Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G304550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RPT5
Pfam PF14555
Panther DB PTHR23322 PTHR23322:SF30
NCBI CDD KOG1364; Predicted ubiquitin regulatory protein, contains UAS and UBX domains
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14570 : UBX domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g42800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032116
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G164500 protein kinase domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G024300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.001G148000 a WRKY transcription factor which regulates cell wall biosynthesis genes. Seed shattering-related gene.(PubMedID : 24019506)@WRKY60, expressed -
4 Sobic.002G413100 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G224900 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
6 Sobic.005G093901 - -
7 Sobic.004G269300 - -
8 Sobic.003G358100 O-fucosyltransferase family protein(PubMedID : 26465154)@growth regulator related protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G268500 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
10 Sobic.006G057050 - -
11 Sobic.004G337850 - -
12 Sobic.002G249700 OsWAK80 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
13 Sobic.003G401300 - -
14 Sobic.009G148950 - -
15 Sobic.001G138100 - -
16 Sobic.003G172701 - -
17 Sobic.010G091100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytokinin-O-glucosyltransferase 3, putative, expressed -
18 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
19 Sobic.001G022700 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.001G472050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G304550 Sobic004G304550 Sobic006G164500 Sobic006G164500 Sobic004G304550--Sobic006G164500 Sobic002G024300 Sobic002G024300 Sobic004G304550--Sobic002G024300 Sobic001G148000 Sobic001G148000 Sobic004G304550--Sobic001G148000 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic004G304550--Sobic002G413100 Sobic002G224900 Sobic002G224900 Sobic004G304550--Sobic002G224900 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic004G304550--Sobic005G093901 Sobic004G269300 Sobic004G269300 Sobic004G304550--Sobic004G269300 Sobic003G358100 Sobic003G358100 Sobic004G304550--Sobic003G358100 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic004G304550--Sobic010G268500 Sobic006G164500--Sobic003G358100 Sobic006G164500--Sobic002G024300 Sobic003G097000 Sobic003G097000 Sobic006G164500--Sobic003G097000 Sobic006G164500--Sobic004G304550 Sobic006G272000 Sobic006G272000 Sobic006G164500--Sobic006G272000 Sobic010G091100 Sobic010G091100 Sobic006G164500--Sobic010G091100 Sobic002G249700 Sobic002G249700 Sobic006G164500--Sobic002G249700 Sobic006G164500--Sobic002G224900 Sobic006G233800 Sobic006G233800 Sobic006G164500--Sobic006G233800 Sobic002G024300--Sobic010G091100 Sobic002G024300--Sobic006G164500 Sobic003G366700 Sobic003G366700 Sobic002G024300--Sobic003G366700 Sobic003G183000 Sobic003G183000 Sobic002G024300--Sobic003G183000 Sobic002G024300--Sobic002G249700 Sobic002G024300--Sobic004G304550 Sobic002G024300--Sobic006G233800 Sobic001G535500 Sobic001G535500 Sobic002G024300--Sobic001G535500 Sobic004G268600 Sobic004G268600 Sobic002G024300--Sobic004G268600 Sobic001G148000--Sobic002G413100 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic001G148000--Sobic004G176950 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic001G148000--Sobic002G245700 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic001G148000--Sobic001G450900 Sobic001G148000--Sobic005G093901 Sobic001G148000--Sobic010G268500 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic001G148000--Sobic001G022700 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G148000--Sobic002G423901 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic001G148000--Sobic002G220400 Sobic002G413100--Sobic005G093901 Sobic002G413100--Sobic010G268500 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic002G413100--Sobic003G117850 Sobic002G413100--Sobic001G022700 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic002G413100--Sobic009G148950 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic002G413100--Sobic003G172701 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic002G413100--Sobic002G270733 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic002G413100--Sobic006G057050 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic002G413100--Sobic007G109200 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic002G224900--Sobic001G489550 Sobic002G224900--Sobic002G423901 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic002G224900--Sobic010G008433 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic002G224900--Sobic007G223250 Sobic002G224900--Sobic005G093901 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic002G224900--Sobic004G320900 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic002G224900--Sobic001G472050 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic002G224900--Sobic002G288700 Sobic010G102700 Sobic010G102700 Sobic002G224900--Sobic010G102700 Sobic005G093901--Sobic002G413100 Sobic005G093901--Sobic009G148950 Sobic005G093901--Sobic003G172701 Sobic005G093901--Sobic007G109200 Sobic005G093901--Sobic002G270733 Sobic005G093901--Sobic003G117850 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic005G093901--Sobic004G087000 Sobic005G093901--Sobic006G057050 Sobic005G093901--Sobic001G022700 Sobic010G238000 Sobic010G238000 Sobic004G269300--Sobic010G238000 Sobic008G025000 Sobic008G025000 Sobic004G269300--Sobic008G025000 Sobic002G033550 Sobic002G033550 Sobic004G269300--Sobic002G033550 Sobic008G068700 Sobic008G068700 Sobic004G269300--Sobic008G068700 Sobic002G000900 Sobic002G000900 Sobic004G269300--Sobic002G000900 Sobic004G269300--Sobic002G245700 Sobic009G106601 Sobic009G106601 Sobic004G269300--Sobic009G106601 Sobic004G269300--Sobic004G176950 Sobic004G269300--Sobic001G472050 Sobic003G358100--Sobic003G097000 Sobic003G358100--Sobic006G164500 Sobic004G098100 Sobic004G098100 Sobic003G358100--Sobic004G098100 Sobic003G358100--Sobic002G249700 Sobic003G172300 Sobic003G172300 Sobic003G358100--Sobic003G172300 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic003G358100--Sobic007G145801 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic003G358100--Sobic006G016950 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic003G358100--Sobic001G502801 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic003G358100--Sobic005G139750 Sobic010G268500--Sobic001G022700 Sobic010G268500--Sobic002G413100 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic010G268500--Sobic005G104900 Sobic010G268500--Sobic005G139750 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic010G268500--Sobic003G161900 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic010G268500--Sobic004G077700 Sobic010G268500--Sobic005G093901 Sobic010G268500--Sobic007G145801 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic010G268500--Sobic003G173116
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.