Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G099100.4,Sobic.005G099100.5,Sobic.005G099100.2,Sobic.005G099100.3
Synonym UBQ10
Functional annotation ubiquitin family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PRB3
Pfam PF00240
Panther DB PTHR10666
NCBI CDD KOG0001; Ubiquitin and ubiquitin-like proteins
KEGG Orthology K08770; ubiquitin C
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G05320 : polyubiquitin 10
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g46770.1,LOC_Os06g46770.2 : ubiquitin family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029682
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G379000 OsMADS2 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant


Gene co-expression network
sample Sobic005G099100 Sobic005G099100 Sobic007G133100 Sobic007G133100 Sobic005G099100--Sobic007G133100 Sobic002G188300 Sobic002G188300 Sobic005G099100--Sobic002G188300 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic005G099100--Sobic008G030501 Sobic006G256400 Sobic006G256400 Sobic005G099100--Sobic006G256400 Sobic006G189300 Sobic006G189300 Sobic005G099100--Sobic006G189300 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic005G099100--Sobic005G185750 Sobic009G095640 Sobic009G095640 Sobic005G099100--Sobic009G095640 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic005G099100--Sobic006G170500 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic005G099100--Sobic008G168932 Sobic007G133100--Sobic009G095640 Sobic007G133100--Sobic005G185750 Sobic007G133100--Sobic008G168932 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic007G133100--Sobic005G068500 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic007G133100--Sobic004G289900 Sobic001G103500 Sobic001G103500 Sobic007G133100--Sobic001G103500 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic007G133100--Sobic008G181900 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic007G133100--Sobic001G513400 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic007G133100--Sobic006G044800 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic002G188300--Sobic001G538425 Sobic005G016200 Sobic005G016200 Sobic002G188300--Sobic005G016200 Sobic002G188300--Sobic006G170500 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic002G188300--Sobic007G198900 Sobic008G155000 Sobic008G155000 Sobic002G188300--Sobic008G155000 Sobic004G057300 Sobic004G057300 Sobic002G188300--Sobic004G057300 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G188300--Sobic007G081100 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic002G188300--Sobic004G003300 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G188300--Sobic003G191200 Sobic008G030501--Sobic006G170500 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic008G030501--Sobic008G029800 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic008G030501--Sobic007G082300 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic008G030501--Sobic010G196700 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic008G030501--Sobic009G060100 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic008G030501--Sobic001G364300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic008G030501--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G030501--Sobic004G086900 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G030501--Sobic007G110800 Sobic005G201400 Sobic005G201400 Sobic006G256400--Sobic005G201400 Sobic007G193600 Sobic007G193600 Sobic006G256400--Sobic007G193600 Sobic001G241700 Sobic001G241700 Sobic006G256400--Sobic001G241700 Sobic006G256400--Sobic002G188300 Sobic005G006900 Sobic005G006900 Sobic006G256400--Sobic005G006900 Sobic006G256400--Sobic008G155000 Sobic006G256400--Sobic007G133100 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic006G256400--Sobic010G202400 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic006G256400--Sobic004G002700 Sobic002G308900 Sobic002G308900 Sobic006G189300--Sobic002G308900 Sobic001G227000 Sobic001G227000 Sobic006G189300--Sobic001G227000 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic006G189300--Sobic002G404600 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic006G189300--Sobic001G039100 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic006G189300--Sobic002G381500 Sobic007G007700 Sobic007G007700 Sobic006G189300--Sobic007G007700 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic006G189300--Sobic006G204500 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic006G189300--Sobic007G204200 Sobic006G189300--Sobic001G538425 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic009G095640--Sobic005G054501 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic009G095640--Sobic010G257700 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G095640--Sobic002G165900 Sobic009G095640--Sobic007G133100 Sobic010G246132 Sobic010G246132 Sobic009G095640--Sobic010G246132 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic009G095640--Sobic009G089800 Sobic006G244100 Sobic006G244100 Sobic009G095640--Sobic006G244100 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic009G095640--Sobic003G379100 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic009G095640--Sobic003G193600 Sobic006G170500--Sobic007G110800 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic006G170500--Sobic006G224400 Sobic006G170500--Sobic004G086900 Sobic006G170500--Sobic007G082300 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic006G170500--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic006G170500--Sobic007G167950 Sobic006G170500--Sobic001G364300 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic006G170500--Sobic008G177001 Sobic006G170500--Sobic005G058200 Sobic008G168932--Sobic004G289900 Sobic008G168932--Sobic005G185750 Sobic008G168932--Sobic005G068500 Sobic008G168932--Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G181900 Sobic008G168932--Sobic004G024800 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic006G044800 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic008G168932--Sobic004G222400
Octagon: transcription factors


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