Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G189300.1
Synonym Sb06g026280, SCE1A, ATSCE1, EMB1637, SCE1, AHUS5
Functional annotation ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed
UniProt C5YEH6
Pfam PF00179
Panther DB PTHR24067 PTHR24067:SF110
NCBI CDD KOG0424; Ubiquitin-protein ligase
KEGG Orthology K10577; UBE2I, ubiquitin-conjugating enzyme E2 I
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57870 : sumo conjugation enzyme 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49130.1 : ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010084 , Zm00025a010085
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G308900 ubiquitin fusion protein, putative, expressed K02927: RP-L40e, RPL40, ubiquitin-large subunit ribosomal protein L40e
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20 Sobic.002G125100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G189300 Sobic006G189300 Sobic002G308900 Sobic002G308900 Sobic006G189300--Sobic002G308900 Sobic001G227000 Sobic001G227000 Sobic006G189300--Sobic001G227000 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic006G189300--Sobic002G404600 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic006G189300--Sobic001G039100 Sobic002G381500 Sobic002G381500 Sobic006G189300--Sobic002G381500 Sobic007G007700 Sobic007G007700 Sobic006G189300--Sobic007G007700 Sobic006G204500 Sobic006G204500 Sobic006G189300--Sobic006G204500 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic006G189300--Sobic007G204200 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic006G189300--Sobic001G538425 Sobic002G308900--Sobic001G227000 Sobic002G308900--Sobic001G039100 Sobic002G308900--Sobic002G404600 Sobic002G308900--Sobic006G189300 Sobic002G308900--Sobic002G381500 Sobic002G308900--Sobic007G204200 Sobic002G308900--Sobic007G007700 Sobic009G110600 Sobic009G110600 Sobic002G308900--Sobic009G110600 Sobic006G272400 Sobic006G272400 Sobic002G308900--Sobic006G272400 Sobic001G227000--Sobic002G308900 Sobic001G227000--Sobic006G189300 Sobic001G227000--Sobic002G381500 Sobic001G227000--Sobic002G404600 Sobic001G227000--Sobic001G538425 Sobic001G227000--Sobic001G039100 Sobic006G170500 Sobic006G170500 Sobic001G227000--Sobic006G170500 Sobic001G227000--Sobic007G204200 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic001G227000--Sobic007G081100 Sobic002G404600--Sobic007G204200 Sobic004G290500 Sobic004G290500 Sobic002G404600--Sobic004G290500 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic002G404600--Sobic001G089400 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic002G404600--Sobic005G037700 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic002G404600--Sobic004G192600 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic002G404600--Sobic003G004000 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic002G404600--Sobic007G197000 Sobic002G404600--Sobic002G381500 Sobic002G380300 Sobic002G380300 Sobic002G404600--Sobic002G380300 Sobic001G039100--Sobic002G404600 Sobic007G196700 Sobic007G196700 Sobic001G039100--Sobic007G196700 Sobic001G039100--Sobic002G381500 Sobic001G039100--Sobic002G308900 Sobic001G039100--Sobic009G110600 Sobic006G105100 Sobic006G105100 Sobic001G039100--Sobic006G105100 Sobic001G039100--Sobic002G380300 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic001G039100--Sobic001G414650 Sobic001G039100--Sobic004G290500 Sobic002G381500--Sobic002G404600 Sobic002G381500--Sobic007G204200 Sobic002G381500--Sobic007G197000 Sobic002G381500--Sobic005G037700 Sobic002G381500--Sobic009G110600 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic002G381500--Sobic010G121700 Sobic002G381500--Sobic004G192600 Sobic002G381500--Sobic003G004000 Sobic002G381500--Sobic001G089400 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic007G007700--Sobic003G420500 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic007G007700--Sobic002G279900 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic007G007700--Sobic001G135950 Sobic007G007700--Sobic005G037700 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic007G007700--Sobic001G525600 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic007G007700--Sobic010G001200 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic007G007700--Sobic002G125100 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic007G007700--Sobic004G099200 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic007G007700--Sobic005G145400 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic006G204500--Sobic009G061601 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic006G204500--Sobic004G273600 Sobic008G020800 Sobic008G020800 Sobic006G204500--Sobic008G020800 Sobic001G402900 Sobic001G402900 Sobic006G204500--Sobic001G402900 Sobic010G003200 Sobic010G003200 Sobic006G204500--Sobic010G003200 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic006G204500--Sobic002G372000 Sobic006G204500--Sobic007G197000 Sobic002G364700 Sobic002G364700 Sobic006G204500--Sobic002G364700 Sobic004G014200 Sobic004G014200 Sobic006G204500--Sobic004G014200 Sobic007G204200--Sobic005G037700 Sobic007G204200--Sobic004G192600 Sobic008G074100 Sobic008G074100 Sobic007G204200--Sobic008G074100 Sobic007G204200--Sobic001G089400 Sobic007G204200--Sobic003G004000 Sobic007G204200--Sobic007G197000 Sobic007G204200--Sobic003G420500 Sobic007G204200--Sobic010G121700 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic007G204200--Sobic003G070400 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic001G538425--Sobic007G031200 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic001G538425--Sobic003G191200 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic001G538425--Sobic007G198900 Sobic001G538425--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic007G082100 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic001G538425--Sobic005G058600 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic001G538425--Sobic002G204500 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic001G538425--Sobic004G100300 Sobic001G538425--Sobic003G070400
Octagon: transcription factors


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