Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G053400.2,Sobic.009G053400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P6T8
Pfam PF06839
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g04390.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G053400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G494100 expressed protein K10875: RAD54L, DNA repair and recombination protein RAD54 and RAD54-like protein
2 Sobic.004G227500 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G277900 "D61(Ortholog in rice:Morinaka et al., 2006(PubMedID : 31659871)@systemin receptor SR160 precursor, putative, expressed K13415: protein brassinosteroid insensitive 1
4 Sobic.004G053300 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K07375: tubulin beta
5 Sobic.008G000800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10398: KIF11, kinesin family member 11
6 Sobic.002G316500 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G205900 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.005G061100 - -
9 Sobic.009G013100 rp3 protein, putative, expressed -
10 Sobic.008G099500 - -
11 Sobic.002G073300 - -
12 Sobic.002G105000 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G159500 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed -
14 Sobic.010G033700 - -
15 Sobic.010G139301 - -
16 Sobic.004G135500 - -
17 Sobic.010G173900 expressed protein -
18 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
19 Sobic.002G189700 nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed -
20 Sobic.001G315400 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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