Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G416200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5X4Z2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G073150 - -
2 Sobic.003G001500 expressed protein -
3 Sobic.004G074200 abhydrolase domain-containing protein FAM108C1, putative, expressed -
4 Sobic.005G114600 tyrosine aminotransferase, putative, expressed K03263: translation initiation factor 5A
5 Sobic.007G072800 OsFBX275 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G034400 expressed protein -
7 Sobic.004G038000 expressed protein -
8 Sobic.003G221300 - -
9 Sobic.010G153532 - -
10 Sobic.006G260600 OTU-like cysteine protease family protein, putative, expressed K13717: OTU domain-containing protein 3
11 Sobic.002G018901 - -
12 Sobic.005G097700 - -
13 Sobic.001G451200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@PPR repeat containing protein, expressed -
14 Sobic.001G267266 - -
15 Sobic.004G269900 "GS2/GL2(Ortholog in rice:Che et al., 2015(PubMedID : 31659888)@growth-regulating factor, putative, expressed -
16 Sobic.007G085350 - -
17 Sobic.006G228400 kinase, putative, expressed -
18 Sobic.003G048700 AGC_PVPK_like_kin82y.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
19 Sobic.009G114600 OsSigP6 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed K03100: signal peptidase I
20 Sobic.002G120200 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G416200 Sobic002G416200 Sobic006G073150 Sobic006G073150 Sobic002G416200--Sobic006G073150 Sobic003G001500 Sobic003G001500 Sobic002G416200--Sobic003G001500 Sobic004G074200 Sobic004G074200 Sobic002G416200--Sobic004G074200 Sobic005G114600 Sobic005G114600 Sobic002G416200--Sobic005G114600 Sobic007G072800 Sobic007G072800 Sobic002G416200--Sobic007G072800 Sobic002G034400 Sobic002G034400 Sobic002G416200--Sobic002G034400 Sobic004G038000 Sobic004G038000 Sobic002G416200--Sobic004G038000 Sobic003G221300 Sobic003G221300 Sobic002G416200--Sobic003G221300 Sobic010G153532 Sobic010G153532 Sobic002G416200--Sobic010G153532 Sobic001G451200 Sobic001G451200 Sobic006G073150--Sobic001G451200 Sobic006G073150--Sobic007G072800 Sobic006G073150--Sobic002G416200 Sobic001G267266 Sobic001G267266 Sobic006G073150--Sobic001G267266 Sobic003G048700 Sobic003G048700 Sobic006G073150--Sobic003G048700 Sobic003G290600 Sobic003G290600 Sobic006G073150--Sobic003G290600 Sobic002G018901 Sobic002G018901 Sobic006G073150--Sobic002G018901 Sobic002G120200 Sobic002G120200 Sobic006G073150--Sobic002G120200 Sobic006G073150--Sobic010G153532 Sobic003G001500--Sobic002G416200 Sobic001G084600 Sobic001G084600 Sobic003G001500--Sobic001G084600 Sobic003G001500--Sobic006G073150 Sobic003G001500--Sobic003G221300 Sobic003G001500--Sobic004G074200 Sobic003G001500--Sobic010G153532 Sobic003G001500--Sobic007G072800 Sobic006G004000 Sobic006G004000 Sobic003G001500--Sobic006G004000 Sobic002G302100 Sobic002G302100 Sobic003G001500--Sobic002G302100 Sobic009G114600 Sobic009G114600 Sobic004G074200--Sobic009G114600 Sobic004G074200--Sobic010G153532 Sobic004G074200--Sobic003G221300 Sobic005G097700 Sobic005G097700 Sobic004G074200--Sobic005G097700 Sobic004G074200--Sobic002G034400 Sobic007G085350 Sobic007G085350 Sobic004G074200--Sobic007G085350 Sobic002G175550 Sobic002G175550 Sobic004G074200--Sobic002G175550 Sobic004G074200--Sobic002G416200 Sobic003G219400 Sobic003G219400 Sobic004G074200--Sobic003G219400 Sobic003G328400 Sobic003G328400 Sobic005G114600--Sobic003G328400 Sobic005G114600--Sobic006G073150 Sobic005G114600--Sobic002G416200 Sobic006G146900 Sobic006G146900 Sobic005G114600--Sobic006G146900 Sobic001G374800 Sobic001G374800 Sobic005G114600--Sobic001G374800 Sobic006G066000 Sobic006G066000 Sobic005G114600--Sobic006G066000 Sobic005G112632 Sobic005G112632 Sobic005G114600--Sobic005G112632 Sobic003G257200 Sobic003G257200 Sobic005G114600--Sobic003G257200 Sobic008G090300 Sobic008G090300 Sobic005G114600--Sobic008G090300 Sobic007G072800--Sobic006G073150 Sobic002G108600 Sobic002G108600 Sobic007G072800--Sobic002G108600 Sobic007G072800--Sobic003G221300 Sobic007G072800--Sobic001G451200 Sobic003G060400 Sobic003G060400 Sobic007G072800--Sobic003G060400 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic007G072800--Sobic006G204200 Sobic009G213300 Sobic009G213300 Sobic007G072800--Sobic009G213300 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic007G072800--Sobic010G146200 Sobic006G249000 Sobic006G249000 Sobic007G072800--Sobic006G249000 Sobic004G356600 Sobic004G356600 Sobic002G034400--Sobic004G356600 Sobic002G034400--Sobic005G097700 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic002G034400--Sobic002G356700 Sobic006G228400 Sobic006G228400 Sobic002G034400--Sobic006G228400 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic002G034400--Sobic002G052500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic002G034400--Sobic006G090201 Sobic006G260600 Sobic006G260600 Sobic002G034400--Sobic006G260600 Sobic002G004400 Sobic002G004400 Sobic002G034400--Sobic002G004400 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic002G034400--Sobic003G245700 Sobic004G038000--Sobic004G074200 Sobic004G038000--Sobic002G416200 Sobic004G038000--Sobic007G085350 Sobic002G018600 Sobic002G018600 Sobic004G038000--Sobic002G018600 Sobic002G056600 Sobic002G056600 Sobic004G038000--Sobic002G056600 Sobic010G257400 Sobic010G257400 Sobic004G038000--Sobic010G257400 Sobic004G038000--Sobic007G072800 Sobic004G038000--Sobic009G114600 Sobic005G121100 Sobic005G121100 Sobic004G038000--Sobic005G121100 Sobic003G221300--Sobic005G097700 Sobic003G221300--Sobic002G004400 Sobic003G221300--Sobic001G267266 Sobic003G221300--Sobic002G175550 Sobic007G210400 Sobic007G210400 Sobic003G221300--Sobic007G210400 Sobic003G221300--Sobic002G034400 Sobic003G221300--Sobic006G228400 Sobic010G145200 Sobic010G145200 Sobic003G221300--Sobic010G145200 Sobic003G221300--Sobic007G085350 Sobic010G153532--Sobic004G074200 Sobic010G153532--Sobic009G114600 Sobic010G153532--Sobic002G175550 Sobic010G153532--Sobic006G004000 Sobic010G153532--Sobic005G097700 Sobic010G153532--Sobic003G219400 Sobic010G153532--Sobic006G073150 Sobic010G153532--Sobic001G451200 Sobic010G153532--Sobic003G221300
Octagon: transcription factors


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