Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G356500.1
Synonym ZCF37, Sb02g037790
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QF99
Pfam -
Panther DB PTHR35275 PTHR35275:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G59590 : ZCF37
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g39720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048548 , Zm00025a015042
Brachypodium KQK15484
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G183800 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G108700 expressed protein -
3 Sobic.005G228400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.008G019900 - -
5 Sobic.002G281100 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G062500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@aldehyde oxidase, putative, expressed K11817: indole-3-acetaldehyde oxidase
7 Sobic.002G218800 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.004G046400 rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G035900 CHIT10 - Chitinase family protein precursor, expressed -
10 Sobic.007G090469 - -
11 Sobic.008G137300 RALFL43 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
12 Sobic.003G121100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.006G202600 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@immutans protein, putative, expressed K17893: AOX1, ubiquinol oxidase
14 Sobic.006G274933 - -
15 Sobic.004G209400 carbonyl reductase 3, putative, expressed -
16 Sobic.001G508532 - -
17 Sobic.010G267100 zinc finger family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G311800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@xylosyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.001G108800 expressed protein -
20 Sobic.010G128400 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase


Gene co-expression network
sample Sobic002G356500 Sobic002G356500 Sobic009G183800 Sobic009G183800 Sobic002G356500--Sobic009G183800 Sobic007G108700 Sobic007G108700 Sobic002G356500--Sobic007G108700 Sobic005G228400 Sobic005G228400 Sobic002G356500--Sobic005G228400 Sobic008G019900 Sobic008G019900 Sobic002G356500--Sobic008G019900 Sobic002G281100 Sobic002G281100 Sobic002G356500--Sobic002G281100 Sobic001G062500 Sobic001G062500 Sobic002G356500--Sobic001G062500 Sobic002G218800 Sobic002G218800 Sobic002G356500--Sobic002G218800 Sobic004G046400 Sobic004G046400 Sobic002G356500--Sobic004G046400 Sobic009G035900 Sobic009G035900 Sobic002G356500--Sobic009G035900 Sobic010G212500 Sobic010G212500 Sobic009G183800--Sobic010G212500 Sobic005G215400 Sobic005G215400 Sobic009G183800--Sobic005G215400 Sobic004G348800 Sobic004G348800 Sobic009G183800--Sobic004G348800 Sobic001G379400 Sobic001G379400 Sobic009G183800--Sobic001G379400 Sobic003G119500 Sobic003G119500 Sobic009G183800--Sobic003G119500 Sobic002G301900 Sobic002G301900 Sobic009G183800--Sobic002G301900 Sobic010G045500 Sobic010G045500 Sobic009G183800--Sobic010G045500 Sobic006G089000 Sobic006G089000 Sobic009G183800--Sobic006G089000 Sobic004G297900 Sobic004G297900 Sobic009G183800--Sobic004G297900 Sobic004G011100 Sobic004G011100 Sobic007G108700--Sobic004G011100 Sobic003G139300 Sobic003G139300 Sobic007G108700--Sobic003G139300 Sobic003G368600 Sobic003G368600 Sobic007G108700--Sobic003G368600 Sobic001G021900 Sobic001G021900 Sobic007G108700--Sobic001G021900 Sobic007G108700--Sobic002G356500 Sobic001G075300 Sobic001G075300 Sobic007G108700--Sobic001G075300 Sobic002G235500 Sobic002G235500 Sobic007G108700--Sobic002G235500 Sobic010G204200 Sobic010G204200 Sobic007G108700--Sobic010G204200 Sobic003G024900 Sobic003G024900 Sobic007G108700--Sobic003G024900 Sobic005G228400--Sobic009G035900 Sobic005G127400 Sobic005G127400 Sobic005G228400--Sobic005G127400 Sobic001G318300 Sobic001G318300 Sobic005G228400--Sobic001G318300 Sobic003G132400 Sobic003G132400 Sobic005G228400--Sobic003G132400 Sobic003G349400 Sobic003G349400 Sobic005G228400--Sobic003G349400 Sobic006G101900 Sobic006G101900 Sobic005G228400--Sobic006G101900 Sobic006G225500 Sobic006G225500 Sobic005G228400--Sobic006G225500 Sobic002G003700 Sobic002G003700 Sobic005G228400--Sobic002G003700 Sobic010G127800 Sobic010G127800 Sobic005G228400--Sobic010G127800 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic008G019900--Sobic003G240400 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic008G019900--Sobic006G019700 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic008G019900--Sobic006G028500 Sobic003G182200 Sobic003G182200 Sobic008G019900--Sobic003G182200 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic008G019900--Sobic004G322800 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic008G019900--Sobic010G148800 Sobic010G152400 Sobic010G152400 Sobic008G019900--Sobic010G152400 Sobic008G034900 Sobic008G034900 Sobic008G019900--Sobic008G034900 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic008G019900--Sobic010G082000 Sobic006G250400 Sobic006G250400 Sobic002G281100--Sobic006G250400 Sobic001G277600 Sobic001G277600 Sobic002G281100--Sobic001G277600 Sobic002G334200 Sobic002G334200 Sobic002G281100--Sobic002G334200 Sobic002G281100--Sobic002G356500 Sobic009G100100 Sobic009G100100 Sobic002G281100--Sobic009G100100 Sobic008G137300 Sobic008G137300 Sobic002G281100--Sobic008G137300 Sobic010G130400 Sobic010G130400 Sobic002G281100--Sobic010G130400 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic002G281100--Sobic001G499701 Sobic003G240500 Sobic003G240500 Sobic002G281100--Sobic003G240500 Sobic006G273300 Sobic006G273300 Sobic001G062500--Sobic006G273300 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic001G062500--Sobic003G140700 Sobic004G209400 Sobic004G209400 Sobic001G062500--Sobic004G209400 Sobic006G274933 Sobic006G274933 Sobic001G062500--Sobic006G274933 Sobic001G062500--Sobic006G225500 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic001G062500--Sobic002G183700 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic001G062500--Sobic001G438200 Sobic002G255000 Sobic002G255000 Sobic001G062500--Sobic002G255000 Sobic007G090469 Sobic007G090469 Sobic001G062500--Sobic007G090469 Sobic010G128400 Sobic010G128400 Sobic002G218800--Sobic010G128400 Sobic001G237800 Sobic001G237800 Sobic002G218800--Sobic001G237800 Sobic003G121100 Sobic003G121100 Sobic002G218800--Sobic003G121100 Sobic003G400900 Sobic003G400900 Sobic002G218800--Sobic003G400900 Sobic002G218800--Sobic006G225500 Sobic002G218800--Sobic003G140700 Sobic006G170600 Sobic006G170600 Sobic002G218800--Sobic006G170600 Sobic002G218800--Sobic002G255000 Sobic002G218800--Sobic001G438200 Sobic002G379700 Sobic002G379700 Sobic004G046400--Sobic002G379700 Sobic003G249500 Sobic003G249500 Sobic004G046400--Sobic003G249500 Sobic002G168400 Sobic002G168400 Sobic004G046400--Sobic002G168400 Sobic004G046400--Sobic002G356500 Sobic004G046400--Sobic009G183800 Sobic003G212300 Sobic003G212300 Sobic004G046400--Sobic003G212300 Sobic004G106500 Sobic004G106500 Sobic004G046400--Sobic004G106500 Sobic004G046400--Sobic008G019900 Sobic004G037100 Sobic004G037100 Sobic004G046400--Sobic004G037100 Sobic009G035900--Sobic001G237800 Sobic009G035900--Sobic005G127400 Sobic006G150100 Sobic006G150100 Sobic009G035900--Sobic006G150100 Sobic009G035900--Sobic003G349400 Sobic009G035900--Sobic003G132400 Sobic009G035900--Sobic006G170600 Sobic008G121900 Sobic008G121900 Sobic009G035900--Sobic008G121900 Sobic009G035900--Sobic002G003700 Sobic010G162800 Sobic010G162800 Sobic009G035900--Sobic010G162800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.