Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G419801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SA76
Pfam PF00012
Panther DB PTHR19375 PTHR19375:SF199
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G02500 : heat shock cognate protein 70-1
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g08460.1 : DnaK family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001861
Brachypodium KQK05900
Barley -
Wheat TraesCS5D02G492900 , TraesCS5D02G492900 , TraesCS5B02G492500 , TraesCS5B02G492500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G070200 trehalose phosphatase, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
2 Sobic.004G028700 polygalacturonase, putative, expressed -
3 Sobic.006G066400 cytochrome P450, putative, expressed K00517: indol-3-yl-methylglucosinolate hydroxylase
4 Sobic.004G014300 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.003G402100 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
6 Sobic.005G125800 - -
7 Sobic.005G042300 expressed protein -
8 Sobic.002G385450 - K09422: transcription factor MYB, plant
9 Sobic.010G212700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G329800 BHLH transcription factor, putative, expressed -
11 Sobic.003G029900 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
12 Sobic.001G468000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF677 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G180200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G154400 - -
15 Sobic.005G109500 cycloartenol synthase, putative, expressed -
16 Sobic.009G051101 - -
17 Sobic.003G382100 PHD finger protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G049800 strictosidine synthase, putative, expressed -
19 Sobic.002G277432 - -
20 Sobic.005G176500 DEFL14 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G419801 Sobic001G419801 Sobic008G070200 Sobic008G070200 Sobic001G419801--Sobic008G070200 Sobic004G028700 Sobic004G028700 Sobic001G419801--Sobic004G028700 Sobic006G066400 Sobic006G066400 Sobic001G419801--Sobic006G066400 Sobic004G014300 Sobic004G014300 Sobic001G419801--Sobic004G014300 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic001G419801--Sobic003G402100 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic001G419801--Sobic005G125800 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic001G419801--Sobic005G042300 Sobic002G385450 Sobic002G385450 Sobic001G419801--Sobic002G385450 Sobic010G212700 Sobic010G212700 Sobic001G419801--Sobic010G212700 Sobic008G070200--Sobic004G028700 Sobic002G277432 Sobic002G277432 Sobic008G070200--Sobic002G277432 Sobic005G176500 Sobic005G176500 Sobic008G070200--Sobic005G176500 Sobic008G120450 Sobic008G120450 Sobic008G070200--Sobic008G120450 Sobic009G073700 Sobic009G073700 Sobic008G070200--Sobic009G073700 Sobic009G071900 Sobic009G071900 Sobic008G070200--Sobic009G071900 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic008G070200--Sobic005G140300 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic008G070200--Sobic005G110000 Sobic008G070200--Sobic004G014300 Sobic004G028700--Sobic008G070200 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic004G028700--Sobic009G040100 Sobic004G028700--Sobic005G125800 Sobic004G028700--Sobic005G042300 Sobic004G028700--Sobic003G402100 Sobic004G028700--Sobic004G014300 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic004G028700--Sobic005G116000 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic004G028700--Sobic005G051700 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic004G028700--Sobic003G029900 Sobic001G468000 Sobic001G468000 Sobic006G066400--Sobic001G468000 Sobic003G022900 Sobic003G022900 Sobic006G066400--Sobic003G022900 Sobic006G066400--Sobic010G212700 Sobic010G180200 Sobic010G180200 Sobic006G066400--Sobic010G180200 Sobic001G171100 Sobic001G171100 Sobic006G066400--Sobic001G171100 Sobic002G196500 Sobic002G196500 Sobic006G066400--Sobic002G196500 Sobic002G366000 Sobic002G366000 Sobic006G066400--Sobic002G366000 Sobic002G244600 Sobic002G244600 Sobic006G066400--Sobic002G244600 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic006G066400--Sobic006G272800 Sobic004G014300--Sobic008G070200 Sobic009G154400 Sobic009G154400 Sobic004G014300--Sobic009G154400 Sobic004G014300--Sobic004G028700 Sobic004G014300--Sobic003G402100 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic004G014300--Sobic001G394100 Sobic009G227201 Sobic009G227201 Sobic004G014300--Sobic009G227201 Sobic001G053700 Sobic001G053700 Sobic004G014300--Sobic001G053700 Sobic007G084800 Sobic007G084800 Sobic004G014300--Sobic007G084800 Sobic008G186700 Sobic008G186700 Sobic004G014300--Sobic008G186700 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic003G402100--Sobic001G394900 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic003G402100--Sobic001G170500 Sobic007G023600 Sobic007G023600 Sobic003G402100--Sobic007G023600 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic003G402100--Sobic004G254400 Sobic003G402100--Sobic001G053700 Sobic003G402100--Sobic010G180200 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic003G402100--Sobic009G227000 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic003G402100--Sobic004G274500 Sobic008G176300 Sobic008G176300 Sobic003G402100--Sobic008G176300 Sobic005G125800--Sobic005G042300 Sobic005G125800--Sobic002G277432 Sobic005G125800--Sobic005G176500 Sobic005G125800--Sobic009G040100 Sobic005G125800--Sobic008G120450 Sobic010G274200 Sobic010G274200 Sobic005G125800--Sobic010G274200 Sobic005G125800--Sobic009G073700 Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic005G125800--Sobic007G062700 Sobic005G109500 Sobic005G109500 Sobic005G125800--Sobic005G109500 Sobic005G042300--Sobic005G125800 Sobic005G042300--Sobic002G277432 Sobic005G042300--Sobic005G176500 Sobic005G042300--Sobic009G040100 Sobic005G042300--Sobic008G120450 Sobic005G042300--Sobic010G274200 Sobic005G042300--Sobic009G073700 Sobic005G042300--Sobic007G062700 Sobic005G042300--Sobic005G109500 Sobic004G294600 Sobic004G294600 Sobic002G385450--Sobic004G294600 Sobic002G122000 Sobic002G122000 Sobic002G385450--Sobic002G122000 Sobic002G385450--Sobic003G029900 Sobic007G128400 Sobic007G128400 Sobic002G385450--Sobic007G128400 Sobic002G385450--Sobic008G176300 Sobic002G385450--Sobic006G066400 Sobic002G385450--Sobic003G402100 Sobic003G022200 Sobic003G022200 Sobic002G385450--Sobic003G022200 Sobic010G067200 Sobic010G067200 Sobic002G385450--Sobic010G067200 Sobic010G212700--Sobic001G171100 Sobic010G212700--Sobic001G468000 Sobic010G212700--Sobic003G022900 Sobic010G212700--Sobic006G066400 Sobic010G212700--Sobic010G180200 Sobic010G212700--Sobic002G196500 Sobic004G218000 Sobic004G218000 Sobic010G212700--Sobic004G218000 Sobic002G374200 Sobic002G374200 Sobic010G212700--Sobic002G374200 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic010G212700--Sobic004G014100
Octagon: transcription factors


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