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Transcriptome id Sobic.004G096000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPS2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G352750 - -
2 Sobic.009G162550 - -
3 Sobic.009G043200 BTBN17 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
4 Sobic.004G162600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
5 Sobic.001G086100 - -
6 Sobic.009G187900 ethylene-responsive protein related, putative, expressed -
7 Sobic.001G336600 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.001G169000 expressed protein -
9 Sobic.003G017300 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase
10 Sobic.005G068400 - -
11 Sobic.002G334900 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
12 Sobic.009G106300 - -
13 Sobic.004G087900 - -
14 Sobic.009G203600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Receptor-like protein kinase HSL1(PubMedID : 31721651)@receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.009G054200 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.004G244500 dynamin, putative, expressed K01528: dynamin 1/3
17 Sobic.009G181900 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
18 Sobic.004G293600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G250340 - K07976: Rab family, other
20 Sobic.008G134500 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G096000 Sobic004G096000 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic004G096000--Sobic003G352750 Sobic009G162550 Sobic009G162550 Sobic004G096000--Sobic009G162550 Sobic009G043200 Sobic009G043200 Sobic004G096000--Sobic009G043200 Sobic004G162600 Sobic004G162600 Sobic004G096000--Sobic004G162600 Sobic001G086100 Sobic001G086100 Sobic004G096000--Sobic001G086100 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic004G096000--Sobic009G187900 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic004G096000--Sobic001G336600 Sobic001G169000 Sobic001G169000 Sobic004G096000--Sobic001G169000 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic004G096000--Sobic003G017300 Sobic003G352750--Sobic001G336600 Sobic003G352750--Sobic004G096000 Sobic003G352750--Sobic001G086100 Sobic003G352750--Sobic009G162550 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic003G352750--Sobic008G131601 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G352750--Sobic004G293600 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic003G352750--Sobic006G144900 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic003G352750--Sobic009G160900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic003G352750--Sobic009G203600 Sobic009G162550--Sobic003G352750 Sobic009G162550--Sobic004G096000 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic009G162550--Sobic002G176800 Sobic003G078700 Sobic003G078700 Sobic009G162550--Sobic003G078700 Sobic009G162550--Sobic008G131601 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic009G162550--Sobic003G262500 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic009G162550--Sobic005G135300 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic009G162550--Sobic003G364550 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic009G162550--Sobic005G068400 Sobic009G043200--Sobic001G086100 Sobic009G043200--Sobic001G169000 Sobic009G043200--Sobic004G162600 Sobic009G043200--Sobic004G096000 Sobic001G351200 Sobic001G351200 Sobic009G043200--Sobic001G351200 Sobic009G043200--Sobic004G293600 Sobic002G334900 Sobic002G334900 Sobic009G043200--Sobic002G334900 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic009G043200--Sobic003G250340 Sobic009G043200--Sobic009G187900 Sobic004G162600--Sobic009G187900 Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic004G162600--Sobic004G205400 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic004G162600--Sobic006G260101 Sobic004G162600--Sobic003G250340 Sobic004G162600--Sobic009G043200 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic004G162600--Sobic010G196200 Sobic005G116601 Sobic005G116601 Sobic004G162600--Sobic005G116601 Sobic004G162600--Sobic002G334900 Sobic004G162600--Sobic004G096000 Sobic001G086100--Sobic004G293600 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G086100--Sobic002G345100 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic001G086100--Sobic002G046400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic001G086100--Sobic005G025500 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic001G086100--Sobic003G002800 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic001G086100--Sobic004G328800 Sobic001G086100--Sobic006G144900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic001G086100--Sobic009G142600 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G086100--Sobic005G014600 Sobic009G187900--Sobic004G162600 Sobic009G187900--Sobic003G250340 Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic009G187900--Sobic001G087500 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic009G187900--Sobic005G038700 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic009G187900--Sobic010G278400 Sobic004G244500 Sobic004G244500 Sobic009G187900--Sobic004G244500 Sobic009G187900--Sobic006G260101 Sobic009G187900--Sobic002G334900 Sobic009G187900--Sobic004G205400 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic001G169000--Sobic004G293600 Sobic001G169000--Sobic001G086100 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic001G169000--Sobic003G333150 Sobic001G169000--Sobic009G043200 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic001G169000--Sobic008G045300 Sobic001G169000--Sobic009G203600 Sobic001G169000--Sobic006G144900 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic001G169000--Sobic003G130650 Sobic001G169000--Sobic002G345100 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G017300--Sobic009G054200 Sobic006G269300 Sobic006G269300 Sobic003G017300--Sobic006G269300 Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic003G017300--Sobic009G106300 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic003G017300--Sobic001G410300 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic003G017300--Sobic009G181900 Sobic003G017300--Sobic006G260101 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic006G170800 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic003G017300--Sobic009G005750 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic003G017300--Sobic003G159400
Octagon: transcription factors


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