Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G018901.2,Sobic.002G018901.1,Sobic.002G018901.3
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1V3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G060400 transcription regulator, putative, expressed -
3 Sobic.004G193800 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed K14759: isochorismate synthase / 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase / 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase / O-succinylbenzoate synthase
4 Sobic.003G048700 AGC_PVPK_like_kin82y.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
5 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
6 Sobic.004G286900 - -
7 Sobic.002G297800 growth regulating factor protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G063300 - -
9 Sobic.006G073150 - -
10 Sobic.002G050500 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
11 Sobic.003G128600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein, putative, expressed K09527: DnaJ homolog subfamily C member 7
12 Sobic.004G289500 - -
13 Sobic.007G116400 - -
14 Sobic.006G004000 - -
15 Sobic.003G424100 sulfotransferase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G109101 - -
17 Sobic.002G056600 START domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G011500 expressed protein -
19 Sobic.002G073300 - -
20 Sobic.003G152500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G018901 Sobic002G018901 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic002G018901--Sobic008G068800 Sobic003G060400 Sobic003G060400 Sobic002G018901--Sobic003G060400 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic002G018901--Sobic004G193800 Sobic003G048700 Sobic003G048700 Sobic002G018901--Sobic003G048700 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic002G018901--Sobic009G059600 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic002G018901--Sobic004G286900 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic002G018901--Sobic002G297800 Sobic006G063300 Sobic006G063300 Sobic002G018901--Sobic006G063300 Sobic006G073150 Sobic006G073150 Sobic002G018901--Sobic006G073150 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic003G060400--Sobic006G204200 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G060400--Sobic001G046600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic003G060400--Sobic009G045700 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G060400--Sobic007G073400 Sobic003G060400--Sobic002G297800 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G060400--Sobic004G212800 Sobic009G114600 Sobic009G114600 Sobic003G060400--Sobic009G114600 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic003G060400--Sobic003G057800 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic003G060400--Sobic004G164600 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic004G193800--Sobic003G185250 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic004G193800--Sobic004G016500 Sobic004G193800--Sobic003G424100 Sobic004G193800--Sobic008G068800 Sobic007G099500 Sobic007G099500 Sobic004G193800--Sobic007G099500 Sobic003G023400 Sobic003G023400 Sobic004G193800--Sobic003G023400 Sobic004G240900 Sobic004G240900 Sobic004G193800--Sobic004G240900 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic010G208500 Sobic004G193800--Sobic004G169501 Sobic003G048700--Sobic002G018901 Sobic003G048700--Sobic006G073150 Sobic003G349800 Sobic003G349800 Sobic003G048700--Sobic003G349800 Sobic004G225400 Sobic004G225400 Sobic003G048700--Sobic004G225400 Sobic007G072800 Sobic007G072800 Sobic003G048700--Sobic007G072800 Sobic001G451200 Sobic001G451200 Sobic003G048700--Sobic001G451200 Sobic006G004000 Sobic006G004000 Sobic003G048700--Sobic006G004000 Sobic001G267266 Sobic001G267266 Sobic003G048700--Sobic001G267266 Sobic006G086900 Sobic006G086900 Sobic003G048700--Sobic006G086900 Sobic009G059600--Sobic004G164600 Sobic009G059600--Sobic007G099500 Sobic009G059600--Sobic004G212800 Sobic009G059600--Sobic007G073400 Sobic009G059600--Sobic008G068800 Sobic003G128600 Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G128600 Sobic009G059600--Sobic003G424100 Sobic009G059600--Sobic007G142050 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic009G059600--Sobic004G076732 Sobic004G286900--Sobic008G068800 Sobic007G121400 Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic007G121400 Sobic004G286900--Sobic009G059600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G115000 Sobic004G286900--Sobic007G142050 Sobic004G286900--Sobic003G424100 Sobic004G286900--Sobic004G164600 Sobic004G286900--Sobic003G128600 Sobic004G286900--Sobic004G076732 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic002G297800--Sobic002G049000 Sobic002G297800--Sobic003G204000 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G297800--Sobic002G061400 Sobic002G297800--Sobic008G068800 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic002G297800--Sobic009G231300 Sobic009G257300 Sobic009G257300 Sobic002G297800--Sobic009G257300 Sobic002G297800--Sobic004G212800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic002G297800--Sobic002G313300 Sobic002G297800--Sobic009G059600 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic006G063300--Sobic004G112500 Sobic006G063300--Sobic007G142050 Sobic006G063300--Sobic001G024200 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic006G063300--Sobic007G089600 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic006G063300--Sobic001G272000 Sobic006G063300--Sobic008G068800 Sobic002G346600 Sobic002G346600 Sobic006G063300--Sobic002G346600 Sobic006G063300--Sobic003G204000 Sobic006G063300--Sobic009G059600 Sobic006G073150--Sobic001G451200 Sobic006G073150--Sobic007G072800 Sobic002G416200 Sobic002G416200 Sobic006G073150--Sobic002G416200 Sobic006G073150--Sobic001G267266 Sobic006G073150--Sobic003G048700 Sobic003G290600 Sobic003G290600 Sobic006G073150--Sobic003G290600 Sobic006G073150--Sobic002G018901 Sobic002G120200 Sobic002G120200 Sobic006G073150--Sobic002G120200 Sobic010G153532 Sobic010G153532 Sobic006G073150--Sobic010G153532
Octagon: transcription factors


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