Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G304500.1
Synonym Sb03g035310
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q693
Pfam -
Panther DB PTHR34125
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13175 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g55720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027458 , Zm00025a039971
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G304500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G025100 transporter, putative, expressed -
2 Sobic.009G033500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.001G170500 expressed protein -
4 Sobic.004G274500 OsFBD8 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G196800 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G155300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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9 Sobic.007G091200 wax synthase isoform 1, putative, expressed -
10 Sobic.010G118200 phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G144500 expressed protein -
12 Sobic.004G250600 NHL repeat-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G023600 ATP binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G253800 aspartic proteinase, putative, expressed -
15 Sobic.002G247300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
16 Sobic.008G039700 expressed protein -
17 Sobic.001G518700 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.007G150700 Leucine Rich Repeat family protein, expressed K15082: DNA repair protein RAD7
19 Sobic.010G207400 protein kinase domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G186300 fasciclin-like arabinogalactan protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G304500 Sobic003G304500 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic003G304500--Sobic009G025100 Sobic009G033500 Sobic009G033500 Sobic003G304500--Sobic009G033500 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic003G304500--Sobic001G170500 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic003G304500--Sobic004G274500 Sobic004G196800 Sobic004G196800 Sobic003G304500--Sobic004G196800 Sobic004G155300 Sobic004G155300 Sobic003G304500--Sobic004G155300 Sobic004G318400 Sobic004G318400 Sobic003G304500--Sobic004G318400 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic003G304500--Sobic010G037200 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic003G304500--Sobic007G091200 Sobic009G025100--Sobic001G170500 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic009G025100--Sobic008G039700 Sobic009G025100--Sobic010G037200 Sobic010G168500 Sobic010G168500 Sobic009G025100--Sobic010G168500 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic009G025100--Sobic008G081700 Sobic009G071600 Sobic009G071600 Sobic009G025100--Sobic009G071600 Sobic010G227400 Sobic010G227400 Sobic009G025100--Sobic010G227400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic009G025100--Sobic008G088450 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic009G025100--Sobic002G338600 Sobic009G033500--Sobic007G091200 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic009G033500--Sobic007G041200 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic009G033500--Sobic010G060100 Sobic001G425900 Sobic001G425900 Sobic009G033500--Sobic001G425900 Sobic010G118200 Sobic010G118200 Sobic009G033500--Sobic010G118200 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic009G033500--Sobic010G084800 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic009G033500--Sobic007G205400 Sobic004G133600 Sobic004G133600 Sobic009G033500--Sobic004G133600 Sobic001G518700 Sobic001G518700 Sobic009G033500--Sobic001G518700 Sobic001G170500--Sobic009G025100 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic001G170500--Sobic009G007500 Sobic001G170500--Sobic008G088450 Sobic001G170500--Sobic010G118200 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic001G170500--Sobic009G253800 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic001G170500--Sobic009G227000 Sobic004G294500 Sobic004G294500 Sobic001G170500--Sobic004G294500 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic001G170500--Sobic003G024700 Sobic001G170500--Sobic001G518700 Sobic004G274500--Sobic010G037200 Sobic004G274500--Sobic009G025100 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic004G274500--Sobic001G394900 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G274500--Sobic003G402100 Sobic004G274500--Sobic001G170500 Sobic004G274500--Sobic003G304500 Sobic004G274500--Sobic008G039700 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic004G274500--Sobic003G303500 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic004G274500--Sobic008G037100 Sobic004G196800--Sobic009G025100 Sobic004G210000 Sobic004G210000 Sobic004G196800--Sobic004G210000 Sobic006G015800 Sobic006G015800 Sobic004G196800--Sobic006G015800 Sobic010G207400 Sobic010G207400 Sobic004G196800--Sobic010G207400 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic004G196800--Sobic010G047300 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic004G196800--Sobic005G077900 Sobic002G293100 Sobic002G293100 Sobic004G196800--Sobic002G293100 Sobic004G038900 Sobic004G038900 Sobic004G196800--Sobic004G038900 Sobic004G196800--Sobic009G033500 Sobic004G155300--Sobic003G304500 Sobic004G155300--Sobic009G025100 Sobic004G028800 Sobic004G028800 Sobic004G155300--Sobic004G028800 Sobic004G155300--Sobic004G318400 Sobic004G155300--Sobic004G274500 Sobic006G244500 Sobic006G244500 Sobic004G155300--Sobic006G244500 Sobic004G155300--Sobic001G170500 Sobic004G155300--Sobic004G196800 Sobic007G018000 Sobic007G018000 Sobic004G155300--Sobic007G018000 Sobic004G102900 Sobic004G102900 Sobic004G318400--Sobic004G102900 Sobic007G208200 Sobic007G208200 Sobic004G318400--Sobic007G208200 Sobic004G318400--Sobic003G304500 Sobic004G318400--Sobic004G274500 Sobic006G066600 Sobic006G066600 Sobic004G318400--Sobic006G066600 Sobic004G318400--Sobic004G196800 Sobic004G318400--Sobic009G025100 Sobic004G318400--Sobic004G155300 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic004G318400--Sobic007G194100 Sobic010G037200--Sobic009G025100 Sobic010G037200--Sobic008G039700 Sobic010G037200--Sobic010G227400 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic010G037200--Sobic010G085700 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic010G037200--Sobic009G040000 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic010G037200--Sobic001G068200 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic010G037200--Sobic001G253400 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic010G037200--Sobic001G158600 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic010G037200--Sobic006G051750 Sobic007G091200--Sobic009G033500 Sobic007G091200--Sobic001G518700 Sobic007G091200--Sobic009G007500 Sobic007G091200--Sobic004G294500 Sobic003G189466 Sobic003G189466 Sobic007G091200--Sobic003G189466 Sobic007G091200--Sobic008G081700 Sobic007G091200--Sobic008G088450 Sobic007G091200--Sobic010G118200 Sobic007G091200--Sobic009G253800
Octagon: transcription factors


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