Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G158000.2,Sobic.002G158000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QBM2 , A0A1B6QBL2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G139800 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
2 Sobic.005G201900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.004G215000 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G438500 POEI1 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
5 Sobic.002G023700 expressed protein -
6 Sobic.004G062100 A tissue specific expression in primordial inflorescences(PubMedID : 27501690)@OsSPL5 - SBP-box gene family member, expressed -
7 Sobic.005G042200 homeobox domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -
9 Sobic.004G227900 expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.002G416400 basic helix-loop-helix domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G215700 A tissue specific expression in primordial inflorescences(PubMedID : 27501690)@OsSPL10 - SBP-box gene family member, expressed -
12 Sobic.002G067500 ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
13 Sobic.008G187400 - -
14 Sobic.005G089700 expressed protein -
15 Sobic.002G251200 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed -
16 Sobic.008G012600 BTBA6 - Bric-a-Brac,Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Ankyrin repeat region, expressed K14508: regulatory protein NPR1
17 Sobic.010G077700 ZOS6-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.001G334501 - K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
19 Sobic.001G459700 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
20 Sobic.006G219100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G158000 Sobic002G158000 Sobic002G139800 Sobic002G139800 Sobic002G158000--Sobic002G139800 Sobic005G201900 Sobic005G201900 Sobic002G158000--Sobic005G201900 Sobic004G215000 Sobic004G215000 Sobic002G158000--Sobic004G215000 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic002G158000--Sobic001G438500 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic002G158000--Sobic002G023700 Sobic004G062100 Sobic004G062100 Sobic002G158000--Sobic004G062100 Sobic005G042200 Sobic005G042200 Sobic002G158000--Sobic005G042200 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic002G158000--Sobic009G254500 Sobic004G227900 Sobic004G227900 Sobic002G158000--Sobic004G227900 Sobic002G139800--Sobic001G438500 Sobic002G139800--Sobic004G062100 Sobic002G139800--Sobic009G254500 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic002G139800--Sobic002G011000 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic002G139800--Sobic007G189400 Sobic008G187400 Sobic008G187400 Sobic002G139800--Sobic008G187400 Sobic002G067500 Sobic002G067500 Sobic002G139800--Sobic002G067500 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic002G139800--Sobic002G072700 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic002G139800--Sobic009G141300 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic005G201900--Sobic005G089700 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic005G201900--Sobic001G334501 Sobic001G459700 Sobic001G459700 Sobic005G201900--Sobic001G459700 Sobic008G032400 Sobic008G032400 Sobic005G201900--Sobic008G032400 Sobic001G133200 Sobic001G133200 Sobic005G201900--Sobic001G133200 Sobic004G215000--Sobic001G438500 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic010G027700 Sobic004G215000--Sobic004G227900 Sobic001G179400 Sobic001G179400 Sobic004G215000--Sobic001G179400 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic004G215000--Sobic002G068400 Sobic004G215000--Sobic005G201900 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic004G215000--Sobic010G065700 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic004G215000--Sobic003G120600 Sobic008G004200 Sobic008G004200 Sobic004G215000--Sobic008G004200 Sobic001G438500--Sobic004G062100 Sobic010G215700 Sobic010G215700 Sobic001G438500--Sobic010G215700 Sobic001G438500--Sobic004G215000 Sobic001G438500--Sobic010G065700 Sobic001G438500--Sobic005G042200 Sobic001G438500--Sobic001G334501 Sobic002G047366 Sobic002G047366 Sobic001G438500--Sobic002G047366 Sobic001G438500--Sobic008G004200 Sobic002G251200 Sobic002G251200 Sobic001G438500--Sobic002G251200 Sobic002G023700--Sobic010G027700 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic002G023700--Sobic009G037300 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic002G023700--Sobic008G012600 Sobic002G023700--Sobic004G215000 Sobic002G023700--Sobic001G438500 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic002G023700--Sobic002G183800 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic002G023700--Sobic001G266100 Sobic002G023700--Sobic008G004200 Sobic002G023700--Sobic009G254500 Sobic004G062100--Sobic010G215700 Sobic004G062100--Sobic001G438500 Sobic004G062100--Sobic002G251200 Sobic004G062100--Sobic001G334501 Sobic001G438400 Sobic001G438400 Sobic004G062100--Sobic001G438400 Sobic006G267400 Sobic006G267400 Sobic004G062100--Sobic006G267400 Sobic004G062100--Sobic005G089700 Sobic007G037400 Sobic007G037400 Sobic004G062100--Sobic007G037400 Sobic006G006900 Sobic006G006900 Sobic004G062100--Sobic006G006900 Sobic005G042200--Sobic010G215700 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic005G042200--Sobic006G151800 Sobic002G380800 Sobic002G380800 Sobic005G042200--Sobic002G380800 Sobic002G410600 Sobic002G410600 Sobic005G042200--Sobic002G410600 Sobic003G038700 Sobic003G038700 Sobic005G042200--Sobic003G038700 Sobic005G042200--Sobic001G334501 Sobic003G038800 Sobic003G038800 Sobic005G042200--Sobic003G038800 Sobic005G042200--Sobic002G251200 Sobic009G046000 Sobic009G046000 Sobic005G042200--Sobic009G046000 Sobic009G254500--Sobic002G011000 Sobic009G254500--Sobic008G012600 Sobic009G254500--Sobic009G141300 Sobic001G119200 Sobic001G119200 Sobic009G254500--Sobic001G119200 Sobic009G254500--Sobic001G438500 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic009G254500--Sobic006G160800 Sobic010G077700 Sobic010G077700 Sobic009G254500--Sobic010G077700 Sobic009G254500--Sobic004G062100 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic009G254500--Sobic003G300400 Sobic004G227900--Sobic008G004200 Sobic004G227900--Sobic001G334501 Sobic010G053300 Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic010G053300 Sobic004G227900--Sobic005G089700 Sobic007G000600 Sobic007G000600 Sobic004G227900--Sobic007G000600 Sobic001G366000 Sobic001G366000 Sobic004G227900--Sobic001G366000 Sobic005G200700 Sobic005G200700 Sobic004G227900--Sobic005G200700 Sobic003G016000 Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic003G016000 Sobic004G227900--Sobic008G032400
Octagon: transcription factors


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