Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G054500.2
Synonym Sb02g004560
Functional annotation Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
expressed protein
UniProt A0A1W0W2I6
Pfam PF08268
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF93
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
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1 Sobic.008G052500 receptor-like kinase, putative, expressed -
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9 Sobic.006G167900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
10 Sobic.003G137900 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.003G266700 expressed protein -
12 Sobic.002G171400 - -
13 Sobic.001G140200 Homeobox domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G073750 - -
15 Sobic.001G210250 - -
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17 Sobic.007G064250 - -
18 Sobic.001G155300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 1, chloroplast precursor, putative, expressed K09840: 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase
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20 Sobic.007G143200 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@- -


Gene co-expression network
sample Sobic002G054500 Sobic002G054500 Sobic008G052500 Sobic008G052500 Sobic002G054500--Sobic008G052500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic002G054500--Sobic005G079700 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic002G054500--Sobic008G065400 Sobic008G040900 Sobic008G040900 Sobic002G054500--Sobic008G040900 Sobic004G108501 Sobic004G108501 Sobic002G054500--Sobic004G108501 Sobic003G081900 Sobic003G081900 Sobic002G054500--Sobic003G081900 Sobic002G023900 Sobic002G023900 Sobic002G054500--Sobic002G023900 Sobic010G054500 Sobic010G054500 Sobic002G054500--Sobic010G054500 Sobic006G167900 Sobic006G167900 Sobic002G054500--Sobic006G167900 Sobic008G052500--Sobic010G054500 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic008G052500--Sobic001G140200 Sobic002G325600 Sobic002G325600 Sobic008G052500--Sobic002G325600 Sobic005G016900 Sobic005G016900 Sobic008G052500--Sobic005G016900 Sobic007G143100 Sobic007G143100 Sobic008G052500--Sobic007G143100 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic008G052500--Sobic001G509400 Sobic007G169600 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Octagon: transcription factors


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