Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G010000.1
Synonym Sb04g001030, SCPL49, CPY
Functional annotation OsSCP6 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed
UniProt C5XS84
Pfam PF00450
Panther DB PTHR11802 PTHR11802:SF74
NCBI CDD KOG1282; Serine carboxypeptidases (lysosomal cathepsin A)
KEGG Orthology K09645; vitellogenic carboxypeptidase-like protein
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004185serine-type carboxypeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G10410 : SERINE CARBOXYPEPTIDASE-LIKE 49
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02320.1 : OsSCP6 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a018692 , Zm00025a048016
Brachypodium KQJ92875
Barley HORVU6Hr1G006880.6 , HORVU6Hr1G006880.7 , HORVU6Hr1G006880.4 , HORVU6Hr1G006880.5 , HORVU6Hr1G006880.2 , HORVU6Hr1G006880.1 , HORVU6Hr1G006880.8 , HORVU6Hr1G006880.9 , HORVU6Hr1G006880.3
Wheat TraesCS6B02G050700 , TraesCS6A02G036100 , TraesCS6D02G041700
Populus PNT42484 , PNT42485


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cDNA sequences
Sobic.004G010000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.007G040900 expressed protein -
20 Sobic.004G048300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G010000 Sobic004G010000 Sobic005G186400 Sobic005G186400 Sobic004G010000--Sobic005G186400 Sobic001G458400 Sobic001G458400 Sobic004G010000--Sobic001G458400 Sobic007G191200 Sobic007G191200 Sobic004G010000--Sobic007G191200 Sobic002G115900 Sobic002G115900 Sobic004G010000--Sobic002G115900 Sobic008G069000 Sobic008G069000 Sobic004G010000--Sobic008G069000 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic004G010000--Sobic010G029800 Sobic006G143300 Sobic006G143300 Sobic004G010000--Sobic006G143300 Sobic002G238900 Sobic002G238900 Sobic004G010000--Sobic002G238900 Sobic008G181200 Sobic008G181200 Sobic004G010000--Sobic008G181200 Sobic005G186400--Sobic002G238900 Sobic005G186400--Sobic007G191200 Sobic005G186400--Sobic008G069000 Sobic005G186400--Sobic004G010000 Sobic004G167900 Sobic004G167900 Sobic005G186400--Sobic004G167900 Sobic002G019400 Sobic002G019400 Sobic005G186400--Sobic002G019400 Sobic005G186400--Sobic006G143300 Sobic005G186400--Sobic010G029800 Sobic005G186400--Sobic008G181200 Sobic002G109100 Sobic002G109100 Sobic001G458400--Sobic002G109100 Sobic007G083000 Sobic007G083000 Sobic001G458400--Sobic007G083000 Sobic001G458400--Sobic004G010000 Sobic001G458400--Sobic006G143300 Sobic001G123300 Sobic001G123300 Sobic001G458400--Sobic001G123300 Sobic009G060501 Sobic009G060501 Sobic001G458400--Sobic009G060501 Sobic006G200901 Sobic006G200901 Sobic001G458400--Sobic006G200901 Sobic001G458400--Sobic005G186400 Sobic003G217500 Sobic003G217500 Sobic001G458400--Sobic003G217500 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic007G191200--Sobic005G042400 Sobic007G191200--Sobic010G029800 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic007G191200--Sobic005G124400 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic007G191200--Sobic004G008700 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic007G191200--Sobic010G137600 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic007G191200--Sobic005G052200 Sobic007G191200--Sobic008G069000 Sobic004G114700 Sobic004G114700 Sobic007G191200--Sobic004G114700 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic007G191200--Sobic003G103100 Sobic002G115900--Sobic004G008700 Sobic002G115900--Sobic010G029800 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic002G115900--Sobic003G099800 Sobic002G115900--Sobic005G042400 Sobic002G115900--Sobic008G069000 Sobic002G115900--Sobic005G052200 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic002G115900--Sobic007G040900 Sobic002G098100 Sobic002G098100 Sobic002G115900--Sobic002G098100 Sobic002G115900--Sobic004G114700 Sobic008G069000--Sobic010G029800 Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic008G069000--Sobic004G048300 Sobic006G139400 Sobic006G139400 Sobic008G069000--Sobic006G139400 Sobic003G238900 Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic003G238900 Sobic008G069000--Sobic004G008700 Sobic008G069000--Sobic002G238900 Sobic005G177200 Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic005G177200 Sobic008G069000--Sobic007G040900 Sobic008G069000--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic004G008700 Sobic010G029800--Sobic005G042400 Sobic010G029800--Sobic008G069000 Sobic010G029800--Sobic003G099800 Sobic010G029800--Sobic005G052200 Sobic010G029800--Sobic010G137600 Sobic010G029800--Sobic008G181200 Sobic010G029800--Sobic007G040900 Sobic010G029800--Sobic004G114700 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic006G143300--Sobic005G033700 Sobic006G143300--Sobic006G200901 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic006G143300--Sobic002G343000 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic006G143300--Sobic004G014100 Sobic001G081800 Sobic001G081800 Sobic006G143300--Sobic001G081800 Sobic002G349000 Sobic002G349000 Sobic006G143300--Sobic002G349000 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic006G143300--Sobic002G230400 Sobic005G164800 Sobic005G164800 Sobic006G143300--Sobic005G164800 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic006G143300--Sobic006G186300 Sobic002G238900--Sobic008G069000 Sobic002G238900--Sobic005G177200 Sobic002G238900--Sobic006G139400 Sobic005G037800 Sobic005G037800 Sobic002G238900--Sobic005G037800 Sobic002G238900--Sobic010G029800 Sobic002G238900--Sobic003G238900 Sobic002G238900--Sobic008G181200 Sobic002G238900--Sobic004G048300 Sobic001G307400 Sobic001G307400 Sobic002G238900--Sobic001G307400 Sobic008G181200--Sobic005G177200 Sobic008G181200--Sobic005G037800 Sobic002G049800 Sobic002G049800 Sobic008G181200--Sobic002G049800 Sobic008G184400 Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G184400 Sobic008G181200--Sobic008G069000 Sobic008G181200--Sobic006G139400 Sobic008G181200--Sobic010G029800 Sobic010G137700 Sobic010G137700 Sobic008G181200--Sobic010G137700 Sobic001G323500 Sobic001G323500 Sobic008G181200--Sobic001G323500
Octagon: transcription factors


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