Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G004000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJB0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G084600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G153532 - -
3 Sobic.003G060400 transcription regulator, putative, expressed -
4 Sobic.006G073150 - -
5 Sobic.006G204200 putrescine-binding periplasmic protein-related, putative, expressed -
6 Sobic.006G019600 ribosomal protein L7Ae, putative, expressed K02936: RP-L7Ae, large subunit ribosomal protein L7Ae
7 Sobic.001G361900 ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
8 Sobic.010G060000 - -
9 Sobic.004G315800 ZOS2-17 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
10 Sobic.002G018901 - -
11 Sobic.003G048700 AGC_PVPK_like_kin82y.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
12 Sobic.002G104000 - -
13 Sobic.006G086900 pectinesterase, putative, expressed -
14 Sobic.008G105900 - -
15 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.008G067301 - -
17 Sobic.002G337300 expressed protein -
18 Sobic.009G114600 OsSigP6 - Putative Type I Signal Peptidase homologue@ employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed K03100: signal peptidase I
19 Sobic.001G267266 - -
20 Sobic.005G036700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G004000 Sobic006G004000 Sobic001G084600 Sobic001G084600 Sobic006G004000--Sobic001G084600 Sobic010G153532 Sobic010G153532 Sobic006G004000--Sobic010G153532 Sobic003G060400 Sobic003G060400 Sobic006G004000--Sobic003G060400 Sobic006G073150 Sobic006G073150 Sobic006G004000--Sobic006G073150 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic006G004000--Sobic006G204200 Sobic006G019600 Sobic006G019600 Sobic006G004000--Sobic006G019600 Sobic001G361900 Sobic001G361900 Sobic006G004000--Sobic001G361900 Sobic010G060000 Sobic010G060000 Sobic006G004000--Sobic010G060000 Sobic004G315800 Sobic004G315800 Sobic006G004000--Sobic004G315800 Sobic001G084600--Sobic006G004000 Sobic001G084600--Sobic006G204200 Sobic001G084600--Sobic004G315800 Sobic002G104000 Sobic002G104000 Sobic001G084600--Sobic002G104000 Sobic006G060200 Sobic006G060200 Sobic001G084600--Sobic006G060200 Sobic001G217700 Sobic001G217700 Sobic001G084600--Sobic001G217700 Sobic003G178700 Sobic003G178700 Sobic001G084600--Sobic003G178700 Sobic001G269300 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Octagon: transcription factors


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