Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G148750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNK5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G182150 - -
2 Sobic.004G289600 - -
3 Sobic.003G159450 - -
4 Sobic.004G178901 - -
5 Sobic.007G214175 - -
6 Sobic.010G033700 - -
7 Sobic.002G330900 OsFBX462 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.006G042200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
9 Sobic.003G190300 - -
10 Sobic.008G125600 - -
11 Sobic.006G121900 - -
12 Sobic.001G022100 expressed protein -
13 Sobic.010G246900 - -
14 Sobic.005G096800 - -
15 Sobic.002G212800 - -
16 Sobic.001G267900 - -
17 Sobic.007G112900 - -
18 Sobic.009G074700 heat shock protein binding protein, putative, expressed K09540: SEC63, translocation protein SEC63
19 Sobic.010G202600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10661: MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6
20 Sobic.008G127400 OsFBX252 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G148750 Sobic004G148750 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic004G148750--Sobic002G182150 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic004G148750--Sobic004G289600 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic004G148750--Sobic003G159450 Sobic004G178901 Sobic004G178901 Sobic004G148750--Sobic004G178901 Sobic007G214175 Sobic007G214175 Sobic004G148750--Sobic007G214175 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G148750--Sobic010G033700 Sobic002G330900 Sobic002G330900 Sobic004G148750--Sobic002G330900 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic004G148750--Sobic006G042200 Sobic003G190300 Sobic003G190300 Sobic004G148750--Sobic003G190300 Sobic002G107532 Sobic002G107532 Sobic002G182150--Sobic002G107532 Sobic002G182150--Sobic004G178901 Sobic002G182150--Sobic010G033700 Sobic007G100100 Sobic007G100100 Sobic002G182150--Sobic007G100100 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182150--Sobic002G124200 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G182150--Sobic002G182300 Sobic002G182150--Sobic004G148750 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G182150--Sobic005G001900 Sobic006G253400 Sobic006G253400 Sobic002G182150--Sobic006G253400 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G065800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic008G125600 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic004G289600--Sobic001G022100 Sobic003G020600 Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic003G020600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G289600--Sobic006G068400 Sobic004G289600--Sobic010G033700 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic004G289600--Sobic009G067501 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic004G289600--Sobic008G106600 Sobic008G189400 Sobic008G189400 Sobic004G289600--Sobic008G189400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic003G159450--Sobic007G112900 Sobic010G143200 Sobic010G143200 Sobic003G159450--Sobic010G143200 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic003G159450--Sobic002G212800 Sobic003G159450--Sobic008G125600 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic003G159450--Sobic008G091671 Sobic003G159450--Sobic009G067501 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic003G159450--Sobic004G291800 Sobic002G095900 Sobic002G095900 Sobic003G159450--Sobic002G095900 Sobic005G007700 Sobic005G007700 Sobic003G159450--Sobic005G007700 Sobic004G160400 Sobic004G160400 Sobic004G178901--Sobic004G160400 Sobic004G178901--Sobic002G182150 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G178901--Sobic002G181450 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic004G178901--Sobic010G153466 Sobic004G178901--Sobic004G148750 Sobic004G089450 Sobic004G089450 Sobic004G178901--Sobic004G089450 Sobic004G178901--Sobic002G107532 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G178901--Sobic006G072900 Sobic006G048300 Sobic006G048300 Sobic004G178901--Sobic006G048300 Sobic007G214175--Sobic006G072900 Sobic007G214050 Sobic007G214050 Sobic007G214175--Sobic007G214050 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic007G214175--Sobic001G454301 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G214175--Sobic009G104300 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic007G214175--Sobic002G144966 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic007G214175--Sobic009G100050 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic007G214175--Sobic003G205801 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic007G214175--Sobic005G077400 Sobic007G214175--Sobic003G159450 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic010G033700--Sobic005G096800 Sobic010G033700--Sobic004G289600 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic010G033700--Sobic010G139301 Sobic010G033700--Sobic002G182150 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic010G033700--Sobic005G079700 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic010G033700--Sobic004G204400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic010G033700--Sobic008G065400 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic010G033700--Sobic004G132100 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic010G033700--Sobic003G374500 Sobic010G235600 Sobic010G235600 Sobic002G330900--Sobic010G235600 Sobic001G215400 Sobic001G215400 Sobic002G330900--Sobic001G215400 Sobic003G085600 Sobic003G085600 Sobic002G330900--Sobic003G085600 Sobic009G126800 Sobic009G126800 Sobic002G330900--Sobic009G126800 Sobic009G137900 Sobic009G137900 Sobic002G330900--Sobic009G137900 Sobic002G330900--Sobic004G148750 Sobic003G051700 Sobic003G051700 Sobic002G330900--Sobic003G051700 Sobic004G089500 Sobic004G089500 Sobic002G330900--Sobic004G089500 Sobic003G343600 Sobic003G343600 Sobic002G330900--Sobic003G343600 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic006G042200--Sobic004G135300 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic006G042200--Sobic007G054100 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic006G042200--Sobic001G222250 Sobic004G174900 Sobic004G174900 Sobic006G042200--Sobic004G174900 Sobic006G042200--Sobic008G125600 Sobic004G010101 Sobic004G010101 Sobic006G042200--Sobic004G010101 Sobic009G008100 Sobic009G008100 Sobic006G042200--Sobic009G008100 Sobic002G073900 Sobic002G073900 Sobic006G042200--Sobic002G073900 Sobic002G040800 Sobic002G040800 Sobic006G042200--Sobic002G040800 Sobic003G205501 Sobic003G205501 Sobic003G190300--Sobic003G205501 Sobic005G040900 Sobic005G040900 Sobic003G190300--Sobic005G040900 Sobic001G296500 Sobic001G296500 Sobic003G190300--Sobic001G296500 Sobic003G190300--Sobic006G072900 Sobic003G190300--Sobic003G205801 Sobic002G115500 Sobic002G115500 Sobic003G190300--Sobic002G115500 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic003G190300--Sobic004G045566 Sobic008G127400 Sobic008G127400 Sobic003G190300--Sobic008G127400 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic003G190300--Sobic001G267900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.