Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G412400.1
Synonym Sb01g038870
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A125QUH8 , C5WP83
Pfam -
Panther DB PTHR33701 PTHR33701:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G37300 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g17500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001915 , Zm00025a052714
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G412400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G196001 - -
2 Sobic.006G085500 expressed protein -
3 Sobic.002G311700 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G362300 expressed protein -
5 Sobic.006G069000 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain containing protein, expressed K02639: ferredoxin
6 Sobic.010G184400 SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region containing protein, expressed -
7 Sobic.001G139300 expressed protein -
8 Sobic.005G196000 transporter family protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G328700 transferase family protein, putative, expressed K13065: E2.3.1.133, shikimate O-hydroxycinnamoyltransferase
10 Sobic.005G139600 Cupin domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G335900 expressed protein -
12 Sobic.001G265500 amidase, putative, expressed K01426: E3.5.1.4, amidase
13 Sobic.010G016300 BAG domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G142400 cycloartenol synthase, putative, expressed -
15 Sobic.003G423900 GRAS family transcription factor containing protein(PubMedID : 24906815)@GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
16 Sobic.006G157800 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G148400 Pectinesterase 1 (Precursor)(PubMedID : 26186930)@pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
18 Sobic.010G071300 pectinesterase, putative, expressed -
19 Sobic.007G222600 fasciclin domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G296200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G412400 Sobic001G412400 Sobic009G196001 Sobic009G196001 Sobic001G412400--Sobic009G196001 Sobic006G085500 Sobic006G085500 Sobic001G412400--Sobic006G085500 Sobic002G311700 Sobic002G311700 Sobic001G412400--Sobic002G311700 Sobic003G362300 Sobic003G362300 Sobic001G412400--Sobic003G362300 Sobic006G069000 Sobic006G069000 Sobic001G412400--Sobic006G069000 Sobic010G184400 Sobic010G184400 Sobic001G412400--Sobic010G184400 Sobic001G139300 Sobic001G139300 Sobic001G412400--Sobic001G139300 Sobic005G196000 Sobic005G196000 Sobic001G412400--Sobic005G196000 Sobic004G328700 Sobic004G328700 Sobic001G412400--Sobic004G328700 Sobic009G196001--Sobic002G311700 Sobic001G021601 Sobic001G021601 Sobic009G196001--Sobic001G021601 Sobic008G142400 Sobic008G142400 Sobic009G196001--Sobic008G142400 Sobic009G196001--Sobic001G412400 Sobic004G335900 Sobic004G335900 Sobic009G196001--Sobic004G335900 Sobic001G073400 Sobic001G073400 Sobic009G196001--Sobic001G073400 Sobic006G280400 Sobic006G280400 Sobic009G196001--Sobic006G280400 Sobic001G022200 Sobic001G022200 Sobic009G196001--Sobic001G022200 Sobic008G095150 Sobic008G095150 Sobic009G196001--Sobic008G095150 Sobic009G166650 Sobic009G166650 Sobic006G085500--Sobic009G166650 Sobic006G085500--Sobic001G021601 Sobic004G314400 Sobic004G314400 Sobic006G085500--Sobic004G314400 Sobic006G085500--Sobic002G311700 Sobic010G001400 Sobic010G001400 Sobic006G085500--Sobic010G001400 Sobic002G123750 Sobic002G123750 Sobic006G085500--Sobic002G123750 Sobic006G085500--Sobic001G412400 Sobic001G462300 Sobic001G462300 Sobic006G085500--Sobic001G462300 Sobic002G400700 Sobic002G400700 Sobic006G085500--Sobic002G400700 Sobic002G311700--Sobic008G142400 Sobic006G253900 Sobic006G253900 Sobic002G311700--Sobic006G253900 Sobic002G311700--Sobic009G196001 Sobic007G069500 Sobic007G069500 Sobic002G311700--Sobic007G069500 Sobic006G227000 Sobic006G227000 Sobic002G311700--Sobic006G227000 Sobic009G206000 Sobic009G206000 Sobic002G311700--Sobic009G206000 Sobic007G181000 Sobic007G181000 Sobic002G311700--Sobic007G181000 Sobic002G128600 Sobic002G128600 Sobic002G311700--Sobic002G128600 Sobic010G120200 Sobic010G120200 Sobic002G311700--Sobic010G120200 Sobic004G296200 Sobic004G296200 Sobic003G362300--Sobic004G296200 Sobic004G234300 Sobic004G234300 Sobic003G362300--Sobic004G234300 Sobic003G144600 Sobic003G144600 Sobic003G362300--Sobic003G144600 Sobic003G143900 Sobic003G143900 Sobic003G362300--Sobic003G143900 Sobic004G295700 Sobic004G295700 Sobic003G362300--Sobic004G295700 Sobic005G060766 Sobic005G060766 Sobic003G362300--Sobic005G060766 Sobic004G261200 Sobic004G261200 Sobic003G362300--Sobic004G261200 Sobic004G203500 Sobic004G203500 Sobic003G362300--Sobic004G203500 Sobic007G180900 Sobic007G180900 Sobic003G362300--Sobic007G180900 Sobic010G071300 Sobic010G071300 Sobic006G069000--Sobic010G071300 Sobic004G353900 Sobic004G353900 Sobic006G069000--Sobic004G353900 Sobic004G066300 Sobic004G066300 Sobic006G069000--Sobic004G066300 Sobic001G030200 Sobic001G030200 Sobic006G069000--Sobic001G030200 Sobic009G010900 Sobic009G010900 Sobic006G069000--Sobic009G010900 Sobic003G100200 Sobic003G100200 Sobic006G069000--Sobic003G100200 Sobic004G297800 Sobic004G297800 Sobic006G069000--Sobic004G297800 Sobic004G001200 Sobic004G001200 Sobic006G069000--Sobic004G001200 Sobic004G222300 Sobic004G222300 Sobic006G069000--Sobic004G222300 Sobic010G184400--Sobic005G196000 Sobic003G333300 Sobic003G333300 Sobic010G184400--Sobic003G333300 Sobic001G495550 Sobic001G495550 Sobic010G184400--Sobic001G495550 Sobic003G344950 Sobic003G344950 Sobic010G184400--Sobic003G344950 Sobic001G499800 Sobic001G499800 Sobic010G184400--Sobic001G499800 Sobic002G028901 Sobic002G028901 Sobic010G184400--Sobic002G028901 Sobic002G251050 Sobic002G251050 Sobic010G184400--Sobic002G251050 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic010G184400--Sobic005G035400 Sobic005G230800 Sobic005G230800 Sobic010G184400--Sobic005G230800 Sobic003G410700 Sobic003G410700 Sobic001G139300--Sobic003G410700 Sobic003G223900 Sobic003G223900 Sobic001G139300--Sobic003G223900 Sobic004G262600 Sobic004G262600 Sobic001G139300--Sobic004G262600 Sobic009G188800 Sobic009G188800 Sobic001G139300--Sobic009G188800 Sobic004G218900 Sobic004G218900 Sobic001G139300--Sobic004G218900 Sobic001G139300--Sobic004G234300 Sobic001G312600 Sobic001G312600 Sobic001G139300--Sobic001G312600 Sobic002G206700 Sobic002G206700 Sobic001G139300--Sobic002G206700 Sobic003G390700 Sobic003G390700 Sobic001G139300--Sobic003G390700 Sobic005G196000--Sobic010G184400 Sobic001G166100 Sobic001G166100 Sobic005G196000--Sobic001G166100 Sobic003G407950 Sobic003G407950 Sobic005G196000--Sobic003G407950 Sobic005G196000--Sobic002G251050 Sobic009G187150 Sobic009G187150 Sobic005G196000--Sobic009G187150 Sobic004G138600 Sobic004G138600 Sobic005G196000--Sobic004G138600 Sobic005G196000--Sobic001G499800 Sobic005G196000--Sobic001G495550 Sobic009G121150 Sobic009G121150 Sobic005G196000--Sobic009G121150 Sobic001G263500 Sobic001G263500 Sobic004G328700--Sobic001G263500 Sobic004G016700 Sobic004G016700 Sobic004G328700--Sobic004G016700 Sobic004G328700--Sobic001G030200 Sobic002G019900 Sobic002G019900 Sobic004G328700--Sobic002G019900 Sobic008G035600 Sobic008G035600 Sobic004G328700--Sobic008G035600 Sobic010G179000 Sobic010G179000 Sobic004G328700--Sobic010G179000 Sobic009G083000 Sobic009G083000 Sobic004G328700--Sobic009G083000 Sobic001G460700 Sobic001G460700 Sobic004G328700--Sobic001G460700 Sobic003G239700 Sobic003G239700 Sobic004G328700--Sobic003G239700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.