Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G108501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLT6
Pfam -
Panther DB PTHR33144
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G039401 - -
2 Sobic.004G282500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G002700 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11806: DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13
4 Sobic.002G244700 cytosolic phospholipase A2 beta, putative, expressed K19219: peptidyl-lysine (3S)-dioxygenase / protease
5 Sobic.008G088839 - -
6 Sobic.002G416150 - -
7 Sobic.001G204700 expressed protein -
8 Sobic.002G019750 - -
9 Sobic.007G174900 carrier, putative, expressed -
10 Sobic.008G000600 RNase P subunit p30, putative, expressed K03539: RPP1, ribonuclease P/MRP protein subunit RPP1
11 Sobic.007G046000 OsTOP6A2 - Topoisomerase 6 subunit A homolog 2, expressed K10878: meiotic recombination protein SPO11
12 Sobic.003G112600 endoplasmic oxidoreductin-1 precursor, putative, expressed K10950: ERO1-like protein alpha
13 Sobic.009G053400 expressed protein -
14 Sobic.006G088400 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G245900 expressed protein -
16 Sobic.005G079700 expressed protein -
17 Sobic.003G435400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
18 Sobic.004G043600 expressed protein -
19 Sobic.004G353400 leucine-rich repeat-containing protein 40, putative, expressed -
20 Sobic.003G033700 expressed protein K15326: tRNA-splicing endonuclease subunit Sen54


Gene co-expression network
sample Sobic004G108501 Sobic004G108501 Sobic008G039401 Sobic008G039401 Sobic004G108501--Sobic008G039401 Sobic004G282500 Sobic004G282500 Sobic004G108501--Sobic004G282500 Sobic003G002700 Sobic003G002700 Sobic004G108501--Sobic003G002700 Sobic002G244700 Sobic002G244700 Sobic004G108501--Sobic002G244700 Sobic008G088839 Sobic008G088839 Sobic004G108501--Sobic008G088839 Sobic002G416150 Sobic002G416150 Sobic004G108501--Sobic002G416150 Sobic001G204700 Sobic001G204700 Sobic004G108501--Sobic001G204700 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic004G108501--Sobic002G019750 Sobic007G174900 Sobic007G174900 Sobic004G108501--Sobic007G174900 Sobic008G039401--Sobic008G088839 Sobic008G039401--Sobic004G108501 Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic008G039401--Sobic003G009400 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic008G039401--Sobic008G106600 Sobic003G049600 Sobic003G049600 Sobic008G039401--Sobic003G049600 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic008G039401--Sobic004G089500 Sobic001G105600 Sobic001G105600 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Octagon: transcription factors


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