Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G289200.1
Synonym Sb03g033980
Functional annotation 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed
UniProt C5XJ64
Pfam PF01612
Panther DB PTHR13620 PTHR13620:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008408; 3'-5' exonuclease activity GO:0006139nucleobase-containing compound metabolic process GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13870 : Werner syndrome-like exonuclease
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g14810.1 : 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027679
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G185100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G289200 Sobic003G289200 Sobic003G085566 Sobic003G085566 Sobic003G289200--Sobic003G085566 Sobic007G217900 Sobic007G217900 Sobic003G289200--Sobic007G217900 Sobic003G295500 Sobic003G295500 Sobic003G289200--Sobic003G295500 Sobic004G028700 Sobic004G028700 Sobic003G289200--Sobic004G028700 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic003G289200--Sobic008G043800 Sobic004G058800 Sobic004G058800 Sobic003G289200--Sobic004G058800 Sobic001G153900 Sobic001G153900 Sobic003G289200--Sobic001G153900 Sobic001G079401 Sobic001G079401 Sobic003G289200--Sobic001G079401 Sobic009G041200 Sobic009G041200 Sobic003G289200--Sobic009G041200 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic003G085566--Sobic001G112550 Sobic002G018800 Sobic002G018800 Sobic003G085566--Sobic002G018800 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic003G085566--Sobic007G050750 Sobic003G148950 Sobic003G148950 Sobic003G085566--Sobic003G148950 Sobic001G334800 Sobic001G334800 Sobic003G085566--Sobic001G334800 Sobic005G161750 Sobic005G161750 Sobic003G085566--Sobic005G161750 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic003G085566--Sobic010G003800 Sobic006G060400 Sobic006G060400 Sobic003G085566--Sobic006G060400 Sobic007G050650 Sobic007G050650 Sobic003G085566--Sobic007G050650 Sobic007G217900--Sobic003G295500 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic007G217900--Sobic008G108100 Sobic009G236150 Sobic009G236150 Sobic007G217900--Sobic009G236150 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic007G217900--Sobic002G160500 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic007G217900--Sobic004G262550 Sobic003G295500--Sobic007G217900 Sobic001G265000 Sobic001G265000 Sobic003G295500--Sobic001G265000 Sobic003G295500--Sobic009G236150 Sobic007G151250 Sobic007G151250 Sobic003G295500--Sobic007G151250 Sobic003G295500--Sobic008G108100 Sobic003G295500--Sobic002G160500 Sobic008G070200 Sobic008G070200 Sobic004G028700--Sobic008G070200 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic004G028700--Sobic009G040100 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic004G028700--Sobic005G125800 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic004G028700--Sobic005G042300 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G028700--Sobic003G402100 Sobic004G014300 Sobic004G014300 Sobic004G028700--Sobic004G014300 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic004G028700--Sobic005G116000 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic004G028700--Sobic005G051700 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic004G028700--Sobic003G029900 Sobic008G043800--Sobic004G058800 Sobic001G445300 Sobic001G445300 Sobic008G043800--Sobic001G445300 Sobic007G055300 Sobic007G055300 Sobic008G043800--Sobic007G055300 Sobic010G058000 Sobic010G058000 Sobic008G043800--Sobic010G058000 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic008G043800--Sobic003G207100 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic008G043800--Sobic004G196600 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic008G043800--Sobic003G207600 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic008G043800--Sobic003G321500 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic008G043800--Sobic002G028000 Sobic004G058800--Sobic001G445300 Sobic004G058800--Sobic003G207100 Sobic004G058800--Sobic007G055300 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic004G058800--Sobic005G173800 Sobic005G176800 Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic005G176800 Sobic004G058800--Sobic008G043800 Sobic004G058800--Sobic003G207600 Sobic007G204350 Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic007G204350 Sobic004G058800--Sobic003G321500 Sobic001G153900--Sobic003G289200 Sobic002G308400 Sobic002G308400 Sobic001G153900--Sobic002G308400 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic001G153900--Sobic007G194100 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic001G153900--Sobic009G025100 Sobic001G442200 Sobic001G442200 Sobic001G153900--Sobic001G442200 Sobic006G244500 Sobic006G244500 Sobic001G153900--Sobic006G244500 Sobic004G067900 Sobic004G067900 Sobic001G153900--Sobic004G067900 Sobic003G000500 Sobic003G000500 Sobic001G153900--Sobic003G000500 Sobic002G240700 Sobic002G240700 Sobic001G153900--Sobic002G240700 Sobic009G134832 Sobic009G134832 Sobic001G079401--Sobic009G134832 Sobic001G079401--Sobic003G289200 Sobic005G110466 Sobic005G110466 Sobic001G079401--Sobic005G110466 Sobic001G488000 Sobic001G488000 Sobic001G079401--Sobic001G488000 Sobic003G062200 Sobic003G062200 Sobic001G079401--Sobic003G062200 Sobic003G316350 Sobic003G316350 Sobic001G079401--Sobic003G316350 Sobic001G426500 Sobic001G426500 Sobic001G079401--Sobic001G426500 Sobic003G295000 Sobic003G295000 Sobic001G079401--Sobic003G295000 Sobic004G114200 Sobic004G114200 Sobic001G079401--Sobic004G114200 Sobic007G084800 Sobic007G084800 Sobic009G041200--Sobic007G084800 Sobic001G413850 Sobic001G413850 Sobic009G041200--Sobic001G413850 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic009G041200--Sobic005G088600 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic009G041200--Sobic009G041100 Sobic008G186700 Sobic008G186700 Sobic009G041200--Sobic008G186700 Sobic005G087666 Sobic005G087666 Sobic009G041200--Sobic005G087666 Sobic008G161601 Sobic008G161601 Sobic009G041200--Sobic008G161601 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic009G041200--Sobic010G237100 Sobic002G370300 Sobic002G370300 Sobic009G041200--Sobic002G370300
Octagon: transcription factors


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