Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G286566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QDY3
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17070 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g06110.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047979
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G148400 Cupin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G299100 expressed protein -
3 Sobic.003G043550 - -
4 Sobic.009G116600 C2 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G499701 - -
6 Sobic.006G096000 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G356500 expressed protein -
8 Sobic.008G177400 strictosidine synthase, putative, expressed -
9 Sobic.007G085500 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
10 Sobic.002G281100 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G122866 - -
12 Sobic.007G079500 hypothetical protein -
13 Sobic.009G201400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
14 Sobic.001G293000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.004G299600 - -
16 Sobic.006G050800 expressed protein -
17 Sobic.008G137300 RALFL43 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
18 Sobic.009G035900 CHIT10 - Chitinase family protein precursor, expressed -
19 Sobic.004G180700 expressed protein -
20 Sobic.010G009900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G286566 Sobic002G286566 Sobic004G148400 Sobic004G148400 Sobic002G286566--Sobic004G148400 Sobic003G299100 Sobic003G299100 Sobic002G286566--Sobic003G299100 Sobic003G043550 Sobic003G043550 Sobic002G286566--Sobic003G043550 Sobic009G116600 Sobic009G116600 Sobic002G286566--Sobic009G116600 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic002G286566--Sobic001G499701 Sobic006G096000 Sobic006G096000 Sobic002G286566--Sobic006G096000 Sobic002G356500 Sobic002G356500 Sobic002G286566--Sobic002G356500 Sobic008G177400 Sobic008G177400 Sobic002G286566--Sobic008G177400 Sobic007G085500 Sobic007G085500 Sobic002G286566--Sobic007G085500 Sobic004G148400--Sobic002G286566 Sobic002G417101 Sobic002G417101 Sobic004G148400--Sobic002G417101 Sobic004G121500 Sobic004G121500 Sobic004G148400--Sobic004G121500 Sobic004G148400--Sobic001G499701 Sobic001G160500 Sobic001G160500 Sobic004G148400--Sobic001G160500 Sobic002G281100 Sobic002G281100 Sobic004G148400--Sobic002G281100 Sobic002G091700 Sobic002G091700 Sobic004G148400--Sobic002G091700 Sobic002G063566 Sobic002G063566 Sobic004G148400--Sobic002G063566 Sobic001G173251 Sobic001G173251 Sobic004G148400--Sobic001G173251 Sobic002G154900 Sobic002G154900 Sobic003G299100--Sobic002G154900 Sobic003G299100--Sobic002G286566 Sobic007G054900 Sobic007G054900 Sobic003G299100--Sobic007G054900 Sobic004G292600 Sobic004G292600 Sobic003G299100--Sobic004G292600 Sobic010G156400 Sobic010G156400 Sobic003G299100--Sobic010G156400 Sobic008G184700 Sobic008G184700 Sobic003G299100--Sobic008G184700 Sobic005G011900 Sobic005G011900 Sobic003G299100--Sobic005G011900 Sobic003G299100--Sobic009G116600 Sobic005G203700 Sobic005G203700 Sobic003G299100--Sobic005G203700 Sobic007G122866 Sobic007G122866 Sobic003G043550--Sobic007G122866 Sobic006G253700 Sobic006G253700 Sobic003G043550--Sobic006G253700 Sobic003G043550--Sobic002G286566 Sobic001G318800 Sobic001G318800 Sobic003G043550--Sobic001G318800 Sobic002G391501 Sobic002G391501 Sobic003G043550--Sobic002G391501 Sobic003G383400 Sobic003G383400 Sobic003G043550--Sobic003G383400 Sobic003G043550--Sobic003G299100 Sobic010G030600 Sobic010G030600 Sobic003G043550--Sobic010G030600 Sobic002G363466 Sobic002G363466 Sobic003G043550--Sobic002G363466 Sobic010G009900 Sobic010G009900 Sobic009G116600--Sobic010G009900 Sobic009G116600--Sobic008G177400 Sobic006G050800 Sobic006G050800 Sobic009G116600--Sobic006G050800 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic009G116600--Sobic002G301900 Sobic006G234466 Sobic006G234466 Sobic009G116600--Sobic006G234466 Sobic009G116600--Sobic007G054900 SobicK026900 SobicK026900 Sobic009G116600--SobicK026900 Sobic004G299600 Sobic004G299600 Sobic009G116600--Sobic004G299600 Sobic004G301600 Sobic004G301600 Sobic009G116600--Sobic004G301600 Sobic005G049350 Sobic005G049350 Sobic001G499701--Sobic005G049350 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic001G499701--Sobic003G176300 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic001G499701--Sobic007G149000 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic001G499701--Sobic005G216700 Sobic009G015200 Sobic009G015200 Sobic001G499701--Sobic009G015200 Sobic009G098000 Sobic009G098000 Sobic001G499701--Sobic009G098000 Sobic007G019900 Sobic007G019900 Sobic001G499701--Sobic007G019900 Sobic009G035900 Sobic009G035900 Sobic001G499701--Sobic009G035900 Sobic005G220740 Sobic005G220740 Sobic001G499701--Sobic005G220740 Sobic003G426600 Sobic003G426600 Sobic006G096000--Sobic003G426600 Sobic006G096000--Sobic006G234466 Sobic009G171500 Sobic009G171500 Sobic006G096000--Sobic009G171500 Sobic008G022000 Sobic008G022000 Sobic006G096000--Sobic008G022000 Sobic002G012300 Sobic002G012300 Sobic006G096000--Sobic002G012300 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic006G096000--Sobic010G045500 Sobic002G012500 Sobic002G012500 Sobic006G096000--Sobic002G012500 Sobic010G196000 Sobic010G196000 Sobic006G096000--Sobic010G196000 Sobic008G127933 Sobic008G127933 Sobic006G096000--Sobic008G127933 Sobic009G183800 Sobic009G183800 Sobic002G356500--Sobic009G183800 Sobic007G108700 Sobic007G108700 Sobic002G356500--Sobic007G108700 Sobic005G228400 Sobic005G228400 Sobic002G356500--Sobic005G228400 Sobic008G019900 Sobic008G019900 Sobic002G356500--Sobic008G019900 Sobic002G356500--Sobic002G281100 Sobic001G062500 Sobic001G062500 Sobic002G356500--Sobic001G062500 Sobic002G218800 Sobic002G218800 Sobic002G356500--Sobic002G218800 Sobic004G046400 Sobic004G046400 Sobic002G356500--Sobic004G046400 Sobic002G356500--Sobic009G035900 Sobic008G177400--Sobic009G116600 Sobic001G242000 Sobic001G242000 Sobic008G177400--Sobic001G242000 Sobic002G063800 Sobic002G063800 Sobic008G177400--Sobic002G063800 Sobic010G270700 Sobic010G270700 Sobic008G177400--Sobic010G270700 Sobic008G177400--Sobic006G234466 Sobic008G177400--Sobic006G050800 Sobic008G177400--Sobic010G009900 Sobic008G173601 Sobic008G173601 Sobic008G177400--Sobic008G173601 Sobic008G009400 Sobic008G009400 Sobic008G177400--Sobic008G009400 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic007G085500--Sobic003G400900 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic007G085500--Sobic010G128400 Sobic004G066700 Sobic004G066700 Sobic007G085500--Sobic004G066700 Sobic007G126800 Sobic007G126800 Sobic007G085500--Sobic007G126800 Sobic002G003700 Sobic002G003700 Sobic007G085500--Sobic002G003700 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic007G085500--Sobic006G170600 Sobic002G392100 Sobic002G392100 Sobic007G085500--Sobic002G392100 Sobic010G128700 Sobic010G128700 Sobic007G085500--Sobic010G128700 Sobic007G085500--Sobic004G299600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.