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Transcriptome id Sobic.004G040050.1
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UniProt A0A1Z5RL04
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G197300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@AR791, putative, expressed -
2 Sobic.001G005300 gibberellin 20 oxidase 1, putative, expressed K05282: gibberellin-44 dioxygenase
3 Sobic.003G316350 - -
4 Sobic.001G502700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulin, putative, expressed -
5 Sobic.004G003000 ribosomal protein L6, putative, expressed -
6 Sobic.007G176500 - -
7 Sobic.003G436500 ubiquitin-fold modifier 1 precursor, putative, expressed K12162: ubiquitin-fold modifier 1
8 Sobic.006G164000 expressed protein -
9 Sobic.003G409800 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@No apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G510400 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
11 Sobic.001G206300 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G281600 lachrymatory factor synthase, putative, expressed -
13 Sobic.005G110421 - -
14 Sobic.008G105432 - -
15 Sobic.004G081601 - -
16 Sobic.001G355600 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G310700 protein kinase family protein, putative, expressed K14500: BR-signaling kinase
18 Sobic.001G418600 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@DnaK family protein, putative, expressed K03283: heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
19 Sobic.003G002501 - -
20 Sobic.001G166401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G040050 Sobic004G040050 Sobic003G197300 Sobic003G197300 Sobic004G040050--Sobic003G197300 Sobic001G005300 Sobic001G005300 Sobic004G040050--Sobic001G005300 Sobic003G316350 Sobic003G316350 Sobic004G040050--Sobic003G316350 Sobic001G502700 Sobic001G502700 Sobic004G040050--Sobic001G502700 Sobic004G003000 Sobic004G003000 Sobic004G040050--Sobic004G003000 Sobic007G176500 Sobic007G176500 Sobic004G040050--Sobic007G176500 Sobic003G436500 Sobic003G436500 Sobic004G040050--Sobic003G436500 Sobic006G164000 Sobic006G164000 Sobic004G040050--Sobic006G164000 Sobic003G409800 Sobic003G409800 Sobic004G040050--Sobic003G409800 Sobic005G110421 Sobic005G110421 Sobic003G197300--Sobic005G110421 Sobic001G206300 Sobic001G206300 Sobic003G197300--Sobic001G206300 Sobic002G225300 Sobic002G225300 Sobic003G197300--Sobic002G225300 Sobic001G510400 Sobic001G510400 Sobic003G197300--Sobic001G510400 Sobic005G061033 Sobic005G061033 Sobic003G197300--Sobic005G061033 Sobic002G185300 Sobic002G185300 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Octagon: transcription factors


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