Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G420400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5XHQ5
Pfam PF15159
Panther DB PTHR36485 PTHR36485:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.003G420400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G194800 EF hand family protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G012300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G040250 - -
4 Sobic.009G040325 - -
5 Sobic.003G021600 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K13117: ATP-dependent RNA helicase DDX35
6 Sobic.007G122700 expressed protein -
7 Sobic.002G147200 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed -
8 Sobic.006G119900 zinc finger, ZZ type family protein, expressed K17987: next to BRCA1 gene 1 protein
9 Sobic.010G274800 glycosyl transferase family 8, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
10 Sobic.001G043200 expressed protein -
11 Sobic.003G256800 RNA polymerase III subunit RPC82 family protein, putative, expressed K03023: RPC3, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3
12 Sobic.003G299500 expressed protein -
13 Sobic.002G381900 expressed protein -
14 Sobic.005G087300 protein kinase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G105700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K13648: alpha-1,4-galacturonosyltransferase
16 Sobic.003G204100 expressed protein -
17 Sobic.007G030100 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G085950 - -
19 Sobic.001G051400 aminoacyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
20 Sobic.002G363800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G420400 Sobic003G420400 Sobic003G194800 Sobic003G194800 Sobic003G420400--Sobic003G194800 Sobic006G012300 Sobic006G012300 Sobic003G420400--Sobic006G012300 Sobic009G040250 Sobic009G040250 Sobic003G420400--Sobic009G040250 Sobic009G040325 Sobic009G040325 Sobic003G420400--Sobic009G040325 Sobic003G021600 Sobic003G021600 Sobic003G420400--Sobic003G021600 Sobic007G122700 Sobic007G122700 Sobic003G420400--Sobic007G122700 Sobic002G147200 Sobic002G147200 Sobic003G420400--Sobic002G147200 Sobic006G119900 Sobic006G119900 Sobic003G420400--Sobic006G119900 Sobic010G274800 Sobic010G274800 Sobic003G420400--Sobic010G274800 Sobic008G085950 Sobic008G085950 Sobic003G194800--Sobic008G085950 Sobic008G047500 Sobic008G047500 Sobic003G194800--Sobic008G047500 Sobic009G120400 Sobic009G120400 Sobic003G194800--Sobic009G120400 Sobic003G204100 Sobic003G204100 Sobic003G194800--Sobic003G204100 Sobic002G173400 Sobic002G173400 Sobic003G194800--Sobic002G173400 Sobic003G299500 Sobic003G299500 Sobic003G194800--Sobic003G299500 Sobic007G105700 Sobic007G105700 Sobic003G194800--Sobic007G105700 Sobic004G215600 Sobic004G215600 Sobic003G194800--Sobic004G215600 Sobic003G194800--Sobic003G420400 Sobic006G012300--Sobic009G040250 Sobic006G012300--Sobic007G105700 Sobic006G012300--Sobic003G420400 Sobic006G012300--Sobic006G119900 Sobic006G012300--Sobic010G274800 Sobic006G012300--Sobic009G040325 Sobic002G392400 Sobic002G392400 Sobic006G012300--Sobic002G392400 Sobic006G220400 Sobic006G220400 Sobic006G012300--Sobic006G220400 Sobic005G087300 Sobic005G087300 Sobic006G012300--Sobic005G087300 Sobic009G040250--Sobic009G040325 Sobic009G040250--Sobic005G087300 Sobic009G040250--Sobic003G021600 Sobic009G040250--Sobic006G012300 Sobic009G040250--Sobic002G147200 Sobic010G160300 Sobic010G160300 Sobic009G040250--Sobic010G160300 Sobic001G043200 Sobic001G043200 Sobic009G040250--Sobic001G043200 Sobic002G304700 Sobic002G304700 Sobic009G040250--Sobic002G304700 Sobic006G191000 Sobic006G191000 Sobic009G040250--Sobic006G191000 Sobic009G040325--Sobic009G040250 Sobic009G040325--Sobic003G021600 Sobic009G040325--Sobic001G043200 Sobic009G040325--Sobic006G119900 Sobic009G040325--Sobic007G105700 Sobic009G040325--Sobic006G012300 Sobic009G040325--Sobic003G420400 Sobic007G030100 Sobic007G030100 Sobic009G040325--Sobic007G030100 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic009G040325--Sobic003G394500 Sobic009G194000 Sobic009G194000 Sobic003G021600--Sobic009G194000 Sobic003G181700 Sobic003G181700 Sobic003G021600--Sobic003G181700 Sobic003G190200 Sobic003G190200 Sobic003G021600--Sobic003G190200 Sobic002G227500 Sobic002G227500 Sobic003G021600--Sobic002G227500 Sobic003G021600--Sobic009G040325 Sobic003G021600--Sobic009G040250 Sobic003G021600--Sobic003G394500 Sobic001G308400 Sobic001G308400 Sobic003G021600--Sobic001G308400 Sobic003G021600--Sobic001G043200 Sobic003G005500 Sobic003G005500 Sobic007G122700--Sobic003G005500 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic007G122700--Sobic009G163400 Sobic008G141900 Sobic008G141900 Sobic007G122700--Sobic008G141900 Sobic003G045450 Sobic003G045450 Sobic007G122700--Sobic003G045450 Sobic001G010500 Sobic001G010500 Sobic007G122700--Sobic001G010500 Sobic004G276000 Sobic004G276000 Sobic007G122700--Sobic004G276000 Sobic001G376501 Sobic001G376501 Sobic007G122700--Sobic001G376501 Sobic008G046200 Sobic008G046200 Sobic007G122700--Sobic008G046200 Sobic007G122700--Sobic006G119900 Sobic002G147200--Sobic007G030100 Sobic002G147100 Sobic002G147100 Sobic002G147200--Sobic002G147100 Sobic002G147200--Sobic003G190200 Sobic002G147200--Sobic009G040250 Sobic005G063200 Sobic005G063200 Sobic002G147200--Sobic005G063200 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic002G147200--Sobic003G428000 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic002G147200--Sobic003G117800 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic002G147200--Sobic001G114200 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic002G147200--Sobic001G385000 Sobic006G119900--Sobic007G105700 Sobic001G076600 Sobic001G076600 Sobic006G119900--Sobic001G076600 Sobic006G189000 Sobic006G189000 Sobic006G119900--Sobic006G189000 Sobic005G060100 Sobic005G060100 Sobic006G119900--Sobic005G060100 Sobic001G385300 Sobic001G385300 Sobic006G119900--Sobic001G385300 Sobic006G119900--Sobic010G274800 Sobic006G119900--Sobic008G085950 Sobic003G004800 Sobic003G004800 Sobic006G119900--Sobic003G004800 Sobic006G156400 Sobic006G156400 Sobic006G119900--Sobic006G156400 Sobic001G308500 Sobic001G308500 Sobic010G274800--Sobic001G308500 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic010G274800--Sobic009G046900 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic010G274800--Sobic001G149000 Sobic010G274800--Sobic003G428000 Sobic004G194400 Sobic004G194400 Sobic010G274800--Sobic004G194400 Sobic006G265800 Sobic006G265800 Sobic010G274800--Sobic006G265800 Sobic006G071362 Sobic006G071362 Sobic010G274800--Sobic006G071362 Sobic010G086300 Sobic010G086300 Sobic010G274800--Sobic010G086300 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic010G274800--Sobic006G134500
Octagon: transcription factors


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