Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G012700.1,Sobic.004G012700.2
Synonym Sb04g001240
Functional annotation remorin family protein, putative, expressed
UniProt C5XSB4 , C5XSB7
Pfam PF03763
Panther DB PTHR31471 PTHR31471:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02170 : Remorin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02500.1 : remorin family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035054
Brachypodium KQJ92914 , KQJ92913 , KQJ92912
Barley HORVU0Hr1G040310.4 , HORVU0Hr1G040310.2 , HORVU0Hr1G040310.3
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G012700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G493900 beta-galactosidase, putative, expressed -
2 Sobic.003G302000 expressed protein -
3 Sobic.001G079900 expressed protein -
4 Sobic.004G052800 DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G185900 expressed protein -
6 Sobic.005G032600 glucan endo-1,3-beta-glucosidase-related, putative, expressed -
7 Sobic.004G267600 OsFBT4 - F-box and tubby domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G197100 expressed protein -
9 Sobic.005G168400 expressed protein -
10 Sobic.001G470200 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.010G077000 "Upregulated in leave and stem in response to drouht stress, not expredded in roots"(PubMedID : 31615416)@receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.006G272800 Most C2 domain protein(PubMedID : 29491869)@anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.003G325400 methyladenine glycosylase, putative, expressed K01246: DNA-3-methyladenine glycosylase I
14 Sobic.007G163400 protein Kinase-like protein TMKL1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.005G062600 MLO domain containing protein, putative, expressed K08472: mlo protein
16 Sobic.007G152300 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
17 Sobic.008G088800 expressed protein -
18 Sobic.001G439800 Subtilisin-like serine protease 2("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@OsSub28 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
19 Sobic.004G003700 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@expressed protein -
20 Sobic.001G101900 SCP-like extracellular protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G012700 Sobic004G012700 Sobic001G493900 Sobic001G493900 Sobic004G012700--Sobic001G493900 Sobic003G302000 Sobic003G302000 Sobic004G012700--Sobic003G302000 Sobic001G079900 Sobic001G079900 Sobic004G012700--Sobic001G079900 Sobic004G052800 Sobic004G052800 Sobic004G012700--Sobic004G052800 Sobic009G185900 Sobic009G185900 Sobic004G012700--Sobic009G185900 Sobic005G032600 Sobic005G032600 Sobic004G012700--Sobic005G032600 Sobic004G267600 Sobic004G267600 Sobic004G012700--Sobic004G267600 Sobic007G197100 Sobic007G197100 Sobic004G012700--Sobic007G197100 Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic004G012700--Sobic005G168400 Sobic001G493900--Sobic004G267600 Sobic003G019900 Sobic003G019900 Sobic001G493900--Sobic003G019900 Sobic010G129700 Sobic010G129700 Sobic001G493900--Sobic010G129700 Sobic002G319300 Sobic002G319300 Sobic001G493900--Sobic002G319300 Sobic008G114900 Sobic008G114900 Sobic001G493900--Sobic008G114900 Sobic001G155700 Sobic001G155700 Sobic001G493900--Sobic001G155700 Sobic010G192500 Sobic010G192500 Sobic001G493900--Sobic010G192500 Sobic002G417000 Sobic002G417000 Sobic001G493900--Sobic002G417000 Sobic003G338700 Sobic003G338700 Sobic001G493900--Sobic003G338700 Sobic007G165800 Sobic007G165800 Sobic003G302000--Sobic007G165800 Sobic004G274600 Sobic004G274600 Sobic003G302000--Sobic004G274600 Sobic007G163400 Sobic007G163400 Sobic003G302000--Sobic007G163400 Sobic007G170100 Sobic007G170100 Sobic003G302000--Sobic007G170100 Sobic007G180200 Sobic007G180200 Sobic003G302000--Sobic007G180200 Sobic003G356600 Sobic003G356600 Sobic003G302000--Sobic003G356600 Sobic005G199700 Sobic005G199700 Sobic003G302000--Sobic005G199700 Sobic008G097700 Sobic008G097700 Sobic003G302000--Sobic008G097700 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic003G302000--Sobic001G286700 Sobic001G079900--Sobic005G032600 Sobic001G384700 Sobic001G384700 Sobic001G079900--Sobic001G384700 Sobic005G062600 Sobic005G062600 Sobic001G079900--Sobic005G062600 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic001G079900--Sobic002G050700 Sobic003G351900 Sobic003G351900 Sobic001G079900--Sobic003G351900 Sobic001G079900--Sobic001G493900 Sobic008G151600 Sobic008G151600 Sobic001G079900--Sobic008G151600 Sobic002G027600 Sobic002G027600 Sobic001G079900--Sobic002G027600 Sobic009G141700 Sobic009G141700 Sobic001G079900--Sobic009G141700 Sobic004G052800--Sobic001G079900 Sobic004G052800--Sobic001G384700 Sobic002G216600 Sobic002G216600 Sobic004G052800--Sobic002G216600 Sobic005G177900 Sobic005G177900 Sobic004G052800--Sobic005G177900 Sobic004G052800--Sobic007G197100 Sobic005G204100 Sobic005G204100 Sobic004G052800--Sobic005G204100 Sobic004G052800--Sobic005G032600 Sobic004G052800--Sobic004G012700 Sobic004G052800--Sobic003G302000 Sobic002G360500 Sobic002G360500 Sobic009G185900--Sobic002G360500 Sobic009G185900--Sobic007G180200 Sobic008G093600 Sobic008G093600 Sobic009G185900--Sobic008G093600 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic009G185900--Sobic004G003700 Sobic009G185900--Sobic001G493900 Sobic003G307200 Sobic003G307200 Sobic009G185900--Sobic003G307200 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic009G185900--Sobic001G143400 Sobic009G185900--Sobic008G114900 Sobic010G014500 Sobic010G014500 Sobic009G185900--Sobic010G014500 Sobic005G032600--Sobic002G027600 Sobic005G032600--Sobic004G267600 Sobic005G032600--Sobic001G079900 Sobic005G032600--Sobic003G019900 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic005G032600--Sobic006G272800 Sobic005G032600--Sobic001G493900 Sobic005G032600--Sobic008G151600 Sobic005G032600--Sobic003G351900 Sobic007G032100 Sobic007G032100 Sobic005G032600--Sobic007G032100 Sobic004G267600--Sobic001G493900 Sobic002G284100 Sobic002G284100 Sobic004G267600--Sobic002G284100 Sobic004G267600--Sobic010G129700 Sobic006G142500 Sobic006G142500 Sobic004G267600--Sobic006G142500 Sobic004G267600--Sobic002G027600 Sobic004G267600--Sobic006G272800 Sobic004G267600--Sobic002G417000 Sobic004G267600--Sobic005G032600 Sobic004G267600--Sobic005G062600 Sobic002G366000 Sobic002G366000 Sobic007G197100--Sobic002G366000 Sobic001G540700 Sobic001G540700 Sobic007G197100--Sobic001G540700 Sobic009G254000 Sobic009G254000 Sobic007G197100--Sobic009G254000 Sobic007G197100--Sobic005G032600 Sobic009G005700 Sobic009G005700 Sobic007G197100--Sobic009G005700 Sobic002G315500 Sobic002G315500 Sobic007G197100--Sobic002G315500 Sobic004G207000 Sobic004G207000 Sobic007G197100--Sobic004G207000 Sobic001G470200 Sobic001G470200 Sobic007G197100--Sobic001G470200 Sobic007G197100--Sobic006G272800 Sobic010G168700 Sobic010G168700 Sobic005G168400--Sobic010G168700 Sobic005G168400--Sobic001G143400 Sobic005G168400--Sobic004G003700 Sobic003G319900 Sobic003G319900 Sobic005G168400--Sobic003G319900 Sobic001G393200 Sobic001G393200 Sobic005G168400--Sobic001G393200 Sobic009G047500 Sobic009G047500 Sobic005G168400--Sobic009G047500 Sobic005G168400--Sobic005G199700 Sobic001G379900 Sobic001G379900 Sobic005G168400--Sobic001G379900 Sobic007G152300 Sobic007G152300 Sobic005G168400--Sobic007G152300
Octagon: transcription factors


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