Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G183400.2
Synonym
Functional annotation resistance protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RJ96
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF402
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14850.1 : resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G214900 receptor kinase, putative, expressed -
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3 Sobic.006G147300 -(PubMedID : 26465154)@expressed protein -
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13 Sobic.002G030500 Reticulon family protein(PubMedID : 26465154)@reticulon domain containing protein, putative, expressed -
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19 Sobic.004G035500 -(PubMedID : 26976818)@Involved in photorespiratory pathway(PubMedID : 12887583)@dicarboxylate transporter 3(PubMedID : 27016024)@citrate transporter, putative, expressed K03319: divalent anion:Na+ symporter, DASS family
20 Sobic.008G134800 shikimate kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic004G214900 Sobic004G214900 Sobic005G183400--Sobic004G214900 Sobic002G211000 Sobic002G211000 Sobic005G183400--Sobic002G211000 Sobic006G147300 Sobic006G147300 Sobic005G183400--Sobic006G147300 Sobic004G125200 Sobic004G125200 Sobic005G183400--Sobic004G125200 Sobic006G272900 Sobic006G272900 Sobic005G183400--Sobic006G272900 Sobic007G034300 Sobic007G034300 Sobic005G183400--Sobic007G034300 Sobic007G071500 Sobic007G071500 Sobic005G183400--Sobic007G071500 Sobic009G029001 Sobic009G029001 Sobic005G183400--Sobic009G029001 Sobic004G051100 Sobic004G051100 Sobic005G183400--Sobic004G051100 Sobic004G214900--Sobic004G125200 Sobic004G214900--Sobic005G183400 Sobic004G118900 Sobic004G118900 Sobic004G214900--Sobic004G118900 Sobic009G244300 Sobic009G244300 Sobic004G214900--Sobic009G244300 Sobic004G214900--Sobic007G034300 Sobic001G068301 Sobic001G068301 Sobic004G214900--Sobic001G068301 Sobic004G214900--Sobic006G147300 Sobic003G231800 Sobic003G231800 Sobic004G214900--Sobic003G231800 Sobic004G132600 Sobic004G132600 Sobic004G214900--Sobic004G132600 Sobic002G211000--Sobic004G051100 Sobic002G211000--Sobic007G034300 Sobic010G245200 Sobic010G245200 Sobic002G211000--Sobic010G245200 Sobic007G053800 Sobic007G053800 Sobic002G211000--Sobic007G053800 Sobic001G517700 Sobic001G517700 Sobic002G211000--Sobic001G517700 Sobic008G053200 Sobic008G053200 Sobic002G211000--Sobic008G053200 Sobic002G211000--Sobic005G183400 Sobic006G188000 Sobic006G188000 Sobic002G211000--Sobic006G188000 Sobic005G165500 Sobic005G165500 Sobic002G211000--Sobic005G165500 Sobic007G207800 Sobic007G207800 Sobic006G147300--Sobic007G207800 Sobic008G066100 Sobic008G066100 Sobic006G147300--Sobic008G066100 Sobic003G359100 Sobic003G359100 Sobic006G147300--Sobic003G359100 Sobic002G030500 Sobic002G030500 Sobic006G147300--Sobic002G030500 Sobic004G035500 Sobic004G035500 Sobic006G147300--Sobic004G035500 Sobic002G098800 Sobic002G098800 Sobic006G147300--Sobic002G098800 Sobic003G199800 Sobic003G199800 Sobic006G147300--Sobic003G199800 Sobic004G272600 Sobic004G272600 Sobic006G147300--Sobic004G272600 Sobic003G435800 Sobic003G435800 Sobic006G147300--Sobic003G435800 Sobic004G125200--Sobic004G214900 Sobic004G071800 Sobic004G071800 Sobic004G125200--Sobic004G071800 Sobic004G125200--Sobic004G132600 Sobic002G064000 Sobic002G064000 Sobic004G125200--Sobic002G064000 Sobic004G125200--Sobic006G147300 Sobic004G125200--Sobic005G183400 Sobic004G026700 Sobic004G026700 Sobic004G125200--Sobic004G026700 Sobic004G125200--Sobic004G272600 Sobic003G097800 Sobic003G097800 Sobic004G125200--Sobic003G097800 Sobic008G021300 Sobic008G021300 Sobic006G272900--Sobic008G021300 Sobic009G043000 Sobic009G043000 Sobic006G272900--Sobic009G043000 Sobic010G005500 Sobic010G005500 Sobic006G272900--Sobic010G005500 Sobic003G002300 Sobic003G002300 Sobic006G272900--Sobic003G002300 Sobic002G152700 Sobic002G152700 Sobic006G272900--Sobic002G152700 Sobic010G201700 Sobic010G201700 Sobic006G272900--Sobic010G201700 Sobic003G387800 Sobic003G387800 Sobic006G272900--Sobic003G387800 Sobic007G004800 Sobic007G004800 Sobic006G272900--Sobic007G004800 Sobic001G102800 Sobic001G102800 Sobic006G272900--Sobic001G102800 Sobic001G520800 Sobic001G520800 Sobic007G034300--Sobic001G520800 Sobic007G034300--Sobic005G165500 Sobic007G034300--Sobic009G244300 Sobic007G034300--Sobic008G053200 Sobic004G283100 Sobic004G283100 Sobic007G034300--Sobic004G283100 Sobic008G104601 Sobic008G104601 Sobic007G034300--Sobic008G104601 Sobic002G233300 Sobic002G233300 Sobic007G034300--Sobic002G233300 Sobic007G034300--Sobic003G231800 Sobic004G305800 Sobic004G305800 Sobic007G034300--Sobic004G305800 Sobic009G143100 Sobic009G143100 Sobic007G071500--Sobic009G143100 Sobic006G105900 Sobic006G105900 Sobic007G071500--Sobic006G105900 Sobic004G249800 Sobic004G249800 Sobic007G071500--Sobic004G249800 Sobic004G343300 Sobic004G343300 Sobic007G071500--Sobic004G343300 Sobic002G316700 Sobic002G316700 Sobic007G071500--Sobic002G316700 Sobic008G134800 Sobic008G134800 Sobic007G071500--Sobic008G134800 Sobic007G071500--Sobic004G035500 Sobic003G052500 Sobic003G052500 Sobic007G071500--Sobic003G052500 Sobic001G177000 Sobic001G177000 Sobic007G071500--Sobic001G177000 Sobic009G029001--Sobic002G211000 Sobic009G029001--Sobic007G207800 Sobic009G029001--Sobic005G183400 Sobic001G242600 Sobic001G242600 Sobic009G029001--Sobic001G242600 Sobic004G227200 Sobic004G227200 Sobic009G029001--Sobic004G227200 Sobic007G223500 Sobic007G223500 Sobic009G029001--Sobic007G223500 Sobic009G029001--Sobic004G132600 Sobic009G029001--Sobic001G517700 Sobic009G029001--Sobic007G053800 Sobic004G051100--Sobic006G188000 Sobic004G051100--Sobic002G211000 Sobic004G051100--Sobic007G034300 Sobic004G051100--Sobic010G245200 Sobic005G202500 Sobic005G202500 Sobic004G051100--Sobic005G202500 Sobic004G051100--Sobic001G517700 Sobic002G370600 Sobic002G370600 Sobic004G051100--Sobic002G370600 Sobic004G051100--Sobic004G283100 Sobic004G051100--Sobic007G053800
Octagon: transcription factors


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