Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G189700.2,Sobic.002G189700.1
Synonym Sb02g023720
Functional annotation nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed
UniProt A0A1B6QC96 , C5XBG2
Pfam PF00860
Panther DB PTHR11119 PTHR11119:SF53
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G62890 : Xanthine/uracil permease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g21340.1 : nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046835
Brachypodium KQJ98293
Barley HORVU5Hr1G059600.3 , HORVU5Hr1G059600.7 , HORVU5Hr1G059600.6 , HORVU5Hr1G059600.5 , HORVU5Hr1G059600.4 , HORVU5Hr1G059600.2 , HORVU5Hr1G059600.1 , HORVU5Hr1G059600.9 , HORVU5Hr1G059600.8 , HORVU5Hr1G059600.18 , HORVU5Hr1G059600.17 , HORVU5Hr1G059600.16 , HORVU5Hr1G059600.15 , HORVU5Hr1G059600.14 , HORVU5Hr1G059600.13 , HORVU5Hr1G059600.12 , HORVU5Hr1G059600.11 , HORVU5Hr1G059600.10
Wheat TraesCS5D02G205600 , TraesCS5B02G198300 , TraesCS5A02G200000
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G189700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.009G015800 expressed protein -
19 Sobic.005G122900 - -
20 Sobic.002G421700 OsFBX368 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G189700 Sobic002G189700 Sobic009G030300 Sobic009G030300 Sobic002G189700--Sobic009G030300 Sobic008G020200 Sobic008G020200 Sobic002G189700--Sobic008G020200 Sobic002G294900 Sobic002G294900 Sobic002G189700--Sobic002G294900 Sobic005G051300 Sobic005G051300 Sobic002G189700--Sobic005G051300 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G189700--Sobic010G139301 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic002G189700--Sobic006G068400 Sobic006G032900 Sobic006G032900 Sobic002G189700--Sobic006G032900 Sobic008G096100 Sobic008G096100 Sobic002G189700--Sobic008G096100 Sobic008G000800 Sobic008G000800 Sobic002G189700--Sobic008G000800 Sobic002G177400 Sobic002G177400 Sobic009G030300--Sobic002G177400 Sobic001G226000 Sobic001G226000 Sobic009G030300--Sobic001G226000 Sobic004G061900 Sobic004G061900 Sobic009G030300--Sobic004G061900 Sobic009G044900 Sobic009G044900 Sobic009G030300--Sobic009G044900 Sobic004G013600 Sobic004G013600 Sobic009G030300--Sobic004G013600 Sobic004G088400 Sobic004G088400 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Octagon: transcription factors


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