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Transcriptome id Sobic.003G311250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VZT4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G063433 - -
2 Sobic.008G182500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
3 Sobic.002G284600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSAUR39 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
4 Sobic.008G049701 - -
5 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G287301 - -
8 Sobic.001G128800 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G142000 expressed protein -
11 Sobic.008G042250 - -
12 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G055100 - -
14 Sobic.005G117801 - -
15 Sobic.004G317600 pathogenesis-related Bet v I family protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
17 Sobic.004G087200 flavonol-3-O-glycoside-7-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
18 Sobic.009G237350 - -
19 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G221425 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G311250 Sobic003G311250 Sobic010G063433 Sobic010G063433 Sobic003G311250--Sobic010G063433 Sobic008G182500 Sobic008G182500 Sobic003G311250--Sobic008G182500 Sobic002G284600 Sobic002G284600 Sobic003G311250--Sobic002G284600 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic003G311250--Sobic008G049701 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic003G311250--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic003G311250--Sobic009G209800 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic003G311250--Sobic001G287301 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic003G311250--Sobic001G128800 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic003G311250--Sobic002G221200 Sobic001G028600 Sobic001G028600 Sobic010G063433--Sobic001G028600 Sobic010G063433--Sobic001G128800 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic010G063433--Sobic010G104200 Sobic006G055100 Sobic006G055100 Sobic010G063433--Sobic006G055100 Sobic002G007250 Sobic002G007250 Sobic010G063433--Sobic002G007250 Sobic010G063433--Sobic003G311250 Sobic008G061500 Sobic008G061500 Sobic010G063433--Sobic008G061500 Sobic010G063433--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic010G063433--Sobic008G042250 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G182500--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic008G182500--Sobic008G108900 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic008G182500--Sobic009G196700 Sobic005G203400 Sobic005G203400 Sobic008G182500--Sobic005G203400 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G182500--Sobic005G212600 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G182500--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G182500--Sobic009G113600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic008G182500--Sobic007G115000 Sobic009G109101 Sobic009G109101 Sobic008G182500--Sobic009G109101 Sobic009G237350 Sobic009G237350 Sobic002G284600--Sobic009G237350 Sobic008G178300 Sobic008G178300 Sobic002G284600--Sobic008G178300 Sobic008G178200 Sobic008G178200 Sobic002G284600--Sobic008G178200 Sobic003G395600 Sobic003G395600 Sobic002G284600--Sobic003G395600 Sobic002G054901 Sobic002G054901 Sobic002G284600--Sobic002G054901 Sobic003G009501 Sobic003G009501 Sobic002G284600--Sobic003G009501 Sobic004G087200 Sobic004G087200 Sobic002G284600--Sobic004G087200 Sobic002G284600--Sobic003G311250 Sobic010G222600 Sobic010G222600 Sobic002G284600--Sobic010G222600 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G049701--Sobic005G117801 SobicK009900 SobicK009900 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic009G209800 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic001G128800--Sobic008G042250 Sobic001G128800--Sobic001G287301 Sobic001G128800--Sobic009G209800 Sobic001G128800--Sobic008G049701 SobicK024000 SobicK024000 Sobic001G128800--SobicK024000 Sobic001G128800--Sobic005G139800 Sobic001G128800--Sobic005G110430 Sobic001G128800--Sobic001G240400 Sobic001G128800--Sobic002G056100 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic002G221200--Sobic001G305400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic001G240400 Sobic002G221200--Sobic005G117801 Sobic002G221200--Sobic001G253100 Sobic002G221200--Sobic009G209800 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic002G062300 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic002G221200--Sobic003G031750
Octagon: transcription factors


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