Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G073600.1
Synonym P-glycoprotein, Sb04g006100, SbPGP12
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, stem and root, expression induced by BR treatment" (PubMedID : 20528920)
multidrug resistance protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RLC4
Pfam PF00005 PF00664
Panther DB PTHR24221 PTHR24221:SF141
NCBI CDD -
KEGG Orthology K05658; ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
Gene Ontology GO:0016887; ATPase activity GO:0005524ATP binding GO:0016021integral component of membrane GO:0006810transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28345 : ABC transporter family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g09720.1 : multidrug resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034701 , Zm00025a020627
Brachypodium KQJ93765 , KQJ93764
Barley HORVU6Hr1G035040.14 , HORVU6Hr1G035040.13 , HORVU6Hr1G035040.10 , HORVU6Hr1G035040.11 , HORVU6Hr1G035040.4 , HORVU6Hr1G035040.1 , HORVU6Hr1G035040.2 , HORVU6Hr1G035040.3 , HORVU6Hr1G035040.8 , HORVU6Hr1G035040.9 , HORVU6Hr1G035040.16 , HORVU6Hr1G035040.17 , HORVU6Hr1G035040.15 , HORVU6Hr1G035040.12
Wheat TraesCS4A02G370600 , TraesCS6D02G161200 , TraesCS6D02G161200 , TraesCS6A02G171800 , TraesCS6B02G199700 , TraesCS7D02G068400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G073600 Sobic004G073600 Sobic001G137900 Sobic001G137900 Sobic004G073600--Sobic001G137900 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic004G073600--Sobic004G291300 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic004G073600--Sobic002G033550 Sobic005G020501 Sobic005G020501 Sobic004G073600--Sobic005G020501 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic004G073600--Sobic007G115700 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic004G073600--Sobic006G279600 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic004G073600--Sobic006G174050 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic004G073600--Sobic005G152866 Sobic004G199100 Sobic004G199100 Sobic004G073600--Sobic004G199100 Sobic001G137900--Sobic002G033550 Sobic001G137900--Sobic004G199100 Sobic008G123700 Sobic008G123700 Sobic001G137900--Sobic008G123700 Sobic002G109700 Sobic002G109700 Sobic001G137900--Sobic002G109700 Sobic001G137900--Sobic004G291300 Sobic002G121201 Sobic002G121201 Sobic001G137900--Sobic002G121201 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic001G137900--Sobic002G199300 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic001G137900--Sobic009G106601 Sobic003G143600 Sobic003G143600 Sobic001G137900--Sobic003G143600 Sobic004G291300--Sobic001G137900 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic004G291300--Sobic003G163000 Sobic004G291300--Sobic002G033550 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic004G291300--Sobic005G045250 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G291300--Sobic002G214000 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic004G291300--Sobic005G019250 Sobic004G291300--Sobic005G152866 Sobic001G422432 Sobic001G422432 Sobic004G291300--Sobic001G422432 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic004G291300--Sobic001G202450 Sobic002G033550--Sobic001G137900 Sobic001G413300 Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic001G413300 Sobic002G033550--Sobic004G199100 Sobic002G033550--Sobic006G279600 Sobic002G033550--Sobic003G143600 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic002G033550--Sobic003G169700 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic003G208200 Sobic002G033550--Sobic009G106601 Sobic002G033550--Sobic005G019250 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic005G020501--Sobic001G502801 Sobic005G020501--Sobic005G045250 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic005G020501--Sobic005G123300 Sobic005G020501--Sobic001G137900 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic005G020501--Sobic010G214150 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic005G020501--Sobic009G170050 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic005G020501--Sobic001G300301 Sobic005G020501--Sobic006G174050 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G020501--Sobic002G178900 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic007G115700--Sobic007G023000 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic007G115700--Sobic007G113000 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic007G115700--Sobic010G169950 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic007G115700--Sobic008G100900 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic007G115700--Sobic006G111000 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic007G115700--Sobic003G030450 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic007G115700--Sobic006G041200 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic007G115700--Sobic001G373850 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic007G115700--Sobic002G142950 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic006G279600--Sobic006G162750 Sobic003G169800 Sobic003G169800 Sobic006G279600--Sobic003G169800 Sobic006G279600--Sobic007G113000 Sobic006G279600--Sobic003G030450 Sobic006G279600--Sobic001G413300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic006G279600--Sobic007G078700 Sobic006G279600--Sobic005G045250 Sobic006G279600--Sobic007G115700 Sobic006G279600--Sobic001G202450 Sobic006G174050--Sobic009G170050 Sobic003G205000 Sobic003G205000 Sobic006G174050--Sobic003G205000 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic006G174050--Sobic009G158150 Sobic010G266400 Sobic010G266400 Sobic006G174050--Sobic010G266400 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic006G174050--Sobic010G166201 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic006G174050--Sobic005G168900 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic006G174050--Sobic001G516400 Sobic006G174050--Sobic002G199300 Sobic006G174050--Sobic002G178900 Sobic005G152866--Sobic003G030450 Sobic005G152866--Sobic001G202450 Sobic005G152866--Sobic003G163000 Sobic005G152866--Sobic007G078700 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic005G152866--Sobic006G052250 Sobic005G152866--Sobic005G045250 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic005G152866--Sobic001G136850 Sobic005G152866--Sobic001G373850 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic005G152866--Sobic003G023450 Sobic004G199100--Sobic003G143600 Sobic004G199100--Sobic001G137900 Sobic005G166200 Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic005G166200 Sobic004G199100--Sobic008G123700 Sobic004G252250 Sobic004G252250 Sobic004G199100--Sobic004G252250 Sobic001G397550 Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic001G397550 Sobic004G199100--Sobic002G033550 Sobic003G327950 Sobic003G327950 Sobic004G199100--Sobic003G327950 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic004G199100--Sobic007G028300
Octagon: transcription factors


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