Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G167800.1
Synonym
Functional annotation DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q3P0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37520.1 : DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047982 , Zm00025a014502
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.003G167800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G167632 - -
2 Sobic.003G057800 rho termination factor, N-terminal domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G479500 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K15891: NAD+-dependent farnesol dehydrogenase
4 Sobic.002G376800 EF hand family protein, putative -
5 Sobic.007G073400 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
6 Sobic.010G248200 KID-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G161401 - -
8 Sobic.009G110366 - -
9 Sobic.001G046600 cycloartenol-C-24-methyltransferase 1, putative, expressed -
10 Sobic.003G357500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
11 Sobic.004G016500 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G212800 - -
13 Sobic.003G107800 "thylakoid lumenal 17.9 kDa protein, chloroplast"(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
14 Sobic.004G164600 - -
15 Sobic.008G167300 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G130200 - -
17 Sobic.008G042250 - -
18 Sobic.008G157950 - -
19 Sobic.008G031350 - -
20 Sobic.001G345333 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G167800 Sobic003G167800 Sobic003G167632 Sobic003G167632 Sobic003G167800--Sobic003G167632 Sobic003G057800 Sobic003G057800 Sobic003G167800--Sobic003G057800 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic003G167800--Sobic001G479500 Sobic002G376800 Sobic002G376800 Sobic003G167800--Sobic002G376800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic003G167800--Sobic007G073400 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic003G167800--Sobic010G248200 Sobic008G161401 Sobic008G161401 Sobic003G167800--Sobic008G161401 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic003G167800--Sobic009G110366 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic003G167800--Sobic001G046600 Sobic003G167632--Sobic003G167800 Sobic003G167632--Sobic003G057800 Sobic003G167632--Sobic001G479500 Sobic005G076000 Sobic005G076000 Sobic003G167632--Sobic005G076000 Sobic003G167632--Sobic002G376800 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic003G167632--Sobic003G357500 Sobic003G167632--Sobic010G248200 Sobic007G132600 Sobic007G132600 Sobic003G167632--Sobic007G132600 Sobic003G107800 Sobic003G107800 Sobic003G167632--Sobic003G107800 Sobic003G057800--Sobic001G479500 Sobic003G057800--Sobic003G357500 Sobic003G057800--Sobic010G248200 Sobic003G057800--Sobic008G161401 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic003G057800--Sobic004G212800 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic003G057800--Sobic005G130200 Sobic003G057800--Sobic007G073400 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic003G057800--Sobic004G016500 Sobic003G057800--Sobic001G046600 Sobic001G479500--Sobic003G057800 Sobic001G479500--Sobic005G130200 Sobic001G479500--Sobic010G248200 Sobic001G479500--Sobic008G161401 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic001G479500--Sobic009G156000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic001G479500--Sobic001G543900 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic001G479500--Sobic005G187200 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic001G479500--Sobic002G283300 Sobic001G479500--Sobic004G212800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic002G376800--Sobic002G376900 Sobic002G376800--Sobic008G161401 Sobic010G050600 Sobic010G050600 Sobic002G376800--Sobic010G050600 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic002G376800--Sobic005G121800 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic002G376800--Sobic009G109450 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic002G376800--Sobic009G231300 Sobic002G376800--Sobic003G057800 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic002G376800--Sobic009G113600 Sobic006G204200 Sobic006G204200 Sobic002G376800--Sobic006G204200 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic010G248200--Sobic002G007250 Sobic001G345333 Sobic001G345333 Sobic010G248200--Sobic001G345333 Sobic010G248200--Sobic004G212800 Sobic010G248200--Sobic005G130200 Sobic002G253500 Sobic002G253500 Sobic010G248200--Sobic002G253500 Sobic010G248200--Sobic008G161401 Sobic002G108800 Sobic002G108800 Sobic010G248200--Sobic002G108800 Sobic001G243901 Sobic001G243901 Sobic010G248200--Sobic001G243901 Sobic010G218500 Sobic010G218500 Sobic010G248200--Sobic010G218500 Sobic008G161401--Sobic010G248200 Sobic008G161401--Sobic004G212800 Sobic008G161401--Sobic007G073400 Sobic008G161401--Sobic005G130200 Sobic008G161401--Sobic003G057800 Sobic008G161401--Sobic003G357500 Sobic008G161401--Sobic009G156000 Sobic008G161401--Sobic002G108800 Sobic008G161401--Sobic001G479500 Sobic009G110366--Sobic007G073400 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic004G020401 Sobic009G110366--Sobic009G109450 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic009G110366--Sobic003G258400 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G110366--Sobic006G196000 Sobic009G110366--Sobic004G143700 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic009G110366--Sobic004G291800 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G110366--Sobic009G180200 Sobic009G198900 Sobic009G198900 Sobic009G110366--Sobic009G198900 Sobic001G046600--Sobic004G016500 Sobic001G046600--Sobic004G212800 Sobic001G046600--Sobic004G164600 Sobic001G046600--Sobic007G073400 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic001G046600--Sobic003G424100 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic001G046600--Sobic004G112500 Sobic008G167300 Sobic008G167300 Sobic001G046600--Sobic008G167300 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G046600--Sobic008G157950 Sobic008G176732 Sobic008G176732 Sobic001G046600--Sobic008G176732
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.