Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G476900.1
Synonym Sb01g044680
Functional annotation zinc finger protein, putative, expressed
UniProt C5WUV1
Pfam PF12678
Panther DB PTHR22763 PTHR22763:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19950 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g01200.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G205000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01792: glucose-6-phosphate 1-epimerase
2 Sobic.010G244300 - -
3 Sobic.007G152701 - -
4 Sobic.003G033400 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G017000 expressed protein -
6 Sobic.008G084000 - -
7 Sobic.009G021050 - -
8 Sobic.007G139850 - -
9 Sobic.001G246800 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.007G052100 - -
11 Sobic.K044420 - -
12 Sobic.003G386500 LSM domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G236950 - -
14 Sobic.004G242250 - -
15 Sobic.007G088600 expressed protein -
16 Sobic.005G025001 - -
17 Sobic.001G380300 - -
18 Sobic.007G069900 expressed protein -
19 Sobic.009G027400 - -
20 Sobic.007G084900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G476900 Sobic001G476900 Sobic006G205000 Sobic006G205000 Sobic001G476900--Sobic006G205000 Sobic010G244300 Sobic010G244300 Sobic001G476900--Sobic010G244300 Sobic007G152701 Sobic007G152701 Sobic001G476900--Sobic007G152701 Sobic003G033400 Sobic003G033400 Sobic001G476900--Sobic003G033400 Sobic007G017000 Sobic007G017000 Sobic001G476900--Sobic007G017000 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic001G476900--Sobic008G084000 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic001G476900--Sobic009G021050 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic001G476900--Sobic007G139850 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic001G476900--Sobic001G246800 Sobic008G094150 Sobic008G094150 Sobic006G205000--Sobic008G094150 Sobic006G049200 Sobic006G049200 Sobic006G205000--Sobic006G049200 Sobic006G122500 Sobic006G122500 Sobic006G205000--Sobic006G122500 Sobic001G126500 Sobic001G126500 Sobic006G205000--Sobic001G126500 Sobic001G193800 Sobic001G193800 Sobic006G205000--Sobic001G193800 Sobic006G207700 Sobic006G207700 Sobic006G205000--Sobic006G207700 Sobic003G403800 Sobic003G403800 Sobic006G205000--Sobic003G403800 Sobic008G072400 Sobic008G072400 Sobic006G205000--Sobic008G072400 Sobic010G019200 Sobic010G019200 Sobic006G205000--Sobic010G019200 Sobic010G149800 Sobic010G149800 Sobic010G244300--Sobic010G149800 Sobic002G011900 Sobic002G011900 Sobic010G244300--Sobic002G011900 Sobic010G136950 Sobic010G136950 Sobic010G244300--Sobic010G136950 Sobic004G089300 Sobic004G089300 Sobic010G244300--Sobic004G089300 Sobic002G060000 Sobic002G060000 Sobic010G244300--Sobic002G060000 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic010G244300--Sobic002G103800 Sobic007G099900 Sobic007G099900 Sobic010G244300--Sobic007G099900 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G244300--Sobic003G075300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic010G244300--Sobic005G191200 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic007G152701--Sobic010G236950 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic007G152701--Sobic010G263051 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic007G152701--Sobic010G165925 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic007G152701--Sobic007G003250 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic007G152701--Sobic001G369701 Sobic003G199650 Sobic003G199650 Sobic007G152701--Sobic003G199650 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic007G152701--Sobic005G107250 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic007G152701--Sobic002G142550 Sobic001G355850 Sobic001G355850 Sobic007G152701--Sobic001G355850 Sobic003G033400--Sobic007G152701 Sobic003G033400--Sobic010G263051 Sobic003G033400--Sobic010G236950 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic003G033400--Sobic010G180300 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic003G033400--Sobic005G019650 Sobic003G033400--Sobic005G107250 Sobic003G033400--Sobic002G142550 Sobic007G048000 Sobic007G048000 Sobic003G033400--Sobic007G048000 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic003G033400--Sobic006G185150 Sobic010G256466 Sobic010G256466 Sobic007G017000--Sobic010G256466 Sobic007G017000--Sobic010G244300 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic007G017000--Sobic001G135650 Sobic007G017000--Sobic008G084000 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic007G017000--Sobic009G253600 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic007G017000--Sobic010G138600 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic007G017000--Sobic004G150901 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic007G017000--Sobic008G091785 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic007G017000--Sobic002G106700 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic009G021050--Sobic007G139850 Sobic009G021050--Sobic004G150901 Sobic009G021050--Sobic008G084000 Sobic009G021050--Sobic010G138600 Sobic009G021050--Sobic009G253600 SobicK044420 SobicK044420 Sobic009G021050--SobicK044420 Sobic008G074200 Sobic008G074200 Sobic009G021050--Sobic008G074200 Sobic005G152550 Sobic005G152550 Sobic009G021050--Sobic005G152550 Sobic008G181701 Sobic008G181701 Sobic009G021050--Sobic008G181701 Sobic007G139850--Sobic009G021050 Sobic007G139850--Sobic004G150901 Sobic007G139850--Sobic008G084000 Sobic007G139850--Sobic010G138600 Sobic007G139850--Sobic009G253600 Sobic007G139850--Sobic008G074200 Sobic007G139850--SobicK044420 Sobic007G139850--Sobic005G152550 Sobic007G139850--Sobic008G181701 Sobic001G246800--Sobic008G084000 Sobic005G070000 Sobic005G070000 Sobic001G246800--Sobic005G070000 Sobic001G246800--Sobic007G139850 Sobic001G246800--Sobic009G021050 Sobic001G246800--Sobic004G150901 Sobic001G246800--Sobic010G138600 Sobic001G246800--Sobic009G253600 Sobic001G246800--Sobic005G152550 Sobic001G246800--Sobic001G135650
Octagon: transcription factors


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