--Sobic006G019700 Sobic006G135300--Sobic010G152400 Sobic003G322100 Sobic003G322100 Sobic006G135300--Sobic003G322100 Sobic006G135300--Sobic004G306900 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic006G135300--Sobic002G146000 Sobic010G152400--Sobic003G000100 Sobic010G152400--Sobic004G322100 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic010G152400--Sobic003G240400 Sobic010G152400--Sobic004G306900 Sobic010G152400--Sobic006G092700 Sobic010G152400--Sobic010G082000 Sobic010G152400--Sobic006G003100 Sobic010G152400--Sobic004G106100 Sobic010G152400--Sobic006G019700 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic010G097200--Sobic003G167300 Sobic010G097200--Sobic006G205700 Sobic008G037900 Sobic008G037900 Sobic010G097200--Sobic008G037900 Sobic010G097200--Sobic007G037600 Sobic005G033000 Sobic005G033000 Sobic010G097200--Sobic005G033000 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic010G097200--Sobic009G065700 Sobic010G097200--Sobic003G441800 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic010G097200--Sobic004G119800 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic010G097200--Sobic004G014600
Octagon: transcription factors


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