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Transcriptome id Sobic.004G125200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPA4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G214900 receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.004G071800 - -
3 Sobic.004G132600 aminotransferase, putative, expressed K11717: cysteine desulfurase / selenocysteine lyase
4 Sobic.002G064000 expressed protein -
5 Sobic.006G147300 -(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
6 Sobic.005G183400 resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G026700 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K09060: plant G-box-binding factor
8 Sobic.004G272600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.003G097800 - -
10 Sobic.008G038300 uncharacterized protein ycf53, putative, expressed -
11 Sobic.001G274600 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G068301 - K16189: phytochrome-interacting factor 4
13 Sobic.010G183032 - -
14 Sobic.001G068400 - -
15 Sobic.003G199800 expressed protein -
16 Sobic.010G108401 - -
17 Sobic.002G040100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
18 Sobic.010G183100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@agenet domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G034300 expressed protein -
20 Sobic.003G052500 Photosystem I reaction center subunit XI(PubMedID : 26186930)@Photosystem I subunit L(PubMedID : 29017446)@photosystem I reaction center subunit XI, chloroplast precursor, putative, expressed K02699: photosystem I subunit XI


Gene co-expression network
sample Sobic004G125200 Sobic004G125200 Sobic004G214900 Sobic004G214900 Sobic004G125200--Sobic004G214900 Sobic004G071800 Sobic004G071800 Sobic004G125200--Sobic004G071800 Sobic004G132600 Sobic004G132600 Sobic004G125200--Sobic004G132600 Sobic002G064000 Sobic002G064000 Sobic004G125200--Sobic002G064000 Sobic006G147300 Sobic006G147300 Sobic004G125200--Sobic006G147300 Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic004G125200--Sobic005G183400 Sobic004G026700 Sobic004G026700 Sobic004G125200--Sobic004G026700 Sobic004G272600 Sobic004G272600 Sobic004G125200--Sobic004G272600 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic004G125200--Sobic003G097800 Sobic004G214900--Sobic004G125200 Sobic004G214900--Sobic005G183400 Sobic004G118900 Sobic004G118900 Sobic004G214900--Sobic004G118900 Sobic009G244300 Sobic009G244300 Sobic004G214900--Sobic009G244300 Sobic007G034300 Sobic007G034300 Sobic004G214900--Sobic007G034300 Sobic001G068301 Sobic001G068301 Sobic004G214900--Sobic001G068301 Sobic004G214900--Sobic006G147300 Sobic003G231800 Sobic003G231800 Sobic004G214900--Sobic003G231800 Sobic004G214900--Sobic004G132600 Sobic001G274600 Sobic001G274600 Sobic004G071800--Sobic001G274600 Sobic003G209800 Sobic003G209800 Sobic004G071800--Sobic003G209800 Sobic004G071800--Sobic004G272600 Sobic003G052500 Sobic003G052500 Sobic004G071800--Sobic003G052500 Sobic008G038300 Sobic008G038300 Sobic004G071800--Sobic008G038300 Sobic006G073500 Sobic006G073500 Sobic004G071800--Sobic006G073500 Sobic004G071800--Sobic002G064000 Sobic002G033900 Sobic002G033900 Sobic004G071800--Sobic002G033900 Sobic001G070500 Sobic001G070500 Sobic004G071800--Sobic001G070500 Sobic004G132600--Sobic004G125200 Sobic004G132600--Sobic005G183400 Sobic009G029001 Sobic009G029001 Sobic004G132600--Sobic009G029001 Sobic004G132600--Sobic002G064000 Sobic004G132600--Sobic004G071800 Sobic004G132600--Sobic004G118900 Sobic004G132600--Sobic006G147300 Sobic004G343300 Sobic004G343300 Sobic004G132600--Sobic004G343300 Sobic004G132600--Sobic004G214900 Sobic002G064000--Sobic004G071800 Sobic002G064000--Sobic004G272600 Sobic002G064000--Sobic001G274600 Sobic002G064000--Sobic003G052500 Sobic002G064000--Sobic001G070500 Sobic002G064000--Sobic006G147300 Sobic002G064000--Sobic004G026700 Sobic001G463200 Sobic001G463200 Sobic002G064000--Sobic001G463200 Sobic002G064000--Sobic006G073500 Sobic007G207800 Sobic007G207800 Sobic006G147300--Sobic007G207800 Sobic008G066100 Sobic008G066100 Sobic006G147300--Sobic008G066100 Sobic003G359100 Sobic003G359100 Sobic006G147300--Sobic003G359100 Sobic002G030500 Sobic002G030500 Sobic006G147300--Sobic002G030500 Sobic004G035500 Sobic004G035500 Sobic006G147300--Sobic004G035500 Sobic002G098800 Sobic002G098800 Sobic006G147300--Sobic002G098800 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic006G147300--Sobic003G199800 Sobic006G147300--Sobic004G272600 Sobic003G435800 Sobic003G435800 Sobic006G147300--Sobic003G435800 Sobic005G183400--Sobic004G214900 Sobic002G211000 Sobic002G211000 Sobic005G183400--Sobic002G211000 Sobic005G183400--Sobic006G147300 Sobic005G183400--Sobic004G125200 Sobic006G272900 Sobic006G272900 Sobic005G183400--Sobic006G272900 Sobic005G183400--Sobic007G034300 Sobic007G071500 Sobic007G071500 Sobic005G183400--Sobic007G071500 Sobic005G183400--Sobic009G029001 Sobic004G051100 Sobic004G051100 Sobic005G183400--Sobic004G051100 Sobic002G000500 Sobic002G000500 Sobic004G026700--Sobic002G000500 Sobic004G026700--Sobic001G274600 Sobic001G361700 Sobic001G361700 Sobic004G026700--Sobic001G361700 Sobic002G040100 Sobic002G040100 Sobic004G026700--Sobic002G040100 Sobic006G011100 Sobic006G011100 Sobic004G026700--Sobic006G011100 Sobic004G026700--Sobic003G199800 Sobic004G035601 Sobic004G035601 Sobic004G026700--Sobic004G035601 Sobic004G026700--Sobic003G209800 Sobic001G338700 Sobic001G338700 Sobic004G026700--Sobic001G338700 Sobic004G272600--Sobic001G070500 Sobic010G189300 Sobic010G189300 Sobic004G272600--Sobic010G189300 Sobic004G272600--Sobic003G052500 Sobic004G272600--Sobic002G033900 Sobic004G272600--Sobic006G073500 Sobic004G272600--Sobic004G071800 Sobic004G235200 Sobic004G235200 Sobic004G272600--Sobic004G235200 Sobic008G015100 Sobic008G015100 Sobic004G272600--Sobic008G015100 Sobic009G229700 Sobic009G229700 Sobic004G272600--Sobic009G229700 Sobic005G015200 Sobic005G015200 Sobic003G097800--Sobic005G015200 Sobic005G118300 Sobic005G118300 Sobic003G097800--Sobic005G118300 Sobic005G217900 Sobic005G217900 Sobic003G097800--Sobic005G217900 Sobic004G210601 Sobic004G210601 Sobic003G097800--Sobic004G210601 Sobic005G065500 Sobic005G065500 Sobic003G097800--Sobic005G065500 Sobic005G167500 Sobic005G167500 Sobic003G097800--Sobic005G167500 Sobic003G058001 Sobic003G058001 Sobic003G097800--Sobic003G058001 Sobic009G202400 Sobic009G202400 Sobic003G097800--Sobic009G202400 Sobic003G097800--Sobic001G338700
Octagon: transcription factors


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