Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G060400.1
Synonym Sb03g005180
Functional annotation transcription regulator, putative, expressed
UniProt C5XP66
Pfam PF04504
Panther DB PTHR31662 PTHR31662:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G28040 : DNA-binding storekeeper protein-related transcriptional regulator
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g14720.1 : transcription regulator, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023918
Brachypodium KQK03598
Barley HORVU5Hr1G051570.1 , HORVU5Hr1G051570.3 , HORVU5Hr1G051570.2 , HORVU5Hr1G051570.4 , HORVU3Hr1G034150.4 , HORVU3Hr1G034150.5 , HORVU3Hr1G034150.6 , HORVU3Hr1G034150.3
Wheat TraesCS3B02G200500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G060400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G060400 Sobic003G060400 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic003G060400--Sobic006G204200 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G060400--Sobic001G046600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic003G060400--Sobic009G045700 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G060400--Sobic007G073400 Sobic002G297800 Sobic002G297800 Sobic003G060400--Sobic002G297800 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G060400--Sobic004G212800 Sobic009G114600 Sobic009G114600 Sobic003G060400--Sobic009G114600 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic003G060400--Sobic003G057800 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic003G060400--Sobic004G164600 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic006G204200--Sobic002G376800 Sobic006G204200--Sobic003G057800 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic006G204200--Sobic001G479500 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic006G204200--Sobic004G016500 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic006G204200--Sobic004G315800 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic006G204200--Sobic002G330400 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic006G204200--Sobic008G161401 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic006G204200--Sobic004G020401 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic006G204200--Sobic010G248200 Sobic001G046600--Sobic004G016500 Sobic001G046600--Sobic004G212800 Sobic001G046600--Sobic004G164600 Sobic001G046600--Sobic007G073400 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic001G046600--Sobic003G424100 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic001G046600--Sobic004G112500 Sobic008G167300 Sobic008G167300 Sobic001G046600--Sobic008G167300 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G046600--Sobic008G157950 Sobic008G176732 Sobic008G176732 Sobic001G046600--Sobic008G176732 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic009G045700--Sobic008G153600 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic002G049000 Sobic002G049000 Sobic002G297800--Sobic002G049000 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic002G297800--Sobic003G204000 Sobic002G061400 Sobic002G061400 Sobic002G297800--Sobic002G061400 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic002G297800--Sobic008G068800 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic002G297800--Sobic009G231300 Sobic009G257300 Sobic009G257300 Sobic002G297800--Sobic009G257300 Sobic002G297800--Sobic004G212800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic002G297800--Sobic002G313300 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic002G297800--Sobic009G059600 Sobic004G212800--Sobic007G073400 Sobic004G212800--Sobic004G164600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G212800--Sobic001G024200 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic004G212800--Sobic001G345333 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic004G212800--Sobic002G007250 Sobic004G212800--Sobic010G248200 Sobic004G212800--Sobic004G076732 Sobic004G212800--Sobic008G161401 Sobic004G212800--Sobic004G112500 Sobic004G074200 Sobic004G074200 Sobic009G114600--Sobic004G074200 Sobic010G153532 Sobic010G153532 Sobic009G114600--Sobic010G153532 Sobic009G114600--Sobic003G060400 Sobic010G242300 Sobic010G242300 Sobic009G114600--Sobic010G242300 Sobic003G144400 Sobic003G144400 Sobic009G114600--Sobic003G144400 Sobic002G103500 Sobic002G103500 Sobic009G114600--Sobic002G103500 Sobic007G017400 Sobic007G017400 Sobic009G114600--Sobic007G017400 Sobic001G056300 Sobic001G056300 Sobic009G114600--Sobic001G056300 Sobic009G114600--Sobic006G204200 Sobic003G057800--Sobic001G479500 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic003G057800--Sobic003G357500 Sobic003G057800--Sobic010G248200 Sobic003G057800--Sobic008G161401 Sobic003G057800--Sobic004G212800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic003G057800--Sobic005G130200 Sobic003G057800--Sobic007G073400 Sobic003G057800--Sobic004G016500 Sobic003G057800--Sobic001G046600 Sobic004G164600--Sobic004G212800 Sobic004G164600--Sobic005G110430 Sobic004G164600--Sobic007G073400 Sobic004G164600--Sobic008G042250 Sobic004G164600--Sobic008G157950 Sobic004G164600--Sobic001G345333 Sobic004G164600--Sobic002G007250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic004G164600--SobicK009900 Sobic004G164600--Sobic004G076732
Octagon: transcription factors


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