Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G268600.1
Synonym Sb10g030360
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z1X6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G061700 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
2 Sobic.008G035700 glycosyltransferase, putative, expressed K08238: xyloglucan 6-xylosyltransferase
3 Sobic.007G014200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
4 Sobic.010G070400 DNA binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G368901 - -
6 Sobic.008G068300 transferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G029300 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
8 Sobic.005G110406 - K16223: protein FLOWERING LOCUS T
9 Sobic.001G514700 "Cytochrome P450, family 78,"("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.001G008900 - -
11 Sobic.002G183750 - -
12 Sobic.001G086000 COBRA, putative, expressed -
13 Sobic.007G094300 tetraspanin family protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G096700 leaf senescence related protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G307700 expressed protein -
16 Sobic.008G109300 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G121700 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.010G135100 expressed protein -
19 Sobic.008G048400 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G090460 - K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase


Gene co-expression network
sample Sobic010G268600 Sobic010G268600 Sobic006G061700 Sobic006G061700 Sobic010G268600--Sobic006G061700 Sobic008G035700 Sobic008G035700 Sobic010G268600--Sobic008G035700 Sobic007G014200 Sobic007G014200 Sobic010G268600--Sobic007G014200 Sobic010G070400 Sobic010G070400 Sobic010G268600--Sobic010G070400 Sobic002G368901 Sobic002G368901 Sobic010G268600--Sobic002G368901 Sobic008G068300 Sobic008G068300 Sobic010G268600--Sobic008G068300 Sobic004G029300 Sobic004G029300 Sobic010G268600--Sobic004G029300 Sobic005G110406 Sobic005G110406 Sobic010G268600--Sobic005G110406 Sobic001G514700 Sobic001G514700 Sobic010G268600--Sobic001G514700 Sobic006G061700--Sobic010G268600 Sobic008G048400 Sobic008G048400 Sobic006G061700--Sobic008G048400 Sobic006G061700--Sobic008G035700 Sobic005G089200 Sobic005G089200 Sobic006G061700--Sobic005G089200 Sobic007G110366 Sobic007G110366 Sobic006G061700--Sobic007G110366 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic006G061700--Sobic001G026300 Sobic002G165020 Sobic002G165020 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Sobic001G514700--Sobic005G175900 Sobic001G514700--Sobic010G070400 Sobic002G029600 Sobic002G029600 Sobic001G514700--Sobic002G029600
Octagon: transcription factors


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