Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G352700.2,Sobic.004G352700.1
Synonym Sb04g037940
Functional annotation methionine adenosyltransferase regulatory beta subunit-related, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RQP2 , C5XWM0
Pfam PF01370
Panther DB PTHR10491 PTHR10491:SF7
NCBI CDD KOG1429; dTDP-glucose 4-6-dehydratase/UDP-glucuronic acid decarboxylase KOG0747Putative NAD+-dependent epimerases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00560 : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57990.1 : methionine adenosyltransferase regulatory beta subunit-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022647
Brachypodium KQK01480 , PNT69473
Barley HORVU6Hr1G093310.4 , HORVU6Hr1G093310.5 , HORVU6Hr1G093310.1 , HORVU6Hr1G093310.2 , HORVU6Hr1G093310.3
Wheat TraesCS6D02G392800 , TraesCS6A02G409200 , TraesCS6B02G455100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G352700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G352700 Sobic004G352700 Sobic001G251500 Sobic001G251500 Sobic004G352700--Sobic001G251500 Sobic002G196900 Sobic002G196900 Sobic004G352700--Sobic002G196900 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic004G352700--Sobic002G208900 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic004G352700--Sobic007G081400 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic004G352700--Sobic001G093732 Sobic004G273500 Sobic004G273500 Sobic004G352700--Sobic004G273500 Sobic005G031100 Sobic005G031100 Sobic004G352700--Sobic005G031100 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic004G352700--Sobic010G217001 Sobic006G008500 Sobic006G008500 Sobic004G352700--Sobic006G008500 Sobic001G251500--Sobic004G352700 Sobic002G176900 Sobic002G176900 Sobic001G251500--Sobic002G176900 Sobic001G251500--Sobic010G217001 Sobic009G027550 Sobic009G027550 Sobic001G251500--Sobic009G027550 Sobic001G492900 Sobic001G492900 Sobic001G251500--Sobic001G492900 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic001G251500--Sobic002G231400 Sobic004G306700 Sobic004G306700 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Octagon: transcription factors


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