Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G121900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PLM2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.006G121900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G148750 - -
2 Sobic.004G135300 - -
3 Sobic.006G042200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./middle senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
4 Sobic.006G067150 - -
5 Sobic.002G283600 AGAP005770-PA, putative, expressed -
6 Sobic.007G054100 stress-induced protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G368800 expressed protein -
8 Sobic.004G021200 expressed protein -
9 Sobic.003G159450 - -
10 Sobic.004G192200 choline transporter-related, putative, expressed -
11 Sobic.004G095300 RNA recognition motif containing protein, expressed K12741: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
12 Sobic.008G080200 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G040800 CAMK_CAMK_like.31 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
14 Sobic.001G534600 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
15 Sobic.003G123000 splicing factor 3 subunit 1, putative, expressed K12825: SF3A1, splicing factor 3A subunit 1
16 Sobic.001G302732 - -
17 Sobic.001G267900 - -
18 Sobic.007G009400 bromodomain domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G068500 CUE domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G308700 BTBA2 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1


Gene co-expression network
sample Sobic006G121900 Sobic006G121900 Sobic004G148750 Sobic004G148750 Sobic006G121900--Sobic004G148750 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic006G121900--Sobic004G135300 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic006G121900--Sobic006G042200 Sobic006G067150 Sobic006G067150 Sobic006G121900--Sobic006G067150 Sobic002G283600 Sobic002G283600 Sobic006G121900--Sobic002G283600 Sobic007G054100 Sobic007G054100 Sobic006G121900--Sobic007G054100 Sobic003G368800 Sobic003G368800 Sobic006G121900--Sobic003G368800 Sobic004G021200 Sobic004G021200 Sobic006G121900--Sobic004G021200 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic006G121900--Sobic003G159450 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic004G148750--Sobic002G182150 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic004G148750--Sobic004G289600 Sobic004G148750--Sobic003G159450 Sobic004G178901 Sobic004G178901 Sobic004G148750--Sobic004G178901 Sobic007G214175 Sobic007G214175 Sobic004G148750--Sobic007G214175 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G148750--Sobic010G033700 Sobic002G330900 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Octagon: transcription factors


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