Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G146900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBB5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G107532 - -
2 Sobic.007G112700 - -
3 Sobic.002G136900 - -
4 Sobic.002G182150 - -
5 Sobic.005G099200 - -
6 Sobic.006G225800 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -
7 Sobic.007G100100 - -
8 Sobic.002G175900 expressed protein -
9 Sobic.008G109100 expressed protein -
10 Sobic.010G015000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G160400 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.002G427300 protein phosphotase protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G016300 PPR repeat containing protein, expressed -
14 Sobic.001G144600 parafibromin, putative, expressed K15175: parafibromin
15 Sobic.009G013000 rp3 protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G148750 - -
17 Sobic.010G033700 - -
18 Sobic.009G013100 rp3 protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G088400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G174600 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G146900 Sobic002G146900 Sobic002G107532 Sobic002G107532 Sobic002G146900--Sobic002G107532 Sobic007G112700 Sobic007G112700 Sobic002G146900--Sobic007G112700 Sobic002G136900 Sobic002G136900 Sobic002G146900--Sobic002G136900 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic002G146900--Sobic002G182150 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic002G146900--Sobic005G099200 Sobic006G225800 Sobic006G225800 Sobic002G146900--Sobic006G225800 Sobic007G100100 Sobic007G100100 Sobic002G146900--Sobic007G100100 Sobic002G175900 Sobic002G175900 Sobic002G146900--Sobic002G175900 Sobic008G109100 Sobic008G109100 Sobic002G146900--Sobic008G109100 Sobic002G107532--Sobic002G182150 Sobic002G107532--Sobic007G100100 Sobic008G099500 Sobic008G099500 Sobic002G107532--Sobic008G099500 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic002G107532--Sobic005G040900 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic002G107532--Sobic008G090300 Sobic002G107532--Sobic002G146900 Sobic004G178901 Sobic004G178901 Sobic002G107532--Sobic004G178901 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic002G107532--Sobic002G073300 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G107532--Sobic010G139301 Sobic007G112700--Sobic002G136900 Sobic007G083100 Sobic007G083100 Sobic007G112700--Sobic007G083100 Sobic009G029500 Sobic009G029500 Sobic007G112700--Sobic009G029500 Sobic003G368800 Sobic003G368800 Sobic007G112700--Sobic003G368800 Sobic007G112700--Sobic002G146900 Sobic008G056900 Sobic008G056900 Sobic007G112700--Sobic008G056900 Sobic007G112700--Sobic007G100100 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic007G112700--Sobic003G159450 Sobic010G268200 Sobic010G268200 Sobic007G112700--Sobic010G268200 Sobic002G136900--Sobic007G112700 Sobic002G136900--Sobic010G268200 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic002G136900--Sobic002G095900 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic002G136900--Sobic002G212800 Sobic002G136900--Sobic003G159450 Sobic002G136900--Sobic009G029500 Sobic002G136900--Sobic003G368800 Sobic009G103500 Sobic009G103500 Sobic002G136900--Sobic009G103500 Sobic008G068601 Sobic008G068601 Sobic002G136900--Sobic008G068601 Sobic002G182150--Sobic002G107532 Sobic002G182150--Sobic004G178901 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic002G182150--Sobic010G033700 Sobic002G182150--Sobic007G100100 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182150--Sobic002G124200 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G182150--Sobic002G182300 Sobic004G148750 Sobic004G148750 Sobic002G182150--Sobic004G148750 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G182150--Sobic005G001900 Sobic006G253400 Sobic006G253400 Sobic002G182150--Sobic006G253400 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic005G099200--Sobic006G066000 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic005G099200--Sobic004G045566 Sobic005G022300 Sobic005G022300 Sobic005G099200--Sobic005G022300 Sobic010G015000 Sobic010G015000 Sobic005G099200--Sobic010G015000 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic005G099200--Sobic006G067100 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic005G099200--Sobic005G099150 Sobic004G185500 Sobic004G185500 Sobic005G099200--Sobic004G185500 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic005G099200--Sobic004G289600 Sobic005G099200--Sobic002G146900 Sobic006G251600 Sobic006G251600 Sobic006G225800--Sobic006G251600 Sobic004G305100 Sobic004G305100 Sobic006G225800--Sobic004G305100 Sobic004G287100 Sobic004G287100 Sobic006G225800--Sobic004G287100 Sobic002G262100 Sobic002G262100 Sobic006G225800--Sobic002G262100 Sobic002G365400 Sobic002G365400 Sobic006G225800--Sobic002G365400 Sobic003G098900 Sobic003G098900 Sobic006G225800--Sobic003G098900 Sobic010G041000 Sobic010G041000 Sobic006G225800--Sobic010G041000 Sobic006G225800--Sobic002G146900 Sobic004G173100 Sobic004G173100 Sobic006G225800--Sobic004G173100 Sobic007G100100--Sobic010G139301 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic007G100100--Sobic007G089600 Sobic007G100100--Sobic002G182150 Sobic007G100100--Sobic002G107532 Sobic007G100100--Sobic007G083100 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic007G100100--Sobic007G112900 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic007G100100--Sobic006G072900 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic007G100100--Sobic007G142050 Sobic007G100100--Sobic005G099150 Sobic005G116900 Sobic005G116900 Sobic002G175900--Sobic005G116900 Sobic001G315800 Sobic001G315800 Sobic002G175900--Sobic001G315800 Sobic003G016400 Sobic003G016400 Sobic002G175900--Sobic003G016400 Sobic005G007700 Sobic005G007700 Sobic002G175900--Sobic005G007700 Sobic001G463400 Sobic001G463400 Sobic002G175900--Sobic001G463400 Sobic005G089000 Sobic005G089000 Sobic002G175900--Sobic005G089000 Sobic007G174600 Sobic007G174600 Sobic002G175900--Sobic007G174600 Sobic001G513600 Sobic001G513600 Sobic002G175900--Sobic001G513600 Sobic003G151800 Sobic003G151800 Sobic002G175900--Sobic003G151800 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic008G109100--Sobic008G065800 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G109100--Sobic005G079700 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic008G109100--Sobic008G106600 Sobic008G000800 Sobic008G000800 Sobic008G109100--Sobic008G000800 Sobic010G004400 Sobic010G004400 Sobic008G109100--Sobic010G004400 Sobic003G277900 Sobic003G277900 Sobic008G109100--Sobic003G277900 Sobic010G166700 Sobic010G166700 Sobic008G109100--Sobic010G166700 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic008G109100--Sobic008G091671 Sobic002G205900 Sobic002G205900 Sobic008G109100--Sobic002G205900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.