Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G368901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W730
Pfam -
Panther DB PTHR33333 PTHR33333:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a015160
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G183300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.003G121000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.001G169400 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G109300 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G121700 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G183750 - -
7 Sobic.007G094300 tetraspanin family protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G070400 DNA binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G369000 expressed protein -
10 Sobic.007G014200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.009G150500 expressed protein -
12 Sobic.005G166700 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G028100 GDP-mannose 4,6 dehydratase 2, putative, expressed K01711: gmd, GDPmannose 4,6-dehydratase
14 Sobic.006G103300 wound/stress protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G090460 - K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
16 Sobic.008G135300 thaumatin family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G016000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
18 Sobic.010G268600 expressed protein -
19 Sobic.008G068300 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G271800 WRKY66, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G368901 Sobic002G368901 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic002G368901--Sobic003G183300 Sobic003G121000 Sobic003G121000 Sobic002G368901--Sobic003G121000 Sobic001G169400 Sobic001G169400 Sobic002G368901--Sobic001G169400 Sobic008G109300 Sobic008G109300 Sobic002G368901--Sobic008G109300 Sobic004G121700 Sobic004G121700 Sobic002G368901--Sobic004G121700 Sobic002G183750 Sobic002G183750 Sobic002G368901--Sobic002G183750 Sobic007G094300 Sobic007G094300 Sobic002G368901--Sobic007G094300 Sobic010G070400 Sobic010G070400 Sobic002G368901--Sobic010G070400 Sobic002G369000 Sobic002G369000 Sobic002G368901--Sobic002G369000 Sobic004G271800 Sobic004G271800 Sobic003G183300--Sobic004G271800 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic003G183300--Sobic002G146000 Sobic003G000100 Sobic003G000100 Sobic003G183300--Sobic003G000100 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic003G183300--Sobic010G028100 Sobic006G003100 Sobic006G003100 Sobic003G183300--Sobic006G003100 Sobic006G092700 Sobic006G092700 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Sobic002G369000--Sobic003G082700 Sobic008G016000 Sobic008G016000 Sobic002G369000--Sobic008G016000 Sobic001G232200 Sobic001G232200 Sobic002G369000--Sobic001G232200 Sobic002G003500 Sobic002G003500 Sobic002G369000--Sobic002G003500
Octagon: transcription factors


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