Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G351800.1
Synonym Sb04g037860
Functional annotation PPR repeat containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RQX1
Pfam PF12854 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF290
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G14770 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57800.1 : PPR repeat containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032742
Brachypodium KQK01451
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G039300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G351800 Sobic004G351800 Sobic001G417500 Sobic001G417500 Sobic004G351800--Sobic001G417500 Sobic008G017100 Sobic008G017100 Sobic004G351800--Sobic008G017100 Sobic001G261900 Sobic001G261900 Sobic004G351800--Sobic001G261900 Sobic006G269800 Sobic006G269800 Sobic004G351800--Sobic006G269800 Sobic004G107200 Sobic004G107200 Sobic004G351800--Sobic004G107200 Sobic002G052400 Sobic002G052400 Sobic004G351800--Sobic002G052400 Sobic001G326300 Sobic001G326300 Sobic004G351800--Sobic001G326300 Sobic007G173500 Sobic007G173500 Sobic004G351800--Sobic007G173500 Sobic006G128400 Sobic006G128400 Sobic004G351800--Sobic006G128400 Sobic001G417500--Sobic006G269800 Sobic001G417500--Sobic004G351800 Sobic003G309050 Sobic003G309050 Sobic001G417500--Sobic003G309050 Sobic002G043100 Sobic002G043100 Sobic001G417500--Sobic002G043100 Sobic001G393900 Sobic001G393900 Sobic001G417500--Sobic001G393900 Sobic001G417500--Sobic008G017100 Sobic001G417500--Sobic004G107200 Sobic001G417500--Sobic007G173500 Sobic007G000300 Sobic007G000300 Sobic001G417500--Sobic007G000300 Sobic004G119400 Sobic004G119400 Sobic008G017100--Sobic004G119400 Sobic008G017100--Sobic006G269800 Sobic010G224700 Sobic010G224700 Sobic008G017100--Sobic010G224700 Sobic006G185200 Sobic006G185200 Sobic008G017100--Sobic006G185200 Sobic002G079100 Sobic002G079100 Sobic008G017100--Sobic002G079100 Sobic002G378100 Sobic002G378100 Sobic008G017100--Sobic002G378100 Sobic008G017100--Sobic004G351800 Sobic007G171100 Sobic007G171100 Sobic008G017100--Sobic007G171100 Sobic008G147200 Sobic008G147200 Sobic008G017100--Sobic008G147200 Sobic010G100800 Sobic010G100800 Sobic001G261900--Sobic010G100800 Sobic007G212300 Sobic007G212300 Sobic001G261900--Sobic007G212300 Sobic001G261900--Sobic004G107200 Sobic004G176000 Sobic004G176000 Sobic001G261900--Sobic004G176000 Sobic006G119400 Sobic006G119400 Sobic001G261900--Sobic006G119400 Sobic008G132900 Sobic008G132900 Sobic001G261900--Sobic008G132900 Sobic001G261900--Sobic004G351800 Sobic001G261900--Sobic007G000300 Sobic007G065100 Sobic007G065100 Sobic001G261900--Sobic007G065100 Sobic002G145800 Sobic002G145800 Sobic006G269800--Sobic002G145800 Sobic003G052800 Sobic003G052800 Sobic006G269800--Sobic003G052800 Sobic006G269800--Sobic008G147200 Sobic006G269800--Sobic008G017100 Sobic006G269800--Sobic001G393900 Sobic006G269800--Sobic002G043100 Sobic006G269800--Sobic001G417500 Sobic006G269800--Sobic004G107200 Sobic002G425500 Sobic002G425500 Sobic006G269800--Sobic002G425500 Sobic002G431400 Sobic002G431400 Sobic004G107200--Sobic002G431400 Sobic004G107200--Sobic002G425500 Sobic004G107200--Sobic006G119400 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic004G107200--Sobic003G101500 Sobic004G107200--Sobic002G043100 Sobic001G501800 Sobic001G501800 Sobic004G107200--Sobic001G501800 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G107200--Sobic001G456900 Sobic004G107200--Sobic001G261900 Sobic004G107200--Sobic006G269800 Sobic002G052400--Sobic004G351800 Sobic002G052400--Sobic008G017100 Sobic002G377800 Sobic002G377800 Sobic002G052400--Sobic002G377800 Sobic009G105200 Sobic009G105200 Sobic002G052400--Sobic009G105200 Sobic007G145100 Sobic007G145100 Sobic002G052400--Sobic007G145100 Sobic002G052400--Sobic001G261900 Sobic002G373950 Sobic002G373950 Sobic002G052400--Sobic002G373950 Sobic008G022701 Sobic008G022701 Sobic002G052400--Sobic008G022701 Sobic010G228700 Sobic010G228700 Sobic002G052400--Sobic010G228700 Sobic004G019500 Sobic004G019500 Sobic001G326300--Sobic004G019500 Sobic001G379200 Sobic001G379200 Sobic001G326300--Sobic001G379200 Sobic001G022500 Sobic001G022500 Sobic001G326300--Sobic001G022500 Sobic001G326300--Sobic004G351800 Sobic002G055300 Sobic002G055300 Sobic001G326300--Sobic002G055300 Sobic004G144400 Sobic004G144400 Sobic001G326300--Sobic004G144400 Sobic005G197300 Sobic005G197300 Sobic001G326300--Sobic005G197300 Sobic008G092532 Sobic008G092532 Sobic001G326300--Sobic008G092532 Sobic002G181132 Sobic002G181132 Sobic001G326300--Sobic002G181132 Sobic007G173500--Sobic001G393900 Sobic001G020000 Sobic001G020000 Sobic007G173500--Sobic001G020000 Sobic007G173500--Sobic007G212300 Sobic003G095900 Sobic003G095900 Sobic007G173500--Sobic003G095900 Sobic003G260400 Sobic003G260400 Sobic007G173500--Sobic003G260400 Sobic004G309900 Sobic004G309900 Sobic007G173500--Sobic004G309900 Sobic003G016900 Sobic003G016900 Sobic007G173500--Sobic003G016900 Sobic004G124300 Sobic004G124300 Sobic007G173500--Sobic004G124300 Sobic006G096900 Sobic006G096900 Sobic007G173500--Sobic006G096900 Sobic006G128400--Sobic002G378100 Sobic001G501400 Sobic001G501400 Sobic006G128400--Sobic001G501400 Sobic002G092050 Sobic002G092050 Sobic006G128400--Sobic002G092050 Sobic001G224200 Sobic001G224200 Sobic006G128400--Sobic001G224200 Sobic008G165900 Sobic008G165900 Sobic006G128400--Sobic008G165900 Sobic007G075800 Sobic007G075800 Sobic006G128400--Sobic007G075800 Sobic010G051700 Sobic010G051700 Sobic006G128400--Sobic010G051700 Sobic006G128400--Sobic010G224700 Sobic002G317100 Sobic002G317100 Sobic006G128400--Sobic002G317100
Octagon: transcription factors


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