Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G178901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN20
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF154
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05880.1 : OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G160400 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.002G182150 - -
3 Sobic.002G181450 - -
4 Sobic.010G153466 - -
5 Sobic.004G148750 - -
6 Sobic.004G089450 - -
7 Sobic.002G107532 - -
8 Sobic.006G072900 hydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.006G048300 - -
10 Sobic.007G214175 - -
11 Sobic.006G045901 - -
12 Sobic.002G299100 SET domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G137601 - -
14 Sobic.005G001900 - -
15 Sobic.006G131200 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, putative, expressed K03018: RPC1, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1
16 Sobic.003G413100 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G063900 zinc ion binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G227200 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4
19 Sobic.004G086200 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09566: peptidyl-prolyl isomerase G (cyclophilin G)
20 Sobic.002G124200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G178901 Sobic004G178901 Sobic004G160400 Sobic004G160400 Sobic004G178901--Sobic004G160400 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic004G178901--Sobic002G182150 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G178901--Sobic002G181450 Sobic010G153466 Sobic010G153466 Sobic004G178901--Sobic010G153466 Sobic004G148750 Sobic004G148750 Sobic004G178901--Sobic004G148750 Sobic004G089450 Sobic004G089450 Sobic004G178901--Sobic004G089450 Sobic002G107532 Sobic002G107532 Sobic004G178901--Sobic002G107532 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G178901--Sobic006G072900 Sobic006G048300 Sobic006G048300 Sobic004G178901--Sobic006G048300 Sobic004G160400--Sobic004G178901 Sobic008G125100 Sobic008G125100 Sobic004G160400--Sobic008G125100 Sobic004G160400--Sobic002G182150 Sobic004G160400--Sobic004G148750 Sobic005G099200 Sobic005G099200 Sobic004G160400--Sobic005G099200 Sobic009G018450 Sobic009G018450 Sobic004G160400--Sobic009G018450 Sobic010G235800 Sobic010G235800 Sobic004G160400--Sobic010G235800 Sobic005G191700 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Octagon: transcription factors


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