Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G082900.1
Synonym HINT3, Sb08g008270
Functional annotation histidine triad family protein, putative, expressed
UniProt C5YTZ7
Pfam PF01230
Panther DB PTHR23089 PTHR23089:SF7
NCBI CDD KOG3275; Zinc-binding protein of the histidine triad (HIT) family
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G48545 : histidine triad nucleotide-binding 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13120.1 : histidine triad family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054512
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G149300 pentatricopeptide, putative, expressed -
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19 Sobic.009G070100 expressed protein -
20 Sobic.010G000100 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G082900 Sobic008G082900 Sobic003G149300 Sobic003G149300 Sobic008G082900--Sobic003G149300 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic008G082900--Sobic002G209600 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic008G082900--Sobic008G092532 Sobic003G155300 Sobic003G155300 Sobic008G082900--Sobic003G155300 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic008G082900--Sobic002G431400 Sobic002G354501 Sobic002G354501 Sobic008G082900--Sobic002G354501 Sobic002G309800 Sobic002G309800 Sobic008G082900--Sobic002G309800 Sobic008G078900 Sobic008G078900 Sobic008G082900--Sobic008G078900 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic008G082900--Sobic004G096500 Sobic002G293600 Sobic002G293600 Sobic003G149300--Sobic002G293600 Sobic003G040000 Sobic003G040000 Sobic003G149300--Sobic003G040000 Sobic009G127400 Sobic009G127400 Sobic003G149300--Sobic009G127400 Sobic003G161000 Sobic003G161000 Sobic003G149300--Sobic003G161000 Sobic001G514100 Sobic001G514100 Sobic003G149300--Sobic001G514100 Sobic003G149300--Sobic003G155300 Sobic005G197300 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Octagon: transcription factors


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