Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G010200.2,Sobic.001G010200.1
Synonym Sb01g001000
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S4C0 , A0A1Z5S3U4
Pfam -
Panther DB PTHR33916 PTHR33916:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G47010 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g19030.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a009058
Brachypodium PNT62738 , PNT62739 , KQJ86775
Barley HORVU4Hr1G066750.10 , HORVU4Hr1G066750.8 , HORVU4Hr1G066750.9 , HORVU4Hr1G066750.2 , HORVU4Hr1G066750.3 , HORVU4Hr1G066750.1 , HORVU4Hr1G066750.6 , HORVU4Hr1G066750.7 , HORVU4Hr1G066750.4 , HORVU4Hr1G066750.5
Wheat TraesCS4B02G240500 , TraesCS4A02G063500 , TraesCS4D02G240300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G002500 OsFBT12 - F-box and tubby domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G533900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
3 Sobic.001G052700 vacuolar protein sorting-associated protein 35, putative, expressed K18468: vacuolar protein sorting-associated protein 35
4 Sobic.005G228650 - -
5 Sobic.010G012200 - K00851: E2.7.1.12, gntK, gluconokinase
6 Sobic.004G315400 cation efflux family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G068600 cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
8 Sobic.008G103400 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G170800 OsWAK126 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
10 Sobic.001G483001 - -
11 Sobic.001G520000 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
12 Sobic.010G000200 expressed protein -
13 Sobic.010G042300 DTA2, putative, expressed -
14 Sobic.009G026600 - -
15 Sobic.006G279100 Positive regulator of ABA(PubMedID : 30367619)@CAMK_CAMK_like.28 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
16 Sobic.006G213350 - -
17 Sobic.008G160100 - -
18 Sobic.001G109400 glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
19 Sobic.006G136300 - -
20 Sobic.003G063400 glycosyltransferase family 43 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G010200 Sobic001G010200 Sobic007G002500 Sobic007G002500 Sobic001G010200--Sobic007G002500 Sobic001G533900 Sobic001G533900 Sobic001G010200--Sobic001G533900 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic001G010200--Sobic001G052700 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic001G010200--Sobic005G228650 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G010200--Sobic010G012200 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic001G010200--Sobic004G315400 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic001G010200--Sobic004G068600 Sobic008G103400 Sobic008G103400 Sobic001G010200--Sobic008G103400 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G010200--Sobic008G170800 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic007G002500--Sobic001G001800 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic007G002500--Sobic001G038700 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic007G002500--Sobic002G206900 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic007G002500--Sobic004G127600 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic007G002500--Sobic009G186300 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic007G002500--Sobic006G157450 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic007G002500--Sobic001G370800 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic007G002500--Sobic006G249600 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic007G002500--Sobic009G094200 Sobic001G533900--Sobic010G012200 Sobic001G533900--Sobic008G103400 Sobic001G533900--Sobic008G170800 Sobic001G533900--Sobic004G315400 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic001G533900--Sobic001G483001 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic001G533900--Sobic006G213350 Sobic005G048800 Sobic005G048800 Sobic001G533900--Sobic005G048800 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic001G533900--Sobic001G520000 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G533900--Sobic006G279100 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic001G052700--Sobic006G136300 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic001G052700--Sobic004G267400 Sobic001G052700--Sobic004G315400 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic001G052700--Sobic006G221500 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic001G052700--Sobic002G374000 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G052700--Sobic004G072201 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic001G052700--Sobic001G383200 Sobic001G052700--Sobic004G068600 Sobic001G052700--Sobic005G228650 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic005G228650--Sobic008G160100 Sobic005G228650--Sobic006G157450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic005G228650--Sobic001G245100 Sobic005G228650--Sobic006G279100 Sobic005G228650--Sobic001G483001 Sobic005G228650--Sobic001G038700 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic005G228650--Sobic010G042300 Sobic005G228650--Sobic004G072201 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic005G228650--Sobic001G109400 Sobic010G012200--Sobic001G520000 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic010G012200--Sobic003G155000 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic003G253700 Sobic010G012200--Sobic001G038700 Sobic010G012200--Sobic008G170800 Sobic010G012200--Sobic006G157450 Sobic010G000200 Sobic010G000200 Sobic010G012200--Sobic010G000200 Sobic010G012200--Sobic004G315400 Sobic010G012200--Sobic008G103400 Sobic004G315400--Sobic002G374000 Sobic004G315400--Sobic010G012200 Sobic004G315400--Sobic001G109400 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic004G315400--Sobic001G212900 Sobic004G315400--Sobic008G103400 Sobic004G315400--Sobic001G483001 Sobic004G315400--Sobic004G072201 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic004G315400--Sobic005G031400 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic004G315400--Sobic002G110600 Sobic010G019500 Sobic010G019500 Sobic004G068600--Sobic010G019500 Sobic004G068600--Sobic004G267400 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G068600--Sobic007G183600 Sobic004G068600--Sobic004G315400 Sobic004G068600--Sobic004G072201 Sobic004G068600--Sobic002G374000 Sobic004G068600--Sobic008G103400 Sobic004G068600--Sobic001G383200 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic004G068600--Sobic001G424650 Sobic008G103400--Sobic002G110600 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic008G103400--Sobic004G181000 Sobic008G192900 Sobic008G192900 Sobic008G103400--Sobic008G192900 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic008G103400--Sobic003G362800 Sobic008G103400--Sobic010G012200 Sobic002G001500 Sobic002G001500 Sobic008G103400--Sobic002G001500 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic008G103400--Sobic009G223900 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic008G103400--Sobic008G016800 Sobic008G103400--Sobic004G315400 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic008G170800--Sobic001G090700 Sobic008G170800--Sobic006G157450 Sobic008G170800--Sobic001G038700 Sobic008G170800--Sobic010G012200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic008G170800--Sobic008G190600 Sobic008G170800--Sobic003G155000 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic008G170800--Sobic001G454600 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic008G170800--Sobic008G142200 Sobic008G170800--Sobic003G253700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.