Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G218450.2,Sobic.003G218450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYF3 , A0A1W0VYF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G255700 alcohol dehydrogenase GroES-like domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G136150 - -
3 Sobic.002G346100 - -
4 Sobic.001G243400 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.002G148550 - -
6 Sobic.004G252400 ASC1-like protein 2 (Os)(PubMedID : 27208977)@ASC1, putative, expressed K04710: CERS1_2_3_4, ceramide synthetase
7 Sobic.001G243500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.004G001000 transmembrane amino acid transporter protein, putative, expressed K15015: SLC32A, solute carrier family 32 (vesicular inhibitory amino acid transporter)
9 Sobic.003G436750 - -
10 Sobic.001G432800 -(PubMedID : 26976818)@phosphoenolpyruvate carboxykinase, putative, expressed K01610: E4.1.1.49, phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)
11 Sobic.003G436800 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.006G012900 sterol 3-beta-glucosyltransferase, putative, expressed K05841: sterol 3beta-glucosyltransferase
13 Sobic.004G273400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@oligopeptide transporter, putative, expressed -
14 Sobic.008G076300 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
15 Sobic.006G023900 vignain precursor, putative, expressed K16292: CEP, KDEL-tailed cysteine endopeptidase
16 Sobic.008G044500 zinc finger superfamily protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@expressed protein -
17 Sobic.008G062800 expressed protein -
18 Sobic.003G199101 - -
19 Sobic.002G044800 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.010G176101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G218450 Sobic003G218450 Sobic002G255700 Sobic002G255700 Sobic003G218450--Sobic002G255700 Sobic008G136150 Sobic008G136150 Sobic003G218450--Sobic008G136150 Sobic002G346100 Sobic002G346100 Sobic003G218450--Sobic002G346100 Sobic001G243400 Sobic001G243400 Sobic003G218450--Sobic001G243400 Sobic002G148550 Sobic002G148550 Sobic003G218450--Sobic002G148550 Sobic004G252400 Sobic004G252400 Sobic003G218450--Sobic004G252400 Sobic001G243500 Sobic001G243500 Sobic003G218450--Sobic001G243500 Sobic004G001000 Sobic004G001000 Sobic003G218450--Sobic004G001000 Sobic003G436750 Sobic003G436750 Sobic003G218450--Sobic003G436750 Sobic005G101500 Sobic005G101500 Sobic002G255700--Sobic005G101500 Sobic002G255700--Sobic004G252400 Sobic006G039700 Sobic006G039700 Sobic002G255700--Sobic006G039700 Sobic003G436800 Sobic003G436800 Sobic002G255700--Sobic003G436800 Sobic002G255700--Sobic001G243500 Sobic009G055100 Sobic009G055100 Sobic002G255700--Sobic009G055100 Sobic009G040900 Sobic009G040900 Sobic002G255700--Sobic009G040900 Sobic002G255700--Sobic001G243400 Sobic008G123100 Sobic008G123100 Sobic002G255700--Sobic008G123100 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G136150--Sobic001G355400 Sobic009G220250 Sobic009G220250 Sobic008G136150--Sobic009G220250 Sobic007G106050 Sobic007G106050 Sobic008G136150--Sobic007G106050 Sobic001G099400 Sobic001G099400 Sobic008G136150--Sobic001G099400 Sobic005G131400 Sobic005G131400 Sobic008G136150--Sobic005G131400 Sobic006G152400 Sobic006G152400 Sobic008G136150--Sobic006G152400 Sobic005G145950 Sobic005G145950 Sobic008G136150--Sobic005G145950 Sobic001G494650 Sobic001G494650 Sobic008G136150--Sobic001G494650 Sobic002G109800 Sobic002G109800 Sobic008G136150--Sobic002G109800 Sobic002G346100--Sobic001G243500 Sobic002G346100--Sobic001G243400 Sobic004G273400 Sobic004G273400 Sobic002G346100--Sobic004G273400 Sobic001G243600 Sobic001G243600 Sobic002G346100--Sobic001G243600 Sobic001G100700 Sobic001G100700 Sobic002G346100--Sobic001G100700 Sobic002G200300 Sobic002G200300 Sobic002G346100--Sobic002G200300 Sobic005G213200 Sobic005G213200 Sobic002G346100--Sobic005G213200 Sobic004G333150 Sobic004G333150 Sobic002G346100--Sobic004G333150 Sobic009G106800 Sobic009G106800 Sobic002G346100--Sobic009G106800 Sobic001G243400--Sobic002G346100 Sobic001G243400--Sobic001G243500 Sobic001G335600 Sobic001G335600 Sobic001G243400--Sobic001G335600 Sobic001G331301 Sobic001G331301 Sobic001G243400--Sobic001G331301 Sobic001G243400--Sobic004G273400 Sobic001G243400--Sobic001G100700 Sobic006G068300 Sobic006G068300 Sobic001G243400--Sobic006G068300 Sobic001G243400--Sobic005G213200 Sobic010G176101 Sobic010G176101 Sobic001G243400--Sobic010G176101 Sobic002G148550--Sobic009G220250 Sobic002G148550--Sobic002G109800 Sobic002G148550--Sobic007G106050 Sobic001G445850 Sobic001G445850 Sobic002G148550--Sobic001G445850 Sobic002G233100 Sobic002G233100 Sobic004G252400--Sobic002G233100 Sobic007G161400 Sobic007G161400 Sobic004G252400--Sobic007G161400 Sobic004G252400--Sobic003G436800 Sobic006G059700 Sobic006G059700 Sobic004G252400--Sobic006G059700 Sobic005G043000 Sobic005G043000 Sobic004G252400--Sobic005G043000 Sobic002G196100 Sobic002G196100 Sobic004G252400--Sobic002G196100 Sobic010G071900 Sobic010G071900 Sobic004G252400--Sobic010G071900 Sobic002G312900 Sobic002G312900 Sobic004G252400--Sobic002G312900 Sobic010G272300 Sobic010G272300 Sobic004G252400--Sobic010G272300 Sobic001G243500--Sobic004G273400 Sobic001G243500--Sobic001G243600 Sobic001G243500--Sobic001G100700 Sobic001G243500--Sobic005G213200 Sobic001G243500--Sobic002G346100 Sobic001G243500--Sobic009G106800 Sobic001G243500--Sobic001G243400 Sobic001G243500--Sobic002G200300 Sobic001G243500--Sobic001G331301 Sobic004G001000--Sobic002G233100 Sobic004G001000--Sobic005G043000 Sobic008G128900 Sobic008G128900 Sobic004G001000--Sobic008G128900 Sobic004G001000--Sobic002G312900 Sobic006G125100 Sobic006G125100 Sobic004G001000--Sobic006G125100 Sobic010G151200 Sobic010G151200 Sobic004G001000--Sobic010G151200 Sobic002G320800 Sobic002G320800 Sobic004G001000--Sobic002G320800 Sobic004G001000--Sobic007G161400 Sobic010G110800 Sobic010G110800 Sobic004G001000--Sobic010G110800 Sobic002G065500 Sobic002G065500 Sobic003G436750--Sobic002G065500 Sobic003G436750--Sobic001G099400 Sobic002G065600 Sobic002G065600 Sobic003G436750--Sobic002G065600 Sobic002G065800 Sobic002G065800 Sobic003G436750--Sobic002G065800 Sobic008G182400 Sobic008G182400 Sobic003G436750--Sobic008G182400 Sobic006G117400 Sobic006G117400 Sobic003G436750--Sobic006G117400 Sobic005G126100 Sobic005G126100 Sobic003G436750--Sobic005G126100 Sobic010G172800 Sobic010G172800 Sobic003G436750--Sobic010G172800 Sobic004G197100 Sobic004G197100 Sobic003G436750--Sobic004G197100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.