Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G038600.1
Synonym Sb02g003330
Functional annotation DNA binding protein, putative, expressed
UniProt C5X9M9
Pfam PF02485
Panther DB PTHR31042 PTHR31042:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0008375acetylglucosaminyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G52060 : Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g06490.1 : DNA binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045047 , Zm00025a025149 , Zm00025a004729
Brachypodium KQJ85741 , KQK20859
Barley HORVU2Hr1G127680.2 , HORVU2Hr1G127680.3 , HORVU2Hr1G127680.1 , HORVU0Hr1G010000.3 , HORVU0Hr1G010000.2 , HORVU0Hr1G010000.4
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G038600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.009G070300 - -
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20 Sobic.010G068600 glutamate receptor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G038600 Sobic002G038600 Sobic002G296900 Sobic002G296900 Sobic002G038600--Sobic002G296900 Sobic002G201400 Sobic002G201400 Sobic002G038600--Sobic002G201400 Sobic006G273000 Sobic006G273000 Sobic002G038600--Sobic006G273000 Sobic007G159000 Sobic007G159000 Sobic002G038600--Sobic007G159000 Sobic004G017950 Sobic004G017950 Sobic002G038600--Sobic004G017950 Sobic004G285400 Sobic004G285400 Sobic002G038600--Sobic004G285400 Sobic008G081150 Sobic008G081150 Sobic002G038600--Sobic008G081150 Sobic008G078900 Sobic008G078900 Sobic002G038600--Sobic008G078900 Sobic005G191700 Sobic005G191700 Sobic002G038600--Sobic005G191700 Sobic002G296900--Sobic008G078900 Sobic002G296900--Sobic004G285400 Sobic009G046800 Sobic009G046800 Sobic002G296900--Sobic009G046800 Sobic003G114100 Sobic003G114100 Sobic002G296900--Sobic003G114100 Sobic008G082900 Sobic008G082900 Sobic002G296900--Sobic008G082900 Sobic002G296900--Sobic002G038600 Sobic010G086900 Sobic010G086900 Sobic002G296900--Sobic010G086900 Sobic001G460200 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Octagon: transcription factors


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