Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G067150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCR1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g49530.1 : OsFBX206 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G039600 U-box domain-containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G079800 transcriptional corepressor SEUSS, putative, expressed -
3 Sobic.001G172200 - -
4 Sobic.004G129300 chromatin modification-related protein EAF3, putative, expressed K11339: MORF4L1, MRG15, mortality factor 4-like protein 1
5 Sobic.006G067200 - -
6 Sobic.003G438900 FYVE zinc finger domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G102500 - -
8 Sobic.006G161000 CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.18 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K07359: calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2
9 Sobic.002G153700 SWP, putative, expressed K15156: MED14, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
10 Sobic.008G173100 actin, putative, expressed K11662: ACTR6, actin-related protein 6
11 Sobic.003G051700 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G207500 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G013500 hydrolase/ zinc ion binding protein, putative, expressed K15442: TAD3, tRNA-specific adenosine deaminase 3
14 Sobic.007G183300 expressed protein -
15 Sobic.006G222300 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.010G096000 OsDegp10 - Putative Deg protease homologue, expressed -
17 Sobic.002G067800 - -
18 Sobic.010G237900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G090430 - -
20 Sobic.010G235800 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G067150 Sobic006G067150 Sobic001G039600 Sobic001G039600 Sobic006G067150--Sobic001G039600 Sobic005G079800 Sobic005G079800 Sobic006G067150--Sobic005G079800 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic006G067150--Sobic001G172200 Sobic004G129300 Sobic004G129300 Sobic006G067150--Sobic004G129300 Sobic006G067200 Sobic006G067200 Sobic006G067150--Sobic006G067200 Sobic003G438900 Sobic003G438900 Sobic006G067150--Sobic003G438900 Sobic009G102500 Sobic009G102500 Sobic006G067150--Sobic009G102500 Sobic006G161000 Sobic006G161000 Sobic006G067150--Sobic006G161000 Sobic002G153700 Sobic002G153700 Sobic006G067150--Sobic002G153700 Sobic001G473600 Sobic001G473600 Sobic001G039600--Sobic001G473600 Sobic007G041300 Sobic007G041300 Sobic001G039600--Sobic007G041300 Sobic001G039600--Sobic005G079800 Sobic001G039600--Sobic003G438900 Sobic007G191700 Sobic007G191700 Sobic001G039600--Sobic007G191700 Sobic002G309800 Sobic002G309800 Sobic001G039600--Sobic002G309800 Sobic007G002900 Sobic007G002900 Sobic001G039600--Sobic007G002900 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic001G039600--Sobic009G000500 Sobic003G266001 Sobic003G266001 Sobic001G039600--Sobic003G266001 Sobic005G079800--Sobic003G438900 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic005G079800--Sobic001G253200 Sobic005G079800--Sobic007G191700 Sobic005G079800--Sobic002G153700 Sobic005G021500 Sobic005G021500 Sobic005G079800--Sobic005G021500 Sobic003G427100 Sobic003G427100 Sobic005G079800--Sobic003G427100 Sobic007G054400 Sobic007G054400 Sobic005G079800--Sobic007G054400 Sobic010G194700 Sobic010G194700 Sobic005G079800--Sobic010G194700 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic005G079800--Sobic004G096500 Sobic006G013500 Sobic006G013500 Sobic001G172200--Sobic006G013500 Sobic003G173950 Sobic003G173950 Sobic001G172200--Sobic003G173950 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G172200--Sobic006G080300 Sobic010G152850 Sobic010G152850 Sobic001G172200--Sobic010G152850 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G172200--Sobic001G306900 Sobic009G086900 Sobic009G086900 Sobic001G172200--Sobic009G086900 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G172200--Sobic003G170100 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G172200--Sobic001G303675 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic001G172200--Sobic006G072900 Sobic010G237900 Sobic010G237900 Sobic004G129300--Sobic010G237900 Sobic004G129300--Sobic007G191700 Sobic001G002600 Sobic001G002600 Sobic004G129300--Sobic001G002600 Sobic007G091600 Sobic007G091600 Sobic004G129300--Sobic007G091600 Sobic007G090430 Sobic007G090430 Sobic004G129300--Sobic007G090430 Sobic008G173100 Sobic008G173100 Sobic004G129300--Sobic008G173100 Sobic001G087600 Sobic001G087600 Sobic004G129300--Sobic001G087600 Sobic007G183300 Sobic007G183300 Sobic004G129300--Sobic007G183300 Sobic001G384300 Sobic001G384300 Sobic004G129300--Sobic001G384300 Sobic001G228700 Sobic001G228700 Sobic006G067200--Sobic001G228700 Sobic006G039900 Sobic006G039900 Sobic006G067200--Sobic006G039900 Sobic008G165100 Sobic008G165100 Sobic006G067200--Sobic008G165100 Sobic001G426900 Sobic001G426900 Sobic006G067200--Sobic001G426900 Sobic009G137900 Sobic009G137900 Sobic006G067200--Sobic009G137900 Sobic002G067800 Sobic002G067800 Sobic006G067200--Sobic002G067800 Sobic001G425000 Sobic001G425000 Sobic006G067200--Sobic001G425000 Sobic001G202266 Sobic001G202266 Sobic006G067200--Sobic001G202266 Sobic006G067200--Sobic007G002900 Sobic003G438900--Sobic005G079800 Sobic003G438900--Sobic002G153700 Sobic003G438900--Sobic003G427100 Sobic003G438900--Sobic007G191700 Sobic003G438900--Sobic007G054400 Sobic001G433300 Sobic001G433300 Sobic003G438900--Sobic001G433300 Sobic003G438900--Sobic007G041300 Sobic004G088200 Sobic004G088200 Sobic003G438900--Sobic004G088200 Sobic003G438900--Sobic001G253200 Sobic009G102500--Sobic003G170100 Sobic009G102500--Sobic003G173950 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic009G102500--Sobic002G144933 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic009G102500--Sobic007G096600 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic009G102500--Sobic002G157000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G102500--Sobic008G173900 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic009G102500--Sobic001G152320 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic009G102500--Sobic003G200200 Sobic001G356500 Sobic001G356500 Sobic009G102500--Sobic001G356500 Sobic003G038100 Sobic003G038100 Sobic006G161000--Sobic003G038100 Sobic004G049700 Sobic004G049700 Sobic006G161000--Sobic004G049700 Sobic001G405300 Sobic001G405300 Sobic006G161000--Sobic001G405300 Sobic006G186400 Sobic006G186400 Sobic006G161000--Sobic006G186400 Sobic010G077500 Sobic010G077500 Sobic006G161000--Sobic010G077500 Sobic007G026000 Sobic007G026000 Sobic006G161000--Sobic007G026000 Sobic003G114500 Sobic003G114500 Sobic006G161000--Sobic003G114500 Sobic004G180900 Sobic004G180900 Sobic006G161000--Sobic004G180900 Sobic007G146900 Sobic007G146900 Sobic006G161000--Sobic007G146900 Sobic002G071500 Sobic002G071500 Sobic002G153700--Sobic002G071500 Sobic005G207500 Sobic005G207500 Sobic002G153700--Sobic005G207500 Sobic008G009700 Sobic008G009700 Sobic002G153700--Sobic008G009700 Sobic010G065300 Sobic010G065300 Sobic002G153700--Sobic010G065300 Sobic009G119000 Sobic009G119000 Sobic002G153700--Sobic009G119000 Sobic003G307000 Sobic003G307000 Sobic002G153700--Sobic003G307000 Sobic002G264200 Sobic002G264200 Sobic002G153700--Sobic002G264200 Sobic010G069100 Sobic010G069100 Sobic002G153700--Sobic010G069100 Sobic002G153700--Sobic001G306900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.