Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G234700.1
Synonym Sb02g027380
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QD27
Pfam PF11955
Panther DB PTHR31476 PTHR31476:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G08940 : Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g29760.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014133
Brachypodium KQJ90622
Barley HORVU5Hr1G070460.2 , HORVU5Hr1G070460.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G017100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
2 Sobic.001G540800 DNA binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G431400 - -
4 Sobic.005G012700 expressed protein -
5 Sobic.002G309200 FAR1 family protein, expressed -
6 Sobic.006G269800 TFIIH basal transcription factor complex p52 subunit, putative, expressed K03144: TFIIH4, GTF2H4, transcription initiation factor TFIIH subunit 4
7 Sobic.002G373950 - -
8 Sobic.004G019500 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.004G351800 PPR repeat containing protein, expressed -
10 Sobic.004G107200 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
11 Sobic.008G147200 tubulin, putative, expressed -
12 Sobic.009G214200 phosphoribosylamine--glycine ligase, putative, expressed K01945: phosphoribosylamine---glycine ligase
13 Sobic.004G119400 ATP-binding domain-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
15 Sobic.008G092532 - -
16 Sobic.006G263000 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
17 Sobic.007G011600 KH domain-containing protein, putative, expressed K13210: far upstream element-binding protein
18 Sobic.009G213200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G096500 KH domain-containing protein, putative, expressed K13210: far upstream element-binding protein
20 Sobic.001G261900 caffeine-induced death protein 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G234700 Sobic002G234700 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic002G234700--Sobic008G017100 Sobic001G540800 Sobic001G540800 Sobic002G234700--Sobic001G540800 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic002G234700--Sobic002G431400 Sobic005G012700 Sobic005G012700 Sobic002G234700--Sobic005G012700 Sobic002G309200 Sobic002G309200 Sobic002G234700--Sobic002G309200 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic002G234700--Sobic006G269800 Sobic002G373950 Sobic002G373950 Sobic002G234700--Sobic002G373950 Sobic004G019500 Sobic004G019500 Sobic002G234700--Sobic004G019500 Sobic004G351800 Sobic004G351800 Sobic002G234700--Sobic004G351800 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic008G017100--Sobic004G119400 Sobic008G017100--Sobic006G269800 Sobic010G224700 Sobic010G224700 Sobic008G017100--Sobic010G224700 Sobic006G185200 Sobic006G185200 Sobic008G017100--Sobic006G185200 Sobic002G079100 Sobic002G079100 Sobic008G017100--Sobic002G079100 Sobic002G378100 Sobic002G378100 Sobic008G017100--Sobic002G378100 Sobic008G017100--Sobic004G351800 Sobic007G171100 Sobic007G171100 Sobic008G017100--Sobic007G171100 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic008G017100--Sobic008G147200 Sobic006G036100 Sobic006G036100 Sobic001G540800--Sobic006G036100 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic001G540800--Sobic002G425500 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic001G540800--Sobic002G145800 Sobic010G145800 Sobic010G145800 Sobic001G540800--Sobic010G145800 Sobic001G540800--Sobic004G019500 Sobic001G227200 Sobic001G227200 Sobic001G540800--Sobic001G227200 Sobic001G540800--Sobic006G269800 Sobic001G020000 Sobic001G020000 Sobic001G540800--Sobic001G020000 Sobic001G540800--Sobic002G309200 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic002G431400--Sobic004G107200 Sobic007G210000 Sobic007G210000 Sobic002G431400--Sobic007G210000 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic002G431400--Sobic008G092532 Sobic010G172000 Sobic010G172000 Sobic002G431400--Sobic010G172000 Sobic002G431400--Sobic001G540800 Sobic002G431400--Sobic002G309200 Sobic002G431400--Sobic002G425500 Sobic002G197300 Sobic002G197300 Sobic002G431400--Sobic002G197300 Sobic002G431400--Sobic006G269800 Sobic005G012700--Sobic002G234700 Sobic005G012700--Sobic002G373950 Sobic003G014700 Sobic003G014700 Sobic005G012700--Sobic003G014700 Sobic009G213200 Sobic009G213200 Sobic005G012700--Sobic009G213200 Sobic001G224200 Sobic001G224200 Sobic005G012700--Sobic001G224200 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic005G012700--Sobic009G103600 Sobic008G165900 Sobic008G165900 Sobic005G012700--Sobic008G165900 Sobic009G214200 Sobic009G214200 Sobic005G012700--Sobic009G214200 Sobic006G128400 Sobic006G128400 Sobic005G012700--Sobic006G128400 Sobic004G155600 Sobic004G155600 Sobic002G309200--Sobic004G155600 Sobic005G191900 Sobic005G191900 Sobic002G309200--Sobic005G191900 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic002G309200--Sobic008G011100 Sobic007G071200 Sobic007G071200 Sobic002G309200--Sobic007G071200 Sobic002G309200--Sobic001G540800 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic002G309200--Sobic004G096500 Sobic002G309200--Sobic002G145800 Sobic003G133900 Sobic003G133900 Sobic002G309200--Sobic003G133900 Sobic007G011600 Sobic007G011600 Sobic002G309200--Sobic007G011600 Sobic006G269800--Sobic002G145800 Sobic003G052800 Sobic003G052800 Sobic006G269800--Sobic003G052800 Sobic006G269800--Sobic008G147200 Sobic006G269800--Sobic008G017100 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic006G269800--Sobic001G393900 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic006G269800--Sobic002G043100 Sobic001G417500 Sobic001G417500 Sobic006G269800--Sobic001G417500 Sobic006G269800--Sobic004G107200 Sobic006G269800--Sobic002G425500 Sobic006G086600 Sobic006G086600 Sobic002G373950--Sobic006G086600 Sobic010G003400 Sobic010G003400 Sobic002G373950--Sobic010G003400 Sobic001G453400 Sobic001G453400 Sobic002G373950--Sobic001G453400 Sobic002G373950--Sobic009G213200 Sobic010G174700 Sobic010G174700 Sobic002G373950--Sobic010G174700 Sobic003G260400 Sobic003G260400 Sobic002G373950--Sobic003G260400 Sobic010G115400 Sobic010G115400 Sobic002G373950--Sobic010G115400 Sobic001G089600 Sobic001G089600 Sobic002G373950--Sobic001G089600 Sobic010G102600 Sobic010G102600 Sobic002G373950--Sobic010G102600 Sobic004G144400 Sobic004G144400 Sobic004G019500--Sobic004G144400 Sobic004G019500--Sobic001G540800 Sobic004G019500--Sobic009G214200 Sobic001G326300 Sobic001G326300 Sobic004G019500--Sobic001G326300 Sobic004G019500--Sobic007G210000 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic004G019500--Sobic001G022500 Sobic004G225600 Sobic004G225600 Sobic004G019500--Sobic004G225600 Sobic003G434700 Sobic003G434700 Sobic004G019500--Sobic003G434700 Sobic004G003900 Sobic004G003900 Sobic004G019500--Sobic004G003900 Sobic004G351800--Sobic001G417500 Sobic004G351800--Sobic008G017100 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic004G351800--Sobic001G261900 Sobic004G351800--Sobic006G269800 Sobic004G351800--Sobic004G107200 Sobic002G052400 Sobic002G052400 Sobic004G351800--Sobic002G052400 Sobic004G351800--Sobic001G326300 Sobic007G173500 Sobic007G173500 Sobic004G351800--Sobic007G173500 Sobic004G351800--Sobic006G128400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.