Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G030700.1
Synonym
Functional annotation MATH domain containing protein, expressed
UniProt C5Y4H2
Pfam PF00917
Panther DB -
NCBI CDD KOG1987; Speckle-type POZ protein SPOP and related proteins with TRAF, MATH and BTB/POZ domains
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17380 : TRAF-like family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g33830.1 : MATH domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G228400 lipase-related, putative, expressed -
2 Sobic.004G218300 Zinc finger, ZZ type domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G228201 - -
4 Sobic.002G147100 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed -
5 Sobic.004G259300 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type domain containing protein, expressed K15687: E3 ubiquitin-protein ligase makorin
6 Sobic.003G289100 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.007G147400 - -
8 Sobic.002G203600 protein binding protein, putative, expressed K11975: E3 ubiquitin-protein ligase RNF144
9 Sobic.001G521700 - -
10 Sobic.006G130200 expressed protein -
11 Sobic.010G278500 expressed protein -
12 Sobic.008G042600 N-acetylglucosaminyltransferase I, putative, expressed K00726: alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase
13 Sobic.010G035801 - -
14 Sobic.002G317400 expressed protein -
15 Sobic.001G152320 - -
16 Sobic.003G091600 expressed protein -
17 Sobic.003G398400 expressed protein -
18 Sobic.003G250400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G192400 zinc ion binding protein, putative, expressed K15196: BRF1, transcription factor IIIB 90 kDa subunit
20 Sobic.001G425000 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K06269: serine/threonine-protein phosphatase PP1 catalytic subunit


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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