Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G502500.1,Sobic.001G502500.2
Synonym Sb01g046940
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5SBD5 , C5WXW4
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF113
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G04360 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05560.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000667 , Zm00025a000669 , Zm00025a005551
Brachypodium KQK18976 , KQK23633 , PNT66465
Barley HORVU4Hr1G080250.1 , HORVU7Hr1G027080.2 , HORVU7Hr1G027080.3 , HORVU7Hr1G027080.1 , HORVU7Hr1G027080.4 , HORVU4Hr1G080280.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G394250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G502500 Sobic001G502500 Sobic006G084500 Sobic006G084500 Sobic001G502500--Sobic006G084500 Sobic004G328601 Sobic004G328601 Sobic001G502500--Sobic004G328601 Sobic004G263000 Sobic004G263000 Sobic001G502500--Sobic004G263000 Sobic007G090424 Sobic007G090424 Sobic001G502500--Sobic007G090424 Sobic001G127700 Sobic001G127700 Sobic001G502500--Sobic001G127700 Sobic006G172700 Sobic006G172700 Sobic001G502500--Sobic006G172700 Sobic001G003600 Sobic001G003600 Sobic001G502500--Sobic001G003600 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic001G502500--Sobic010G124200 Sobic004G302000 Sobic004G302000 Sobic001G502500--Sobic004G302000 Sobic008G123600 Sobic008G123600 Sobic006G084500--Sobic008G123600 Sobic002G020100 Sobic002G020100 Sobic006G084500--Sobic002G020100 Sobic006G084500--Sobic001G003600 Sobic006G084500--Sobic006G172700 Sobic001G069500 Sobic001G069500 Sobic006G084500--Sobic001G069500 Sobic004G076000 Sobic004G076000 Sobic006G084500--Sobic004G076000 Sobic006G084500--Sobic007G090424 Sobic005G056201 Sobic005G056201 Sobic006G084500--Sobic005G056201 Sobic009G059100 Sobic009G059100 Sobic006G084500--Sobic009G059100 Sobic004G328900 Sobic004G328900 Sobic004G328601--Sobic004G328900 Sobic004G328601--Sobic001G502500 Sobic001G345900 Sobic001G345900 Sobic004G328601--Sobic001G345900 Sobic007G181000 Sobic007G181000 Sobic004G328601--Sobic007G181000 Sobic001G379300 Sobic001G379300 Sobic004G328601--Sobic001G379300 Sobic001G255300 Sobic001G255300 Sobic004G328601--Sobic001G255300 Sobic003G317800 Sobic003G317800 Sobic004G328601--Sobic003G317800 Sobic006G238100 Sobic006G238100 Sobic004G328601--Sobic006G238100 Sobic002G128600 Sobic002G128600 Sobic004G328601--Sobic002G128600 Sobic004G263000--Sobic001G127700 Sobic004G060700 Sobic004G060700 Sobic004G263000--Sobic004G060700 Sobic007G009600 Sobic007G009600 Sobic004G263000--Sobic007G009600 Sobic007G170800 Sobic007G170800 Sobic004G263000--Sobic007G170800 Sobic004G263000--Sobic008G123600 Sobic004G263000--Sobic006G172700 Sobic004G263000--Sobic001G003600 Sobic002G329500 Sobic002G329500 Sobic004G263000--Sobic002G329500 Sobic009G115050 Sobic009G115050 Sobic004G263000--Sobic009G115050 Sobic007G090424--Sobic001G127700 Sobic007G090424--Sobic006G084500 Sobic007G090424--Sobic006G172700 Sobic007G090424--Sobic008G123600 Sobic003G006100 Sobic003G006100 Sobic007G090424--Sobic003G006100 Sobic007G090424--Sobic005G056201 Sobic007G090424--Sobic007G009600 Sobic007G090424--Sobic001G003600 Sobic007G090424--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic006G172700 Sobic001G127700--Sobic009G115050 Sobic005G212400 Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic005G212400 Sobic001G127700--Sobic004G060700 Sobic001G127700--Sobic001G003600 Sobic001G435600 Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic001G435600 Sobic001G127700--Sobic007G170800 Sobic001G127700--Sobic002G329500 Sobic002G415400 Sobic002G415400 Sobic001G127700--Sobic002G415400 Sobic006G172700--Sobic001G003600 Sobic006G172700--Sobic009G059100 Sobic006G172700--Sobic002G020100 Sobic006G172700--Sobic001G127700 Sobic006G172700--Sobic005G056201 Sobic006G172700--Sobic004G076000 Sobic006G172700--Sobic009G115050 Sobic006G172700--Sobic004G060700 Sobic003G096100 Sobic003G096100 Sobic006G172700--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic006G172700 Sobic001G003600--Sobic002G020100 Sobic001G003600--Sobic009G115050 Sobic001G003600--Sobic003G096100 Sobic001G003600--Sobic004G076000 Sobic001G003600--Sobic001G435600 Sobic001G003600--Sobic002G329500 Sobic003G058600 Sobic003G058600 Sobic001G003600--Sobic003G058600 Sobic005G110436 Sobic005G110436 Sobic001G003600--Sobic005G110436 Sobic010G124200--Sobic005G212400 Sobic010G124200--Sobic006G172700 Sobic010G124200--Sobic001G127700 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic010G124200--Sobic006G001400 Sobic002G397400 Sobic002G397400 Sobic010G124200--Sobic002G397400 Sobic005G147800 Sobic005G147800 Sobic010G124200--Sobic005G147800 Sobic010G124200--Sobic009G059100 Sobic010G124200--Sobic002G020100 Sobic007G142300 Sobic007G142300 Sobic010G124200--Sobic007G142300 Sobic004G302000--Sobic001G502500 Sobic009G198300 Sobic009G198300 Sobic004G302000--Sobic009G198300 Sobic002G119900 Sobic002G119900 Sobic004G302000--Sobic002G119900 Sobic001G170700 Sobic001G170700 Sobic004G302000--Sobic001G170700 Sobic004G302000--Sobic004G328601 Sobic003G201200 Sobic003G201200 Sobic004G302000--Sobic003G201200 Sobic004G050700 Sobic004G050700 Sobic004G302000--Sobic004G050700 Sobic001G338100 Sobic001G338100 Sobic004G302000--Sobic001G338100 Sobic003G319700 Sobic003G319700 Sobic004G302000--Sobic003G319700
Octagon: transcription factors


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