Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G281201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S884
Pfam -
Panther DB PTHR12136 PTHR12136:SF47
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19040 : ENHANCED DISEASE RESISTANCE 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31770.1 : START domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018092
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G200300 oligopeptide transporter, putative, expressed -
2 Sobic.004G217100 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G307400 MATH domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G161000 Interacting factor of CBLs(PubMedID : 19860013)@CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.26 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07198: PRKAA, 5'-AMP-activated protein kinase, catalytic alpha subunit
5 Sobic.006G171600 ZOS4-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.003G351200 B4-BTB1 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with B4 subfamily conserved sequence, expressed -
7 Sobic.001G518900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G144701 - -
9 Sobic.004G250800 pre-mRNA-processing factor 31, putative, expressed K12844: U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein PRP31
10 Sobic.006G039500 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
11 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
12 Sobic.001G364300 - -
13 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
14 Sobic.004G349450 - -
15 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
16 Sobic.002G364700 ZOS7-11 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
18 Sobic.003G018000 expressed protein -
19 Sobic.002G382300 expressed protein -
20 Sobic.008G071800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G281201 Sobic001G281201 Sobic006G200300 Sobic006G200300 Sobic001G281201--Sobic006G200300 Sobic004G217100 Sobic004G217100 Sobic001G281201--Sobic004G217100 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic001G281201--Sobic002G307400 Sobic010G161000 Sobic010G161000 Sobic001G281201--Sobic010G161000 Sobic006G171600 Sobic006G171600 Sobic001G281201--Sobic006G171600 Sobic003G351200 Sobic003G351200 Sobic001G281201--Sobic003G351200 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic001G281201--Sobic001G518900 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic001G281201--Sobic008G144701 Sobic004G250800 Sobic004G250800 Sobic001G281201--Sobic004G250800 Sobic006G200300--Sobic002G307400 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic006G200300--Sobic001G364300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic006G200300--Sobic008G088500 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic006G200300--Sobic005G058200 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic006G200300--Sobic010G196700 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic006G200300--Sobic008G168500 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic006G200300--Sobic005G007200 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic006G200300--Sobic007G082300 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic006G200300--Sobic004G086900 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic004G217100--Sobic006G224400 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic004G217100--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic004G217100--Sobic007G167950 Sobic004G217100--Sobic004G086900 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic004G217100--Sobic007G110800 Sobic004G217100--Sobic007G082300 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic004G217100--Sobic005G058300 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic004G217100--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G217100--Sobic010G123800 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic002G307400--Sobic005G221675 Sobic002G307400--Sobic007G081800 Sobic002G307400--Sobic006G200300 Sobic002G307400--Sobic005G058300 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G307400--Sobic004G100300 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G307400--Sobic003G191200 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G307400--Sobic002G384900 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic002G307400--Sobic007G198900 Sobic002G307400--Sobic006G224400 Sobic010G161000--Sobic004G217100 Sobic010G161000--Sobic003G351200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic010G161000--Sobic003G441000 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic010G161000--Sobic005G144000 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic010G161000--Sobic001G039100 Sobic002G382300 Sobic002G382300 Sobic010G161000--Sobic002G382300 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic010G161000--Sobic006G070564 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic010G161000--Sobic002G404600 Sobic004G318900 Sobic004G318900 Sobic010G161000--Sobic004G318900 Sobic006G115700 Sobic006G115700 Sobic006G171600--Sobic006G115700 Sobic010G142650 Sobic010G142650 Sobic006G171600--Sobic010G142650 Sobic009G242200 Sobic009G242200 Sobic006G171600--Sobic009G242200 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic006G171600--Sobic004G290600 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic006G171600--Sobic006G204500 Sobic010G003200 Sobic010G003200 Sobic006G171600--Sobic010G003200 Sobic003G297100 Sobic003G297100 Sobic006G171600--Sobic003G297100 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic006G171600--Sobic002G340600 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic006G171600--Sobic002G364700 Sobic009G090566 Sobic009G090566 Sobic003G351200--Sobic009G090566 Sobic003G351200--Sobic003G441000 Sobic003G351200--Sobic010G142650 Sobic010G111000 Sobic010G111000 Sobic003G351200--Sobic010G111000 Sobic006G214900 Sobic006G214900 Sobic003G351200--Sobic006G214900 Sobic004G120600 Sobic004G120600 Sobic003G351200--Sobic004G120600 Sobic006G069766 Sobic006G069766 Sobic003G351200--Sobic006G069766 Sobic002G283200 Sobic002G283200 Sobic003G351200--Sobic002G283200 Sobic005G114201 Sobic005G114201 Sobic003G351200--Sobic005G114201 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic001G518900--Sobic008G095500 Sobic001G518900--Sobic008G088500 Sobic001G518900--Sobic008G168500 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic001G518900--Sobic009G047900 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic001G518900--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic010G196700 Sobic001G518900--Sobic001G364300 Sobic001G518900--Sobic005G058200 Sobic008G144701--Sobic009G047900 Sobic008G144701--Sobic010G196700 Sobic008G144701--Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic004G086900 Sobic008G144701--Sobic007G082300 Sobic008G144701--Sobic007G110800 Sobic008G144701--Sobic005G087732 Sobic008G144701--Sobic007G167950 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic008G144701--Sobic001G253750 Sobic004G250800--Sobic006G115700 Sobic004G250800--Sobic006G171600 Sobic008G007600 Sobic008G007600 Sobic004G250800--Sobic008G007600 Sobic004G250800--Sobic002G364700 Sobic002G299500 Sobic002G299500 Sobic004G250800--Sobic002G299500 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic004G250800--Sobic009G061500 Sobic008G165401 Sobic008G165401 Sobic004G250800--Sobic008G165401 Sobic004G250800--Sobic002G307400 Sobic001G135800 Sobic001G135800 Sobic004G250800--Sobic001G135800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.