Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G410300.1
Synonym JAZ10, TIFY9, JAS1,JAZ, Sb03g044485
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN (PubMedID : 25711704)
zinc-finger protein, putative, expressed
UniProt C5XGY7
Pfam PF09425 PF06200
Panther DB PTHR33077 PTHR33077:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13220 : jasmonate-zim-domain protein 10
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g32480.1 : zinc-finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G092400 amino acid transporter, putative, expressed -
2 Sobic.009G085300 - -
3 Sobic.009G044700 DTA2, putative, expressed -
4 Sobic.002G034750 - -
5 Sobic.003G008000 cyclin-T1-1, putative, expressed -
6 Sobic.010G104600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Caleosin-related family protein(PubMedID : 26320239)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
7 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
8 Sobic.002G243300 amino acid permease family protein, putative, expressed -
9 Sobic.004G135366 - -
10 Sobic.004G349450 - -
11 Sobic.005G093200 - -
12 Sobic.002G280950 - -
13 Sobic.002G001200 - -
14 Sobic.002G349900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@outer membrane protein, OMP85 family, putative, expressed -
15 Sobic.008G054200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@csAtPR5, putative, expressed -
16 Sobic.005G003600 - -
17 Sobic.008G128500 - -
18 Sobic.009G142400 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
19 Sobic.001G504500 expressed protein -
20 Sobic.004G046800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G410300 Sobic003G410300 Sobic007G092400 Sobic007G092400 Sobic003G410300--Sobic007G092400 Sobic009G085300 Sobic009G085300 Sobic003G410300--Sobic009G085300 Sobic009G044700 Sobic009G044700 Sobic003G410300--Sobic009G044700 Sobic002G034750 Sobic002G034750 Sobic003G410300--Sobic002G034750 Sobic003G008000 Sobic003G008000 Sobic003G410300--Sobic003G008000 Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic003G410300--Sobic010G104600 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic003G410300--Sobic001G453600 Sobic002G243300 Sobic002G243300 Sobic003G410300--Sobic002G243300 Sobic004G135366 Sobic004G135366 Sobic003G410300--Sobic004G135366 Sobic007G092400--Sobic003G410300 Sobic007G092400--Sobic004G135366 Sobic007G092400--Sobic002G034750 Sobic004G089300 Sobic004G089300 Sobic007G092400--Sobic004G089300 Sobic003G038400 Sobic003G038400 Sobic007G092400--Sobic003G038400 Sobic007G092400--Sobic009G085300 Sobic002G349900 Sobic002G349900 Sobic007G092400--Sobic002G349900 Sobic007G092400--Sobic002G243300 Sobic005G003600 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Octagon: transcription factors


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